Entamoeba histolytica: EHI_125350
Help
Entry
EHI_125350 CDS
T00238
Symbol
73.t00023
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase III largest subunit
KO
K03018
DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
ehi
Entamoeba histolytica
Pathway
ehi03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ehi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
EHI_125350 (73.t00023)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
ehi03021
]
EHI_125350 (73.t00023)
Enzymes [BR:
ehi01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
EHI_125350 (73.t00023)
Transcription machinery [BR:
ehi03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase III system
RNA polymerase III
Core subunits
EHI_125350 (73.t00023)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
CcmS
Mab-21
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3408067
NCBI-ProteinID:
XP_653748
UniProt:
C4M626
LinkDB
All DBs
AA seq
1379 aa
AA seq
DB search
MSKGKTRQFKGVGKIEIDKENIEFVGPSERPGKVCDIQFTMFSQEEMNRESEFEVTEHFL
FQPNTRKPNPNGVLDRRLGVCDSLSVCETCGKRIEECSGHFAVINLELPVFHIGFFRPII
QVLQCVCKNCNRILLTNEERDFYLRRMRNKKTDTVARTYLVRALIAQCRKHYNSCPHCNA
INGSIKKYGNLRLVHDKYHRDPTITEMNEFYDGFEESIKLDKDINAFINNAQEDLDPRKV
LSIFRSLIREDIETMDFDPDNAPPENMILTSVPVPPIAIRPSVAMDGGNASNEDDLTTQL
KEIMECNDRIKEMIKRGASPYQYYDSWDQLTVAVSMFINSELPGCDDKGKPLRAICQRLK
GKHGRFRGNLLGKRVDFSGRTVISPDPNLDIEQIGVPKLMAVKLTYPERVTKHNIDKLRQ
LVINGSNNYPGCNSIIGGSDGLRRSMCIKLEMREKFAKDLKIGDIVERHLEDNDIVLFNR
QPSLHRISIMCHRAKILPWRTLRFNECVCTPYNADFDGDEMNLHVPQTEEARAECLMLMH
SAKNLQTPRTGQMIIAETQDFLTTSYLLTSKDFVIEEEDMMQWACWFHNAGTEIDLPTPA
YLKPKKLWTGKQLYGLALKPNKHEGVNISLDVPSKLYSKEGKWMCVKDGWICFKNSQLLS
GQIEKSIIGSGNKTGLFHLILRDYGTLESAKIMAHISRFCARFLGDYGFSIGISDVTPSA
DLTQMKEELVSEGYKKCDQFIEDYKSGKQEVQAGSTPEQTLEALLNNELSQIRERAGKRC
IEELKSDNSPLVMALSGSKGSVINISQMIACVGQQTVNGGRVSDGFISRSLPHFALHSRT
PQAKGFVKNSFFTGLNATEFFFHTMGGREGLVDSAVKTAETGYMQRRLMKALEDLHVHYD
GTVRSASLTVIEFKYGDDGLDPLKVESDKYPINLESVLSNLQQNQKPDDEYITPESFDKE
YNAIISQTKIVSELWKQQIETFLKEKKEEMTEIYNHYNQENAQHGLCGITIQTLKDFISI
CHEKGLRSVCEAGTPVGALAGQSMGEPSTQMVLKTFHFAGVASMNIALGVPRIKEIINAS
KKIQTPIVTAKLVNSQDVTSARIVKGRIEATRLKEIAKSVKIVFKPAEAYISVKLDFETI
KQLELECTIEKVQDVLLNYRGLKLKDNQVIIRNKQKLRVYVDKSSTSLLFALNSLRNQLL
EVIVCGIENTGRAVINKNKGSFELLVEGSELLKVMGTPGVIGEETTSNHIAVVEKVLGIE
AARSTIISEIKNVMDAYGLSIDVRHLLLLSDLMTFKGVILGITRYGISKMKDSVFTFASF
ERTNDHLFDAAVHSRKDEIKGVSESIIVGNQVGLGTGLMQILYDPPKPIFLQRKYDPLF
NT seq
4140 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaaaggaaaaacacgtcaatttaagggtgttggaaagattgaaattgataaagaa
aatattgaatttgttggtccatcagaaagacctggtaaagtatgtgatattcaatttact
atgtttagtcaagaagaaatgaatcgagaaagtgaatttgaagttactgaacattttttg
tttcaaccaaatacaagaaaaccaaatcctaatggtgttcttgatagaagactaggtgtt
tgtgattcattaagtgtttgtgaaacatgtggtaaaaggatagaagaatgtagtggacat
tttgctgtaattaatttagaattaccagtatttcatattggattctttagaccaattatt
caagtattacaatgtgtttgtaaaaattgtaatagaattcttttaactaatgaagaacgt
gatttctatttaagaagaatgagaaataaaaaaacagatactgttgcacgtacttatctt
gtaagagcattaattgcacaatgtagaaaacattataatagttgtcctcattgtaatgct
attaatggaagtattaaaaaatatggtaatttaagacttgttcatgataaatatcataga
gatcctactattactgaaatgaatgaattttatgatggatttgaagaatcaattaaactt
gataaagatattaatgcatttattaataatgcacaagaagaccttgatccaagaaaagtt
ctttcaatattcagaagtcttataagagaagatatagaaacaatggactttgacccagat
aatgcaccaccagagaatatgattttaacttctgttcctgttcctcctattgctattaga
ccatctgttgctatggatggtggaaatgcttcaaatgaagatgacttaacaacacaatta
aaagaaattatggaatgtaatgatagaattaaagaaatgattaagagaggagcttcacca
tatcaatattatgattcatgggatcaattaacagttgcagtatcaatgtttattaactct
gaattaccaggttgtgatgataaaggaaaaccattaagagcaatatgtcaaagattaaaa
ggaaaacatggtagatttagaggaaatttgttgggtaaaagggttgacttttctggaaga
acagttatttcccctgatcctaacttggacatagaacaaattggagttcctaaattaatg
gcagtaaaattaacatatccagaaagagtaactaaacataatattgataaattaagacaa
ttagtcattaatgggtctaataattatccaggatgtaatagtattattggtggttctgat
ggactaagaagatctatgtgtattaaattagaaatgagagaaaagtttgctaaagattta
aaaattggtgatattgttgaaagacatttagaagataatgatattgtattattcaacaga
caaccttcattgcatagaattagtattatgtgtcatagagcaaaaattcttccatggaga
actttacgttttaatgaatgtgtatgtactccatataatgcagattttgatggagatgaa
atgaatttacatgtgccacaaacagaagaagcaagagctgaatgtttaatgttaatgcat
tcagcaaagaatcttcaaacaccaagaactggtcaaatgattattgcagaaacacaagat
tttcttactacatcatatcttcttacaagtaaagattttgttattgaagaagaagatatg
atgcaatgggcatgttggttccataatgcaggaacagaaattgatcttccaacaccagca
tatttaaaaccaaaaaaattatggactggaaaacaattgtatgggttagcattaaaacca
aataaacatgaaggagttaatatttcattagatgtaccaagtaaattgtatagtaaagaa
ggaaaatggatgtgtgttaaagatggatggatttgttttaagaatagtcaattattaagt
ggtcaaatagaaaaatcaattattgggtctggtaataaaactggattattccatttaatt
ttaagagactatggaacattagaaagtgctaaaattatggcacatatctcaagattttgt
gcaaggtttcttggagattatggattttctattggaatatcagatgttacaccatctgca
gatttaactcaaatgaaagaagaattagtaagtgaaggatataaaaaatgtgatcaattt
attgaagattacaaaagtggtaaacaagaagttcaagctggttcaacaccagaacaaaca
ttagaggcattactaaataatgaattatctcaaatcagagaaagagctggtaaaagatgt
attgaagaattaaaatctgataactctccattagttatggcattgtctggaagtaaaggg
tctgttattaatatctctcaaatgattgcatgtgttggacaacaaacagtgaatggtgga
agagtttccgatggttttatttcacgttctttacctcattttgcattacattcaagaacc
ccacaggcaaaaggatttgtaaaaaattcattctttacaggattaaatgctacagaattt
ttcttccatactatgggtggtagagaaggattagtagattctgctgtaaagactgcagaa
actggttatatgcaaagaagattaatgaaagcattagaagatttacatgttcattatgat
ggaacagttagaagtgcatcattaacagttattgaatttaagtatggagatgatggatta
gatccattaaaagtagaaagtgataaatatccaattaatttggaatctgttttatctaat
ttacaacaaaaccaaaaaccagatgatgaatatattacaccagaaagttttgataaagaa
tataatgcaataattagtcaaacaaaaattgtttcagaattatggaaacaacaaatagaa
acatttttaaaagagaaaaaagaagaaatgacagagatttataatcattataaccaagaa
aatgctcaacatggattatgtggaattactatccaaacattaaaagattttatttctatt
tgtcacgaaaaaggtctcagaagtgtttgtgaagctggcacacctgttggtgcattggct
ggacaatctatgggtgaaccatcaacacaaatggtgttaaagacattccactttgcaggt
gtagcgtcaatgaatattgctcttggtgtaccacgtattaaagaaattattaatgcaagt
aaaaaaattcaaacaccaattgttactgccaaattagttaattcacaagatgtaacatca
gcaagaattgttaaaggaaggattgaagctactcgattaaaagaaattgctaaatcagtt
aaaattgtatttaaaccagctgaagcatatatatcagtaaaattagactttgaaacaatt
aaacaattagaattagaatgtactattgaaaaagttcaagatgtgttattaaattatcgt
gggttaaaattaaaagataaccaagttattataagaaataaacaaaagttaagagtttat
gtagataaatcaagtacttcattgttatttgcattgaattcattaagaaatcaattatta
gaagttattgtttgtggaattgaaaatactggtagagctgttattaataaaaataaaggt
tcatttgaattattagttgaaggaagtgaattattaaaagtaatgggtactccgggagta
attggagaagaaactacatctaaccatattgctgttgtagaaaaagtacttggtattgaa
gctgctagaagtactattatttcagaaattaaaaatgttatggatgcatatggtttatct
attgatgtaagacatttgttattattgtctgatttaatgacatttaaaggagttatatta
ggaattacaagatatggtatttctaaaatgaaagattctgtatttacttttgcttcattt
gaacgtacaaatgatcatttgtttgatgctgctgttcattctagaaaggatgaaattaaa
ggggtttctgaaagtattattgttggtaatcaagtaggtcttggaactggattaatgcag
atcctctatgacccaccaaaaccaattttcttacaaaggaaatatgacccacttttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
