Escherichia coli O18 K1 H7 IHE3034 (ExPEC): ECOK1_0301
Help
Entry
ECOK1_0301 CDS
T01997
Name
(GenBank) putative outer membrane autotransporter
Organism
eih
Escherichia coli O18:K1:H7 IHE3034 (ExPEC)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
DUF5633
DUF8524
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADE91670
LinkDB
All DBs
Position
complement(334797..337094)
Genome browser
AA seq
765 aa
AA seq
DB search
MKNSKAFYRSALATAIVMALSAPAFATDSTVSTDPVTLNTEKTTLDQDVVINGDNKITAV
TIETSDSDKDLNVTFGGHDITAASTVNQDFVEGVKVSGNKNVVINATDSTITAQGEGTYV
RTAMVIDSTGDVVVNGGNFVAKNEKGSATGISLEATTGNNLTLNGTTINAQGNKSYSNGS
TAIFAQKGNLLQGFDGDATDNITLADSNIINGGIETIVTAGNKTGIHTVNLNIKDGSVIG
AANNKQTIYASASAQGAGSATQNLNLSVADSTIYSDVLALSESENSASTTTNVNMNVARS
YWEGNAYTFNSGDKAGSDLDINLSDSSVWKGKVSGAGDASVSLQNGSVWNVTGSSTVDAL
AVKDSTVNITKATVNTGTFASQNGTLIVDASSENTLDISGKASGDLRVYSAGSLDLINEQ
TAFISTGKDSTLKATGTTEGGLYQYDLTQGADGNFYFVKNTHKASNASSVIQAMAAAPAN
VANLQADTLSARQDAVRLSENDKGGVWIQYFGGKQKHTTAGNASYDLDVNGVMLGGDTRF
MTEDGSWLAGVAMSSAKGDMTTMQSKGDTEGYSFHAYLSRQYNNGIFIDTAAQFGHYSNT
ADVRLMNGGGTIKADFNTNGFGAMVKGGYTWKDGNGLFIQPYAKLSALTLEGVDYQLNGV
DVHSDSYNSVLGEAGTRVGYDFAVGNATVKPYLNLAALNEFSDGNKVRLGDESVNASIDG
AAFRVGAGVQADITKNMGAYASLDYTKGDDIENPLQGVVGINVTW
NT seq
2298 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaacagtaaggcattttaccgcagcgcattagcgacagctattgttatggctctt
tctgcaccagcattcgctactgatagcacggtatcaactgatccggttacgctgaataca
gagaagacgactctggatcaagatgttgttattaacggtgataacaagattacagccgta
acaattgaaacgtcagattcagataaagaccttaatgttacttttggcggtcacgatatt
accgccgcatcaacggtaaaccaagatttcgttgaaggtgtaaaagttagtggtaacaaa
aatgttgtgattaatgctacagactccaccatcacagctcaaggtgaaggcacctatgtc
cggactgcaatggtcattgattcaactggcgatgttgttgttaatggcggtaatttcgtt
gcaaaaaatgaaaaaggtagtgcgacagggatatctctggaagcgaccacgggaaataat
ttaacgctcaatggtacaaccataaatgctcaaggtaataagagttacagcaacggctct
acggcaatttttgctcaaaagggtaatttgttgcagggttttgacggtgatgcaaccgac
aacatcacccttgctgactcaaatattattaatggcgggattgaaacaatagttactgcc
gggaataagacgggaattcatacagtcaacctgaatattaaggatggctcagtaattggg
gcggctaataataaacaaacaatttatgcctctgcttcggcacaaggcgcaggttcagca
acgcaaaatttaaatttgtctgttgctgattcaaccatctactctgatgtcctggccctt
tctgaaagcgagaattcagccagtaccacaacaaatgtaaatatgaacgttgcccgctct
tactgggaaggtaatgcttataccttcaatagcggcgataaagcgggtagtgatctggat
ataaatctttccgatagttcagtctggaaaggcaaagtttcaggggcaggagatgccagt
gtatctctgcaaaacgggtctgtctggaatgttacgggttcctcaactgttgatgctctg
gcagtaaaagacagtacggttaatatcacgaaggctacagtcaatactggcacgtttgct
tctcaaaacggcactctgattgttgatgcctcttctgaaaacactctggatatcagcggt
aaagcgagcggtgacttgcgtgtttacagtgcgggttcattggatcttatcaatgaacaa
acggcatttatttctaccggcaaagacagcactctaaaagccacaggcacaacggaaggt
ggtctgtatcaatatgacctgacacagggagctgatggtaacttttatttcgtaaaaaac
acgcataaagcatccaacgccagctccgtgattcaggcaatggcagctgctccggctaac
gtcgctaatctgcaggctgacacgctctccgcccgtcaggatgctgtccgtctgagcgaa
aatgacaagggtggcgtatggattcagtactttggcggtaaacagaaacataccaccgcg
ggaaatgcatcctatgacctggatgtaaatggtgtaatgctgggtggtgatacccgcttc
atgactgaagatggtagctggctggccggtgtggcgatgtcttctgcgaaaggtgacatg
actaccatgcagagcaaaggtgacactgaaggttacagcttccacgcttacctgagccgc
cagtataacaacggtatcttcattgatactgctgcacagtttggtcactacagcaacacg
gcagatgttcgcctgatgaatggtggcggtaccatcaaagctgactttaacaccaatggt
tttggtgcgatggttaaaggcggttacacatggaaagacggtaatggcctgtttattcag
ccatatgccaaactgtctgctctgactctggaaggtgtggattatcaactcaacggcgtg
gacgttcattctgacagctataactctgtgctgggtgaggccggtacgcgcgtgggttat
gacttcgctgtgggcaacgcgaccgttaaaccttatctgaatctggccgcactgaacgaa
ttctctgatggcaacaaagtccgtctgggtgatgagtctgtcaatgccagcattgacggt
gcagcattccgcgtgggtgcaggtgtacaggctgatatcaccaaaaacatgggagcatat
gcaagccttgactacaccaaaggtgacgacattgagaacccgctacagggtgtagttggt
atcaatgtgacctggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
