Embiotoca jacksoni (black perch): 138200093
Help
Entry
138200093 CDS
T10523
Symbol
col10a1a
Name
(RefSeq) collagen, type X, alpha 1a
KO
K19479
collagen type X alpha
Organism
eja Embiotoca jacksoni (black perch)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
C1q
BclA_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
138200093
NCBI-ProteinID:
XP_069008635
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
654 aa
AA seq
DB search
MPVRPYKMDIRVACVLLVMVASAAAHGKGYVVKKVMPYAVKSHVVSVAGEPGPPGEPGPE
GPAGPPGPQGEDGEGYAGPQGPPGPPGPSGRSIAGKPGSPGGPGKPGSSGQPGEKGDTGA
PGQQGPRGVPGSSGSPGPAGLSATGKSGPAGLPGPMGHRGESGLKGHPGIPGLPGAKGDM
GMGVPGPQGETGPMGPMGSTGAPGENGVGKPGRTGAPGEPGKSGSSGRDGASGPMGPQGP
KGHTGAPGVGIAGKPGENGAPGLPGSVGPKGHQGSAGATGAPGVPGYGKPGANGEKGERG
ATGSTGSTGAKGDQGPTGYTGATGATGPTGPTGPQGETGFPGEPGAVGSKGDSGPTGAQG
SKGNKGDQGAQGFSGKQGYPGAAGPPGPRGATGPTGDKGNGGAPGTPGAPGIPGPAGPKG
HPGRAGEPGGSGSDGAPGQRGPGGPQGPAGAPGLKGHQGVPGAPGPAGLTAKGIPGPQGP
PGLPGDNGADGEAGPAGPPGAPGPPGEVMFEKGMGMGEVMVKSPMSAFTASLATPYPASG
TPIKFDQIVYNAENHYDSETGIFTCQVPGVYYFSYSIHVNGANALVALYKNGQPVMFTYD
EYNKGFLDQMSGSAVLLLDAHDTVYVQIPDDEANGVFAAENVHCSFSGFLIAST
NT seq
1965 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccggttagaccttacaagatggacatacgagtagcatgcgtcctcctcgtcatggtg
gcctctgcagcagcccatggaaaggggtatgtggtgaagaaggtgatgccctacgctgtg
aagagccacgtggtgtcagtagcaggtgagcctggtcctccaggtgagcctggccctgag
ggacctgctggccctcctggcccccaaggtgaggacggtgaaggttatgctggaccccaa
ggacctcctggaccccccggacctagtggacgctccattgctggcaaacctggatctcca
ggtggacctggcaaacctggcagctctggacaacctggtgagaagggagatactggtgcc
cccggccagcagggacccaggggagtccctggatcatctggaagccctggacctgctggt
ctctctgctactggcaagtctggacctgcaggtcttcctggaccaatgggacatagagga
gagtctggtctgaaaggacatccaggtattcctggacttccaggtgctaagggtgatatg
gggatgggagtacccggacctcagggtgagacaggacctatgggacctatgggctcaaca
ggtgcaccaggtgagaatggagttggaaagccaggtagaacaggtgcaccaggtgagcct
ggaaagtcaggtagctcaggtagagatggtgcctctggtccaatgggaccacagggacct
aagggacacactggtgccccaggtgtaggtattgcaggtaaaccaggtgagaatggtgcc
ccaggtctgcctggttcagttggccctaaaggtcaccagggctctgctggagccactggt
gccccaggagtccccggatatggaaaaccaggtgcaaatggagagaagggagagagggga
gctacaggtagcacaggatcaacaggtgctaagggtgaccagggtccaacaggatatact
ggtgctactggtgcaactggccccactggtcctactggacctcagggtgaaacaggtttc
ccaggtgaacctggtgctgttggctctaaaggtgattcaggtccaactggagctcaggga
tctaagggaaacaagggagatcagggagcacagggtttctcaggcaagcagggttatcca
ggtgcagctggtcctcctggacccagaggggccactggacccacaggtgacaaaggtaat
ggaggtgccccaggtaccccaggtgccccaggtattccaggccctgccggacccaaaggt
catcctggccgtgcaggtgagcccggtggctctggatctgatggtgctccgggtcaaaga
ggacctggtggccctcaaggtcccgctggtgctcctggccttaagggacaccaaggtgtc
cctggtgctcccggccctgcaggtttgactgctaagggtatccctggacctcagggtccc
cctggtctgcctggtgataatggagctgatggagaagctggcccagctggtcctcctggt
gcccctggccctcctggtgaggttatgtttgagaagggcatgggaatgggtgaggttatg
gtcaagtcccccatgtctgctttcactgcatctctggccaccccctaccctgcttctggc
acccccattaagtttgaccagatcgtgtacaatgctgagaatcactatgactctgagacc
ggcattttcacttgccaggttcctggagtttactacttctcctacagcatccatgttaat
ggagctaatgccctggtggctctgtacaagaatggccagcctgttatgttcacttatgat
gagtacaacaagggcttcctggaccagatgtccggtagtgctgtcctcttgctcgatgca
catgacacggtctacgtccagatccccgatgatgaagccaatggtgtctttgctgcagag
aatgtccactgctctttctctgggttcctcattgcttcaacgtga
DBGET
integrated database retrieval system