Escherichia coli clone D i14: i14_0311
Help
Entry
i14_0311 CDS
T02003
Name
(GenBank) putative exopolygalacturonate lyase
KO
K22994
pectate disaccharide-lyase [EC:
4.2.2.9
]
Organism
elc
Escherichia coli clone D i14
Pathway
elc00040
Pentose and glucuronate interconversions
elc01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
elc00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00040 Pentose and glucuronate interconversions
i14_0311
Enzymes [BR:
elc01000
]
4. Lyases
4.2 Carbon-oxygen lyases
4.2.2 Acting on polysaccharides
4.2.2.9 pectate disaccharide-lyase
i14_0311
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pel9A-like_beta_helix
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AER87827
LinkDB
All DBs
Position
298391..300697
Genome browser
AA seq
768 aa
AA seq
DB search
MNMTSASVITMLALNLKTKQGHSRMNKHTLLLTVLFLNLICTPVFAQNWQVATFGQSTDL
NFSSLIDSAKIGRNNAWLAGNNNFLEAGKFYTLPTDFFIESRGGKIANSHDGMTVFYTIV
PVTQTFRLEADLTLEQIGPEVNGKSPAGQEGAGLFVRDIIGPQRQEPQSAGTEEYPQASN
ILMNAFITQNKKNDNLVQITSIVREGVIKTWGNEGITIKKQPIIENINFTQKRNIHMTIE
RLPEKFILTAFDTDRKENQSWQFSDYSGFMNQLDNNSLAIGFFAARNAKLRVKNASFKPG
KPLVDYKQLTSRQFSRVRHKAPELFLASPQSVVRNSTTLQFLANQAGIVSIDNDKQTKQV
QAGELVQFPVTLQKKHNDFTVNFNVDGNISKKAIRIEQVKSNLTDPYEIYVCSDCRQGAR
GSKNDPVDLQTAVKFVAPGGNIYLNDGQYHGITLDRELSGIPGKYKTISAINPHKAIFIN
KTFNLDASYWHLKSVVFDGNVDNGNNKPAYLRIAGSYNIIEHVIARNNDDTGISISAKDK
NRFFWPAHNLVLNSDSYNNLDLSGINADGFAAKLGVGPGNIFRGCIAHNNADDGWDLFNK
IEDGPNASVTIENSVAYENGLPYNKADILKGSIGNGFKLGGEGQPVNHKVINSIAINNNM
DGFTDNFNTGSLIVRNNIAMNNARYNYILRTNPYKFPSSILFDNNYSIRDDWENKIKDFL
GDTVNSVNYKLLVSHETGPVQKDLFFTRDDSGNIIYPDFFLNIINKFN
NT seq
2307 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatatgaccagtgcttcggtaataacaatgttggctttaaatttgaaaacaaagcag
gggcattctagaatgaataagcacacactattactgactgttctttttctgaatttgatt
tgtactcccgtttttgctcaaaactggcaggtggcgacgtttggtcagtctacggatctc
aacttttcatcgctgatagattcggccaagatcggacggaataatgcctggcttgcagga
aacaataattttcttgaagctggaaaattttacactttaccaacagatttttttattgaa
agccgtgggggaaaaattgctaactcccatgacggtatgaccgtcttttatactattgtt
ccggttactcagacattccgactggaggctgatttgacattagaacagattggtccggag
gtgaatggaaaatcaccagcgggacaggagggagctggattgtttgtcagagatattatc
ggtcctcagcgacaggaacctcagtcagctggaacagaagaatatccccaggcctctaat
atattgatgaatgcctttattacacagaataaaaagaatgataacttagtacagattact
tcaattgttcgtgaaggagtaataaaaacatggggtaatgaaggtattacaattaagaaa
cagccgatcattgagaatataaactttacgcaaaaaagaaatattcatatgacgatcgag
cgactaccagagaagttcatcctgaccgcttttgataccgatcgtaaagaaaatcagtca
tggcaattttctgattactcaggctttatgaatcaactggataataatagtttagctatt
ggtttttttgccgcacgaaatgcgaaactaagggtgaaaaatgcatcatttaaaccgggc
aagccactggttgattacaaacaattaacttcacgtcaattcagtcgtgtccggcataaa
gcccctgaactttttcttgcttcacctcaatccgttgtaagaaactcaacaactcttcaa
tttttggccaatcaggctggaatagtcagtattgataatgataagcagactaagcaggtg
caggcgggtgaactggtacagtttccagttactttgcaaaaaaaacataatgacttcacc
gtcaactttaacgttgatgggaatatatcaaaaaaagctatacgcatagagcaggttaaa
tcaaacctgactgatccttatgagatttacgtatgtagtgattgtcgacagggggccaga
ggcagcaaaaatgaccctgtagatttacagacagccgtaaaatttgtcgcacccggcggt
aatatataccttaacgatggtcaatatcatggaattaccttagatcgggaattaagtgga
atacctggcaagtataaaacaatttctgccattaatccacataaagccatttttataaac
aagacattcaatctggatgcaagttactggcatctaaaatccgtggtctttgacggcaat
gtggataatggaaataataaaccagcatatttgcgtatagctggtagctataatattatt
gagcatgtgatagccagaaataatgatgatacgggaatttctatttcagcgaaagataaa
aaccgttttttctggccagctcataacttagttttaaactcagattcatataataatctt
gatttatccgggattaatgccgatggttttgctgcaaaattaggtgtcggaccgggaaac
atttttcgaggatgcattgcacataataatgcagatgatggttgggacctatttaacaaa
attgaagatggtccaaatgcatctgttactattgagaattctgtagcctatgaaaatggc
ctgccatacaataaagcggatatcctaaaagggagtattggcaatggctttaaattaggt
ggtgaaggtcaaccagtaaatcacaaagttattaattccattgctattaataataatatg
gatggattcactgataattttaatactgggtcattgatagttagaaataatatagcaatg
aacaatgcacgctataattatattttaagaactaacccatataaattcccatcatctatc
ctttttgataataattattcaatcagagatgattgggaaaataaaataaaagacttctta
ggtgatacagttaacagtgtgaattataaattgcttgtttcacatgaaacaggaccggta
caaaaagatttatttttcacacgagatgatagtggaaatattatctatcctgattttttt
cttaatatcattaataaatttaattag
DBGET
integrated database retrieval system
