Escherichia coli O78 H11 K80 H10407 (ETEC): ETEC_p948_0410
Help
Entry
ETEC_p948_0410 CDS
T02069
Symbol
cfaC
Name
(GenBank) cfa/I fimbrial subunit C precursor (colonization factor antigen subunit C; outer membrane usher protein)
KO
K22852
CFA/I fimbrial subunit C
Organism
elh
Escherichia coli O78:H11:K80 H10407 (ETEC)
Module
elh_M00853
ETEC pathogenicity signature, colonization factors
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
elh00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09193 Unclassified: signaling and cellular processes
99993 Cell motility
ETEC_p948_0410 (cfaC)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Usher_TcfC
TcfC
CooC_C
Dcr1-like_dsRNA-bd_dom
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBJ04488
LinkDB
All DBs
Position
p948:39148..41757
Genome browser
AA seq
869 aa
AA seq
DB search
MKHKKKNRLVVAISVALIPYIGVTGDIPDSFRDLWGEQDEFYEVKLYGQTLGIHRIKTTP
THIKFYSPESILDKINLKKEKEKELSVFFTNSFSRNGNMSCQGNTTIQYNCNYIKTKSVD
VIVDDVDNVVNLFIGNEFLDSEAHNDEYHQLSRNVKKAFIQSQTINVSDSGKYKRLSISG
NSALGITDTSYAVLNWWMNYNKSNGYSNNEKTINSLYFRHDLDKRYYYQFGRMDRTDLSQ
SISGSFNFNLLPLPDIDGIRTGTTQSYIKNTDKFIASPVTVMLTNFSRVEAFRNDQLLGV
WYLDSGVNELDTARLPYGSYDLKLKIFENTQLVREEIIPFNKGRSSIGDMQWDIFVQGGN
IVNDNDRYIEKQNNHKSSINTGLRLPITKNISVQQGVSVIDNKSYYEGSLKWNSGILSGS
LNSEFSFLWGDNAKGNYQSISYTDGFSLSFYHNDKRVDNCGRNYNAGWSGCYESYSASLS
IPLLGWTSTLGYSDTYSESVYKSHILSEYGFYNQNIYKGRTQRWQLTSSTSLKWMDYNFM
PAIGIYNSEQRQLTDKGGYISVTITRASRENSLNTGYSYNYSRGNYSSNELFVDGYMTST
NNGDYHEAGMRFNKNRHNAEGRLSGRINNRFGDLNGSFSMNKNRNTNSTNHSLTGGYNSS
FALTSDGFYWGGSTAGLTKLAGGIIKVKSNDTKKNLVKVTGTLYGDYSLGSNDNAFIPVP
ALTPASLIIEDNNYGDNNISILAPTNNDMFMLPGNVYPVEIETKVSVSYIGRGFDPNGTP
LSGAHVLNEPHVILDEDGGFSFEYTGNEKTLFLLKGRTIYTCQLGKNKVHKGIVFVGDVI
CDINSTSSLPDEFVKNPRVQDLLAKNDKG
NT seq
2610 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagcataaaaaaaagaatagattagtcgtagcgatttcagttgcattaattccatat
ataggggttaccggagatatacccgactctttccgtgatttatggggagaacaagatgaa
ttttatgaagtaaaactatatgggcaaactctaggaatacatcgaattaaaacaacccca
acacatattaagttttattcacccgaaagcattttagataaaataaatttaaaaaaagaa
aaggaaaaggaattgagtgttttttttactaattctttttcaagaaatggcaatatgagt
tgtcagggtaacactactatacagtataactgcaattacattaaaacaaaatcagtagat
gtcatcgttgatgatgttgataatgttgttaacctttttataggtaatgaatttctggat
tctgaagcacacaatgatgaatatcatcaattatcacgaaatgtaaaaaaagcttttata
caaagccagacaattaatgtctcagattctggaaagtataaaagattgtctatttcaggg
aatagcgcgctgggtattacagatacaagttatgctgtcttaaattggtggatgaattac
aataaatctaatggttacagcaacaacgaaaaaacaatcaatagtttatactttagacat
gatttagataagagatattattatcaatttggacgaatggatcgtacagatttatcacaa
agtattagcgggagctttaattttaacttacttcctttacccgatattgatggtatacgg
acaggaaccacacaatcttatatcaaaaatacagataagtttatcgcatcccctgtaact
gttatgttaactaatttttccagagtggaagcttttcgcaatgatcaattattgggcgta
tggtatttagattctggagtaaatgaattagatacagctcgtttaccttatggcagttac
gatcttaaattaaaaatttttgaaaacactcaattagttcgtgaagaaataattcctttt
aataaaggaagaagctctattggtgatatgcaatgggatattttcgttcagggagggaat
attgttaatgataatgatcgttacatagaaaaacaaaataatcataagtcatcgattaat
actgggctacgtttaccaattacgaaaaatatctctgttcaacagggagtatctgttata
gataataaaagttattatgaaggaagtctgaaatggaattccggcattctatctggctca
ctaaatagtgagttcagttttctttggggagataatgcaaaaggtaattatcaaagtatc
tcgtataccgatggatttagcttatcattttatcataatgataagcgggtcgataattgt
ggaagaaattacaatgctggttggagtggatgctacgaatcatattcggcatctttaagt
attcctttattaggatggacaagtactctgggatatagtgacacttatagtgaatcagtg
tataaaagccatattctttctgaatatggcttttataatcaaaacatatataaagggaga
acccaaagatggcaactgacttcatccacctctttaaaatggatggattataattttatg
ccagcaattggaatatataacagtgaacaaagacaactgactgataaaggcggatatata
tctgtaactatcacccgagccagcagagaaaattcattaaatacagggtattcttacaac
tattccagaggaaactattcttctaacgaattatttgttgatggatatatgacatcaaca
aataatggtgattatcatgaggcaggaatgcgttttaataaaaatagacataatgcagaa
ggtagactttcaggtcgtataaacaatcgatttggagatttaaatggttcattcagcatg
aataaaaacagaaacaccaacagtaccaatcattctctcactggtggttataattcctca
tttgctcttacaagtgatggattttactggggaggaagtacagctggtttgacaaaactg
gctggcggtattatcaaggttaaatcaaacgatactaaaaaaaacttggtaaaagtgact
gggacattgtacggtgattattcgctagggagcaacgataatgcttttattcctgtacca
gcattaactccagccagtttaatcattgaagataataattatggtgataataatatttct
atacttgcgccaacaaacaacgatatgtttatgttgccgggtaatgtttatcctgttgaa
attgaaaccaaagtaagtgtttcttatattggtagaggttttgacccaaacggcacgcca
ctttctggcgcacatgttttgaatgaaccacatgttatcctggatgaggacggtggattt
tcgtttgaatatacaggtaatgagaaaacactttttttattaaagggcaggactatttat
acatgtcaactggggaaaaataaagttcataaaggcattgttttcgtcggggatgttata
tgtgatattaatagcacaagttccttaccagatgaatttgtaaagaacccacgtgtgcag
gatttgctggcaaagaatgataaaggataa
DBGET
integrated database retrieval system