Williamsoniiplasma luminosum: ELUMI_v1c03340
Help
Entry
ELUMI_v1c03340 CDS
T05209
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
elj
Williamsoniiplasma luminosum
Pathway
elj03030
DNA replication
elj03430
Mismatch repair
elj03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
elj00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
ELUMI_v1c03340 (dnaE)
03430 Mismatch repair
ELUMI_v1c03340 (dnaE)
03440 Homologous recombination
ELUMI_v1c03340 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
elj03032
]
ELUMI_v1c03340 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
elj03400
]
ELUMI_v1c03340 (dnaE)
Enzymes [BR:
elj01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
ELUMI_v1c03340 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
elj03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
ELUMI_v1c03340 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
elj03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
ELUMI_v1c03340 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
tRNA_anti_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATZ17059
UniProt:
A0A2K8NTE5
LinkDB
All DBs
Position
409552..412485
Genome browser
AA seq
977 aa
AA seq
DB search
MKFSPQLNVRTEYNFQESLIRIKDYISFAKKHDFSFVFYAENKSMFGVADFYNQAKKNNL
KPIIGLAIDNPETNKTTLLYAKNKTGFQNLSFLSSWLMENNLTNFDQEFFDVFNQAISDT
FLISEDDQIVEKYGAIVHQLFIPKISYLTSDEYENFIVLSAIKNNLTLKEISNVQDEHYF
SDEEMQNKNPIDQKQQISQIAEACNFNLFDNSGQYHIANFKTPDNLPINIYLKQLCEEAL
LKYFNESKTFIEQTDYLKRLTYELSVIDKMGFNNYFLIVWDYVKFAKSQDIIVGPGRGSS
AGSLVAFLLEITQIDPIKYNLLFERFLNPERATMPDIDIDFQDDRREEVVEYLFNKYGAH
NVAMISTFQTIGAKSAIRDVARAYDINLEIVNAITKNIDLNYQNDLKSAVANNAQLKQYQ
TEYPELFEAANTLIGLPRQTSTHAAGVVLSDVDLRTILPIKIGFNGIYQTQFDMNFLETL
GLIKMDILGLRNLTTLQLIQNNILRSRQIKIKLENIDLNLPEVFKTLNAGDTSGIFQLES
PGMTNLIKKMEVNSIEDISIASALFRPGPQEMIEEFIERKKGKKQNYLIDQTLKDILNPT
FGIIVYQEQVIQILGLVANFSFAKSDIVRRAMGKKDYKYMESMKTEFISQAIKNNYSPEN
ANTIWDWIEKFASYGFNKSHSIAYSYISYWLAYFKTKYPSEFYAALLSGVIGNETKMTQY
LNEAKRKDIIVKSPNVANMSFNYNSSQKLLFLPLTTIKGIGNEFIRKLREAYQNDKNLFS
SIFYFTTKMLNNGLNKNLFKALIWSGAFDEFKYSRQTLDENIDQIFSFAEFNKNTKIIDE
KLVPILEVQKDVPTVVSAKEKEYLGFYVSTHPITTIKAENKDLKAVGIDFIKENQGFTRI
IGEIQNIKIFKDKNQNDMAFIEVGDETDTISVTIFASLFEQMNELIKLNSILAMDVKMQK
YKNTISASLIKIVKVLK
NT seq
2934 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagttttcaccacaattgaatgttcgaactgaatataattttcaagagtctttaatt
agaatcaaagattatatttcttttgctaaaaaacatgatttttcatttgttttttatgct
gaaaataaatcaatgtttggtgttgctgatttttataaccaagctaaaaaaaacaattta
aaaccaattattggtttagcaattgacaatcctgaaacaaataaaacgacacttttatac
gccaaaaacaaaacgggttttcaaaatttgtctttcttatcttcgtgattaatggaaaat
aatttgacaaattttgatcaagaattttttgatgtttttaatcaagcaataagtgatacc
tttttgatttctgaagatgaccaaattgttgaaaaatatggtgcaattgttcaccaatta
tttattcctaaaattagctatttaacaagcgatgaatatgagaatttcattgttctttca
gcgattaaaaataacctaacacttaaagaaatttccaatgttcaggatgaacattatttt
tctgatgaagaaatgcaaaataaaaatccaattgatcaaaaacaacaaattagtcaaatt
gctgaagcatgcaattttaatttatttgataattctggacaatatcatatcgctaacttt
aaaactccagataacttaccaattaatatttatttgaaacaattgtgtgaagaagcctta
ttaaaatatttcaatgaaagtaaaactttcattgaacaaactgactatctaaaacgtcta
acatacgagttatcggtgattgataaaatgggctttaataactattttttaattgtttga
gattatgtaaaatttgctaaaagtcaagacattattgttggtcctggtcgtggttctagt
gctggatcattggttgcttttttattggaaatcactcaaattgatccaatcaaatacaac
ttattatttgaacgttttttaaatcctgaacgagcaacgatgccagatattgatattgat
tttcaagatgatagaagagaagaagtggtcgaatatttatttaataaatatggtgctcat
aatgttgcaatgatttcaacttttcaaacaattggggccaaatctgcaatcagagatgtg
gcaagagcttacgatattaatttagaaatagtcaatgcaattactaaaaatattgatcta
aattatcaaaatgatttaaaatcagcagttgcaaataacgctcaattaaaacaatatcaa
acagagtatccagaactttttgaggctgctaacaccttgattggattgcctcgtcaaacc
agcacacatgcagctggagtggttttatcagatgttgatttaagaacaattttaccaatt
aaaattggattcaatggtatttatcaaacgcagtttgatatgaattttttagaaacttta
gggttaatcaaaatggatattttaggcttaagaaatctaacaaccctccaattaattcaa
aataacattttaagaagtcgccaaatcaaaatcaaattagaaaacattgatttaaattta
cctgaagttttcaaaactttaaatgctggtgatacttccggaatttttcaattagaatca
cctgggatgactaatttaattaaaaaaatggaagtcaattcaattgaagatatttcaatt
gcttcagctttatttcgaccaggtccacaagaaatgattgaagaatttattgaaagaaaa
aaaggcaaaaaacaaaactatttaattgatcaaactttgaaagatattttaaacccaact
tttggaatcattgtttatcaagaacaagtgattcaaattttaggattggtggcaaatttt
tcttttgccaaatcagatattgtgcgaagagcgatggggaaaaaagattacaaatatatg
gaatcaatgaaaactgaatttatctctcaagcaattaaaaataattactccccagaaaat
gctaatacaatttgagattgaattgaaaaatttgcctcatatggatttaacaaatcacac
tcgattgcctactcatacattagttattgattagcttattttaaaactaaatatccatca
gaattttatgcagctttattaagtggagtgatcggaaacgaaaccaaaatgactcaatat
ttgaatgaagcaaaaagaaaagacattatcgttaaaagtcctaatgttgccaacatgagt
tttaattataattcaagtcaaaaactcttgtttttgcccttgaccacaatcaaaggaatt
ggtaatgaatttattagaaaattaagagaagcttatcaaaatgataaaaatttatttagt
tcaattttctattttacaaccaaaatgcttaataatggactaaacaaaaatctttttaaa
gcgttgatttgatctggtgcttttgatgaatttaaatatagcagacaaacccttgatgaa
aatattgatcaaattttttcttttgcagaatttaataaaaacaccaaaattattgatgaa
aagttagttccgattttagaggttcaaaaagatgtaccaacagttgtttctgcaaaagaa
aaagaatatttaggcttctatgtttcaacccacccgattacaaccattaaagcagaaaac
aaagatttgaaagcagttgggattgatttcatcaaagaaaatcaaggttttacaagaatt
attggtgaaatacaaaatatcaaaattttcaaagacaaaaatcaaaatgatatggctttc
attgaggttggtgatgaaactgataccatttctgtcacaatttttgcttcactttttgaa
caaatgaacgaattaattaagttaaattcaattttagcaatggatgtaaaaatgcaaaaa
tataaaaataccatttctgcgagtttaattaaaatagttaaggtactgaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
