Elizabethkingia sp. 2-6: FCS00_14905
Help
Entry
FCS00_14905 CDS
T06039
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
elz
Elizabethkingia sp. 2-6
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
elz00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
elz02000
]
FCS00_14905
Transporters [BR:
elz02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
FCS00_14905
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
MipA
MetallophosN
CooC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCO47596
LinkDB
All DBs
Position
3221553..3224441
Genome browser
AA seq
962 aa
AA seq
DB search
MELTIERRFLKRIHLVLFTFLFFNFFQAQQQLIELSGIIKDIDNHKGVTGAHIQVENTQD
IASTDQDGNFSLRTRVKIPFRVIIKKEGFTSQTVEILSLSNKITVELNPQNTIINEVVIS
ASRVPEKVLKSPIAIEKIDIRTIRESPAASFYETLENVKGLQLLTSSLTLKVPNSRGFNS
PNNFRFMQLVDGVDVQSATLGVPLGNAIGPTELDIQSMEVTPGAASALYGMNAINGLASL
QTKDPFTSQGLSFYFRGGLNHVDNVNHKISSLGESAIRFAKAINKSLAIKVNASYFSGVD
WISDNRTDQNPNSLITANPKFPELNSNNPAEDLWNKYGDERNNRVAVKVDYNGKPTTFNV
SRTGYYEKDLVSPEVKNIKFDAGLYYRFGDNWRASYVYRYGLLDGTFQRGNKIRLQNATV
QNHKVELTGKELTVRAYVSIENTGDSYNLKPLADNLDLTNLSNNNWKNIFQSALQNSLNA
GTNLNDAFALARREADKNRVVPGTSAFEQLKNTIIGINNWDSANGGVAGAPLTGGAKLEQ
KSHFYQGEATYDFSRFVKIFNLLVGVDYRLYSITPDGNNFVDFSRPVDQRNVPLPDGSFG
KDVTYQKYGVFAQITKLFWDEKLKLNVALRVDRNPEFKTKFNPRVSVVYSPVNQHNFRVS
FQNGFRFPSLFEALSFVNNGNVRRVGGLPMVNEGLGYLDNSYTLSSIDRFTSAVNADTDA
GKSQNQAALDNKNLLLVANLQKLQPERINSFEVGYKSLLFNNRLAIDWDFYYNIYDGFLG
QVEVAVPKSGNVGSNNAVLDMLNRSKQDRYRVYTNSNTTYKSYGTSLGIRYNFLKNYNVN
ANVSYNDLASSNNNSDLFITAFNTPKWSANVSFGNREIVKNVGFTVVARWQNKFLWESPL
ASGEIPAFYTIDAQVTWKLPEISSSLKIGATNLLNRRYFQYAAGPEIGGLYYLAYTYDLK
FK
NT seq
2889 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaactaactatagagaggcgttttctgaaaagaatacatcttgtattatttacattt
ctattttttaacttttttcaggctcagcagcaattaatagaattaagtggtattattaaa
gatatcgacaatcataagggcgtaacaggagcgcatattcaggttgaaaatacccaggat
attgcgtcaacggatcaggatggaaatttcagtctgagaaccagagtaaagatacctttc
agagttatcattaaaaaagaaggatttacaagccagactgttgaaattctctcattgtcc
aataaaataacagtagaactaaatccacaaaatacgataatcaatgaagttgtaatatca
gcttcccgtgttccggaaaaagtactgaaatcacctattgctattgaaaaaattgatatt
cgtactattcgggaaagtcctgcagcttctttttacgaaactttggaaaatgtaaaagga
ctgcagctgttaacatccagtcttactttaaaagtgcctaactccagaggatttaattcg
ccgaacaacttcagatttatgcaattggtagacggggtagacgttcagtctgcaacttta
ggtgttcctttaggaaatgctattgggcctactgaactcgatattcagtctatggaagtt
actcccggagccgcatctgccttatacggaatgaatgctattaacgggcttgccagttta
caaaccaaagatccgtttacatctcagggacttagcttttatttccggggtgggctgaat
catgtagataatgtcaatcataaaatatcatcattaggagaaagtgccatcaggtttgcc
aaagccattaataaaagcttagcaataaaggttaatgcatcctattttagtggtgtcgac
tggatttcagataaccgcactgatcagaatcctaattcattaattacggcgaatcctaag
tttccggagctgaacagcaacaacccggcagaagatctctggaataaatacggagatgaa
agaaacaaccgtgttgcggtaaaagtagattacaatggaaagcctacaacttttaatgta
tccagaaccggatattatgaaaaagatctggtgagtccggaagtgaagaatataaaattc
gatgcaggattgtattatcgttttggtgataattggcgcgcttcttatgtttatcgctat
ggtttgctggacggaacttttcagagaggtaataaaatccgtttgcaaaatgcaacagta
caaaaccacaaagtagaattaacgggaaaagaattaacagtaagagcttatgtctctata
gagaatacaggtgattcctataatctgaaaccccttgccgataatctggatcttacaaat
ctttccaataataactggaaaaatatctttcagtcggctttacagaatagcctgaatgca
ggaacaaatttgaatgatgcttttgctttggcccgaagagaagctgataaaaacagagtt
gtgccgggtaccagtgcctttgaacaactgaaaaacacaattatcggaatcaacaactgg
gattctgctaatggaggtgtagcaggtgctccgttgacaggaggtgccaaactggaacaa
aaatctcatttttatcagggtgaggctacctatgactttagccgttttgtaaaaatattt
aatcttcttgttggtgtagattaccgtttatatagcataacacctgatggtaataacttt
gtggactttagcaggcctgtggatcagagaaatgttccactaccggacggaagttttggt
aaagatgtaacttatcagaaatatggagtatttgctcagatcacaaaactcttctgggat
gaaaaattaaagctgaatgtggctttgcgtgtagatcgaaatcctgaattcaaaacgaag
ttcaatccgagagtaagtgtagtttattctcctgtaaaccagcataatttcagagtctct
tttcagaacggattccgctttccatctctttttgaagcattgtcttttgtaaataacgga
aacgtaaggagagtaggcggattgccaatggttaatgaaggtcttggatatctggataat
tcatatacattatcatctattgataggtttacgtctgcggttaatgccgatacagatgcc
ggaaagagtcagaatcaggctgcattggataataaaaatcttctgttagtggctaatttg
cagaaattgcaaccagagagaatcaactctttcgaggtaggctataaatcgttgctattc
aacaacaggttagcaatagattgggatttctattataacatatatgatggttttctgggg
caggtagaagttgctgtacctaaaagcgggaatgtaggaagcaataatgccgtacttgat
atgctgaatcgtagtaagcaagacagatacagagtgtataccaatagtaatacaacttat
aaaagttatggaacctcattgggaattcgttataatttcctgaagaactataatgtaaat
gctaatgtttcttataatgatttagcttcttccaataataactccgatttgtttattaca
gctttcaataccccaaaatggtcggccaatgtaagctttggaaaccgtgagattgttaaa
aatgtagggtttacagtagtggcaagatggcagaataaatttttgtgggaaagcccgttg
gcttcaggagaaatcccggctttctatacaatagatgcccaggtaacatggaaattaccg
gaaatcagctccagcctgaaaatcggagcaactaacttgctgaaccgccgttattttcaa
tatgctgcaggtcctgaaattggaggattgtattaccttgcgtatacctatgatttaaaa
tttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
