Echinicola marina: KZP23_16875
Help
Entry
KZP23_16875 CDS
T08295
Name
(GenBank) gliding motility-associated C-terminal domain-containing protein
Organism
emai
Echinicola marina
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MBG_2
CHU_C
IG_AIR9
Big_4
SCAB-Ig
Cadherin_4
Reelin_subrepeat-B
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UCS92362
LinkDB
All DBs
Position
4194306..4203047
Genome browser
AA seq
2913 aa
AA seq
DB search
MMKKLLLIVLLLGMHLSVLGQVQFWSDDFEDPTSPSSGIRTPSNNGGSSSAYFKRATNAD
LDLTTASDGNYSNFQGTYFWAGEDHDGPFANDEQNIVWSGINITGKTGITFKGLFGAQST
NDAFENVLAGYSHSDYVIVEYSIDGGIYVPLISFYSTTDIENKKLYEDTNNDGIGDGTLL
TKSFQEFSKSISGTGNQLTIRLRAYSNNTFTEEWAVDNFRLSATESNAAPTATAPSVPSV
EEDDTNVALSNDIQISDADGDGQTVTFTITGGTLTLGTSGITFGGGMNGSSSFTALGTLA
NINAALDAATFTPTPDLYGPGVATISFISNDGTDNSNTASVTFDIAGVNDDPTIIGLPSS
ITVEEDATEDPFDISAATIGDIDAESGELTITLEATGGIFDIAAGTGITITGHMSGLLTL
TGNLTDLNNYINSPSNIYFRPDANLNGNGAASVEVSINDNGNTGSGGGNDIAIGTVSIDI
TPVNDAPTASGVAISGTLTVGEELNGTYTYADVDNDAESGSTYQWYRADDDGGTGKTAIT
GAENQDYTLQAADQGKYISFEVTPNDGTLAGTAVESDLEGPVKIGQTITFPSIPTKTYGD
ASFTLGDAQTDQGLTVTYTSDDPTVVDITGNQATILTAGSTQITATQSGDGTTQAATPVA
HTLTVNQATLTVTADDQSKVYGEADPALTVSYDGFENGDDESDLGGTLNVSRAAGEDVGD
YAINASGQTSANYTINYVAGNLEITSATLTVTAEDKSKVYGEADPSLTVSYAGFVNGDDA
TALGGTLDLSRATGEDVGNYAVMASGYSSSNYMISYVEGNFEITQAALTVTADDKSKVYG
STDPGLTVSYAGFVNGDDATALGGTLDLSRATGEDVGNYAVMASGYSSSNYTISYVEGNF
EITQAALTVTADDQSKVYGAADPSLTVSYSGFVNSDDETVLGGTLDVSRTAGEDVGNYAI
TASGYTSGNYTISYVDGNFEITQAALTVTANGQSKVYGEADGALTVSYSGFVNSDDATVL
GGTLDVSRAAGEDVGNYAITASGYTSGNYTISYVDGNFEITKAALTVTADDQSKVYGEAD
GALTVSYSGFANGDDATVLGGTLDVSRTAGEDVGNYAITASGYTSGNYTISYVDGNFEIT
KAALTVMANDQNKVYGEADGALTVSYSGFVNGDDETALGGTLAISRTAGEDVGNYAITAS
GYTSGNYTISYVDGNFEITKAALTVTADDQSKVYGAADPSLTVSYSGFVNSDDATALGGT
LDVSRTAGEDVGTYAITASGYTSGNYTISFVDGSFEITQAALTVTADDQSKVYGAADPNL
TVSYSGFVNGDDATVLGGTLDVSRAAGEDVGTYAITASGYTSGNYTISFVDGSFEITQAA
LTVTADDQSKVYGAADPNLTVSYSGFVNGDDATVLGGTLDVSRAAGEDVGTYAITASGYT
SGNYTISYVDGNFEITQAALTVTADDQSKVYGAADPSLTVSYSGFVNSDDATALGGTLDV
SRAAGEDVGNYAITASGYTSGNYTISYVDGNLEITKAALTVTADDQSKVYGAADPSLTVS
YSGFVNGDDATALGGTLNVSRAAGEDVGSYAITASGYTSGNYTISYVDGNLEITKAALTV
TADDQSKVYGAADPSLTVSYSGFVNGDDATALGGTLNVSRAAGEDVGSYAITASGYTSGN
YTISYVDGNLEITQASLTVTADEQSKVYGEADGALTVSYSGFVNGDDATVLGGTLDVSRA
AGEDVGTYVITASGYTSGNYTISYVDGNLEITQAALTVTADDQSKVYGAADPSLTVSYSG
FANGDDATALGGTLDVSRVAGEDVGNYAITSSGYTSGNYTISYVDGNLEITQAALTVTAD
DQSKVYGEADGALTVSYSGFVNSDDETVLGGTLDVSRAAGEDVGNYAITASGYTSPNYTI
SYVDGNLEITKAVLTVTADDQSKVYGETDPALTVSYSGFVNGDDETALGGTLAISRTAGE
DVGKYAIIASGYTSGNYTISYVDGNFEISQAALTVIADDQSKVYGETDGALTVSYSGFVN
GDDATVLGGTLTVNRAAGEDVGNYAISASGYTSGNYTISFVDGSFEITQAALTVTADDQS
KVYGEADGALTVSYSGFVNGDDATVLGGTLAISRAAGEDVGTYEITASGYTSGNYTISYV
DGNFEITKAALTVSADDQSKVYGEVDGALTVSYSGFVNGDDATALGGTLAISRAAGEDVG
NYAITASGYTSGNYTISYVDGNLEITQAALTVTADDQSKVYGEADGALTVSYSGFVNGDD
KTALGGTLAISRTAGEDVGNYAITASGYTSGNYTISYVNGNFEITKAALTVTADDQSKVY
GEVDGALTVSYSGFANSDDATVLGGTLDMSRTAGEDVGNYAITASGYTSGNYTISYVDGN
LEITQAALTVTADDQSKVYGEADGALTVSYSGFVNGDDATALGGTLAISRAAGEDVGNYA
ITASGYTSGNYTISYVDGNLEITQAALTVTADDQSKVYGEVDGALTVSYSGFVNGDDKTA
LGGTLAISRTAGEDVGNYAITASGYTSSNYTISYVNGNFEITQASLTVSADDQSKVYGTV
DPILSYTASGFVNGDDDGILTGGLSRAAGEDIGVYAINLGSLSAGDNYNIVYQAASLTIL
ARKIEEVYEPTAVTVDWGIDLVEIPLPETVLVRTEQDEFINLEVNWNVSTVDTRNRGAYR
ITGTLQLPGTILGEGLPVPFMFVNVNAKPAPVDLVLDNNSFEAQNGPVAIGSITVVDPVD
NQHVLELVSGAADNGYFSLSGNSLYWDSQEALAGRTAFSVEVMVVDADGNTLSKVFEVNR
LRKSLNDIVIYNTFSPNEDGTNDTWGVEELRYQTGVRIMIFEKSGNRLFYTENPEKRWDG
TYKGKEMAVGSYFWVIESKEDDKVRRGTLNLLK
NT seq
8742 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaaaaaacttttactcatagtgttactgctaggcatgcacctatcggttttaggt
caggtccagttttggtccgacgactttgaggatcccacttccccttccagcggtatccga
acaccttcaaataacgggggaagcagtagtgcctattttaaacgagctacaaacgctgac
ttagatttaacaaccgcatcagatggtaattactccaactttcaaggcacttatttttgg
gccggtgaagatcatgatggaccctttgcaaacgatgaacaaaatattgtctggagtggc
attaatattaccggaaaaacaggtattacttttaaaggcttatttggcgcacagtccact
aatgatgcctttgagaatgtccttgccgggtattctcattcggattatgttattgtagaa
tatagcatcgatggtggaatttatgtacctctgatctctttctattcaacaactgacata
gaaaacaaaaagctttacgaagacactaacaatgacgggataggtgacggaactttatta
acaaaaagtttccaagaatttagtaaatccatatccggaaccggaaatcaacttaccatc
cgcctgagagcttattcaaataatactttcactgaagaatgggccgtggataatttcagg
ttatcggctaccgaatcgaatgccgcccctaccgctaccgctccttcagtaccctccgtg
gaggaggatgataccaatgtggccttatccaacgatatccagatcagcgatgcggatgga
gatggccaaacggtgacctttaccattaccgggggaaccctgacgctggggacttccggg
attactttcggtggtggaatgaatggaagcagtagtttcaccgctttaggcaccctggcc
aatatcaatgccgccttggatgccgctacttttacacctactcctgatttatatggcccc
ggggtagcgaccatttcttttatttccaatgatggtacggataactccaataccgcttcg
gttacctttgatattgctggggtaaatgatgatcctaccatcataggtttaccatcctct
atcacggtagaggaagatgcgactgaggatccttttgatatttcagcagccaccatcggc
gatatcgatgcggaaagtggggagttgacaataacactggaagctacaggaggaatattt
gatatagcggccggtacaggaatcaccataacaggtcatatgtctggtttattaacactg
acgggtaatttgacggacttaaacaattatataaatagcccaagcaatatctattttaga
ccagatgccaatcttaatggaaatggagccgcttccgtggaagtgtccataaacgataat
gggaataccggatccgggggaggaaacgatatagccatcgggacggtcagcattgatatc
acccctgtaaacgatgcgcctaccgcaagcggtgtagccattagtggtacattgaccgtt
ggtgaagagctgaatggtacttatacttatgcggatgtggacaatgatgcggaaagcgga
tccacctaccaatggtaccgggctgacgacgatggtggaaccggtaaaaccgctattacc
ggagcggaaaaccaagattacaccctccaggccgcagatcagggcaaatatattagcttt
gaagtgacacccaatgacggtacccttgcaggaaccgcggtagagagcgatttggaaggc
cctgtaaaaatcggacagaccatcactttcccaagtattcctacaaaaacttatggagat
gcttcctttaccttaggtgatgcacagaccgatcagggcttgaccgtaacctatacatca
gatgaccccacagtagtggacatcacaggaaaccaagcgaccattttaacggctggatct
acccaaattaccgccacccagagcggggacgggacaacccaagctgccacgccagtggcc
catacgttaaccgtaaatcaggctactttaacggtaaccgccgatgaccaaagtaaagtc
tatggtgaagctgacccagccttgacggttagctatgacggatttgaaaatggggacgat
gaaagcgatctgggtggcacactcaatgtgagccgagcagccggagaggatgtcggcgac
tatgccatcaacgcttccggccagacttcagccaattataccatcaactatgtggcagga
aacctggaaatcacatcagctactttaacggtaacagccgaggataaatccaaagtctat
ggtgaagctgacccaagtttaacagtcagttatgcgggctttgtcaatggagatgatgca
acagccttgggcggcacattggatttaagcagagcaactggagaggatgtcggcaactat
gcggttatggcatcgggctatagttcatcgaactatatgatcagctatgtagaaggcaac
tttgagattacgcaggcagccttgacagtaaccgccgatgataagtctaaggtttatggt
tccactgatccaggattgaccgttagctatgcaggttttgtgaacggtgatgatgcaaca
gccttgggcggcacattggatttaagcagagcaactggagaggatgtcggcaattatgcg
gttatggcatcgggctatagttcatcgaactatacgatcagctatgtagaaggcaacttt
gagattacgcaggcagccctgacagtaacggccgatgatcagagcaaggtttacggagca
gccgatccaagtctaacagtaagttattcgggatttgtgaatagcgatgatgaaactgtc
ttgggcggcacactggatgtaagccgaactgccggagaggatgtaggtaactatgcgatt
accgcttctggttatacatccggtaactatacgatcagctatgtggatggaaactttgag
atcacgcaggcagccctgacagtaacggccaatggccaaagcaaggtttacggtgaggct
gatggtgctttaacagtaagttattcaggatttgtgaatagtgatgatgcaactgtcttg
ggcggcacactggatgtgagccgtgctgccggagaggatgtaggtaactatgcgattacc
gcttctggttatacttccggtaactatacgatcagctatgtggatggaaactttgagatc
acgaaagcagccttgacagttaccgcagatgaccaaagcaaggtttacggtgaggctgat
ggtgctttaacagtaagttattcgggatttgcgaatggtgatgatgcaactgtcttgggc
ggcacgttggatgtaagccgaactgccggagaggatgtgggcaactatgctattacggca
tccggttatacttccggtaactatacgatcagctatgtggatggcaactttgagatcacc
aaggcagccttgacagtaatggccaatgaccaaaacaaggtttacggtgaggctgatggt
gctttgacagtaagttattcgggatttgtgaatggtgatgatgagacggccctgggcggt
acattggctattagccgaactgccggagaggatgtaggtaactatgcgattactgcttca
ggttatacatccggtaactatacgatcagctatgtggatggcaactttgagataacgaaa
gcagccctgacagttaccgccgatgaccagagcaaggtttacggagcagccgatccaagt
ctaacagtaagttattcgggatttgtgaatagcgatgatgcaactgctttgggcggcaca
ctggatgtaagccgaactgccggagaggatgtgggcacttatgcgattaccgcttctggt
tatacttccggtaactataccatcagctttgtggatggcagctttgagattacccaagca
gccttgaccgttaccgccgatgaccagagcaaggtttacggagcagccgatccaaattta
acagtaagttattcgggatttgtgaatggtgatgatgcaactgtcttgggcggcacactg
gatgtgagccgagcagccggagaggatgtgggcacttatgcgattaccgcttctggttat
acttccggtaactataccatcagctttgtggatggcagctttgagattacccaagcagcc
ttgaccgttaccgccgatgaccagagcaaggtttacggagcagccgatccaaatttaaca
gtaagttattcgggatttgtgaatggtgatgatgcaactgtcttgggcggcacactggat
gtgagccgagcagccggagaggatgtgggcacttatgcgattaccgcttcaggttatact
tccggtaactataccatcagctatgtggatggcaactttgagattacccaagcagccttg
accgttaccgccgatgaccagagcaaggtttacggagcagccgatccaagtctaacagta
agttattcgggatttgtgaatagcgatgatgcaactgctttgggcggcaccttggatgtg
agccgtgcagccggagaggatgtgggcaactatgcgatcactgcttctggttatacttcc
ggtaactataccatcagctatgtggatggcaacttggagataacgaaagcagccttgaca
gttaccgctgatgaccagagcaaggtttacggagcagctgacccaagtttaacagtaagt
tattcgggatttgtgaatggtgatgatgcaacagctttgggcggcacactgaatgtaagc
cgtgcagccggagaagatgtgggtagctatgcgattaccgcttctggttatacttccggt
aactataccatcagctatgtggatggcaacttggagataacgaaagcagccttgacagtt
accgctgatgaccagagcaaggtttacggagcagctgacccaagtttaacagtaagttat
tcgggatttgtgaatggtgatgatgcaacagctttgggcggcacactgaatgtaagccgt
gcagccggagaagatgtgggtagctatgcgattaccgcttccggttatacttccggtaac
tatacgatcagctatgtggatggtaacttggagatcacgcaggcgagcttgaccgttacc
gctgatgagcagagcaaggtttacggtgaggctgatggtgctttaacagtaagttattcg
ggatttgtgaatggtgatgatgcaactgtcttgggtggtacactggatgtaagccgagca
gccggagaggatgtgggcacttatgtaattaccgcttctggttatacatccggtaactat
acgatcagctatgtggacggcaacttggagatcacccaagcagccttgaccgttaccgca
gatgaccagagcaaggtttacggagcagccgatccaagtttaacagtaagttattcggga
tttgcgaatggtgatgatgcaactgctttgggcggcacattggatgtgagccgtgtagcc
ggagaggatgtaggtaactatgcgattacctcttctggttatacttccggtaactatacg
atcagctatgtggatggaaacttggagatcacgcaggcagccctgacagtaacagctgat
gaccaatccaaggtttacggtgaggctgatggtgctttaacagtaagttattcgggcttt
gtaaatagtgatgatgaaactgtcttgggcggcacactggatgtgagccgagcagccgga
gaagatgtgggcaactatgcgatcacggcatcaggctatacttcaccgaactatacgatc
agctatgtggatggcaacttggagatcacgaaggcagtcttgacagttaccgctgatgac
cagagcaaggtttacggtgaaactgatcctgctttaacagtaagttattcgggatttgtg
aatggtgatgatgaaacggccttgggcggtacattggctattagccgaactgccggagag
gatgtaggtaaatatgcgatcattgcctctggttatacttccggtaactatacgatcagc
tatgtggatggcaactttgagattagccaagcagccttgaccgttatcgcagatgaccag
agcaaggtttacggtgagactgatggtgctttaacggtaagttattcgggatttgtgaat
ggtgatgatgcaactgtcttgggtggtacattgacagtaaacagagcagccggagaggat
gtgggcaattatgcgatttcggcatccggttatacttccggtaactatacgatcagcttt
gtagatggcagctttgagattacccaagcagccttgacagtaacggccgatgaccagagc
aaggtttacggtgaggctgatggtgctttgacagtaagttattcgggatttgtgaatggt
gatgatgcaactgtcttgggcggcacattggctattagccgagcagccggagaggatgta
ggcacttatgagattaccgcttctggttatacttccggcaactatacgatcagctatgtg
gatggaaacttcgagatcacgaaggcagccttgacagtatcagccgatgaccagagcaag
gtttacggtgaggttgatggtgctttgacagtaagttattcgggatttgtgaatggtgat
gatgcaactgctttgggcggcacattggctattagccgagcagccggagaggatgtaggt
aactatgcgattactgcctcaggttatacttccggtaactatacgatcagctatgtggat
ggcaacttggagattacccaagcagccctgacagttactgccgatgaccagagcaaggtt
tacggtgaggctgatggtgctttaacagtaagttattcgggatttgtgaatggtgatgat
aaaactgctttgggcggcaccttggctattagccgaactgctggagaggatgttggtaac
tatgcgattaccgcttctggttatacttccggtaactatacgatcagctatgtgaatggc
aactttgagatcacgaaggcagccttgacagttaccgcagatgaccagagcaaggtttac
ggtgaggttgatggtgctttgacagtaagttattcgggatttgcgaatagtgatgatgca
actgtcttgggcggcacattggatatgagccgaactgctggagaggatgttggtaactat
gcgattaccgcttctggttatacttccggtaactatacgatcagctatgtggatggcaac
ttggagattacccaagcagccctgacagttactgccgatgaccagagcaaggtttacggt
gaggctgatggtgctttaacagtaagttattcgggatttgtgaatggtgatgatgcaact
gctttgggcggcacattggctattagccgagcagccggagaggatgtaggtaactatgcg
attactgcctcaggttatacttccggtaactatacgatcagctatgtggatggcaacttg
gagattacccaagcagccctgacagttactgccgatgaccagagcaaggtttacggtgag
gttgatggtgctttaacagtaagttattcgggatttgtgaatggtgatgataaaactgct
ttgggcggcaccttggctattagccgaactgctggagaggatgttggtaactatgcgatt
accgcttctggttatacttcatctaactatacgatcagctatgtgaatggcaactttgag
atcacacaggcgagcttgacagtatcagccgatgaccagagcaaggtgtatggaacagta
gatcctatattgagttatactgcttccggctttgtcaatggagatgatgacggcattttg
acaggaggactgagtagggctgccggagaagacatcggagtttatgccatcaatttgggc
agcttgtctgctggagataattataatattgtttaccaagcggccagccttaccatactg
gccagaaaaatagaggaggtttacgaacctactgcggttaccgtggactggggaatcgat
ttggtcgaaatacctttgcctgaaacagtattggtgagaaccgaacaagatgaattcatt
aatctggaggtgaattggaatgtatccacagtggataccaggaacaggggagcttaccgt
ataacggggaccttacaactaccaggaaccatcttgggagaaggactacctgtaccgttt
atgtttgtcaatgtaaatgccaagccggccccagtggaccttgtccttgacaataacagt
ttcgaggcccagaacggccctgtagcgataggcagcatcacggtggtggatccagtggat
aaccaacatgttttggaacttgtttccggagcagcggacaatggctatttctccctttct
ggcaacagcctgtactgggacagccaggaagcattggcgggcagaactgctttctcggtc
gaggtgatggtggtggatgccgatggcaatacactttccaaggtctttgaggtcaacagg
ctgagaaaatccctgaacgatatcgtgatctacaataccttcagtccaaatgaagacggt
accaatgatacttggggtgttgaggagctcaggtaccagaccggtgtaaggatcatgata
tttgaaaaaagtggtaacaggctcttctataccgaaaatcctgaaaaaaggtgggatgga
acctataagggcaaggaaatggcagtagggagctatttctgggtaatcgagtccaaggaa
gatgataaggtacgaagaggcacccttaatttattgaaatga
DBGET
integrated database retrieval system