Candidatus Johnevansia muelleri: CEM_009
Help
Entry
CEM_009 CDS
T03696
Symbol
carB
Name
(GenBank) Carbamoyl-phosphate synthase large chain
KO
K01955
carbamoyl-phosphate synthase large subunit [EC:
6.3.5.5
]
Organism
eme
Candidatus Johnevansia muelleri
Pathway
eme00220
Arginine biosynthesis
eme00250
Alanine, aspartate and glutamate metabolism
eme01100
Metabolic pathways
eme01110
Biosynthesis of secondary metabolites
eme01240
Biosynthesis of cofactors
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eme00001
]
09100 Metabolism
09104 Nucleotide metabolism
00240 Pyrimidine metabolism
CEM_009 (carB)
09105 Amino acid metabolism
00250 Alanine, aspartate and glutamate metabolism
CEM_009 (carB)
00220 Arginine biosynthesis
CEM_009 (carB)
Enzymes [BR:
eme01000
]
6. Ligases
6.3 Forming carbon-nitrogen bonds
6.3.5 Carbon-nitrogen ligases with glutamine as amido-N-donor
6.3.5.5 carbamoyl-phosphate synthase (glutamine-hydrolysing)
CEM_009 (carB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CPSase_L_D2
CPSase_L_D1
CPSase_L_D3
ATP-grasp
ATP-grasp_3
ATPgrasp_Ter
ATP-grasp_4
MGS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CDZ16285
UniProt:
A0A078KH64
LinkDB
All DBs
Position
I:12832..16098
Genome browser
AA seq
1088 aa
AA seq
DB search
MSKRNDIKSVLIIGSGPIVIGQACEFDYSGAQACKALQEENIKIILINSNPATIMTDPGM
ADVTYIEPINFQSIYQIINKEKPDAILPTMGGQTALNCALNLHNLGILKKFNIEMIGANV
NAILKAENRAKFDLAMKKIGLECPKSGIAHNMEEACNIISYIGFPCIIRPSFTMGGSGGG
VAYNIKEFKNICKNGFKLSPIHELLIDESLLGWKEYEMEVVRDKKDNAIIVCTIENFDPM
GIHTGDSITIAPAQTLTDKEYQIMRNASIAVLREIGVENGGSNVQFGINYKTGRMIVIEM
NPRVSRSSALASKATGFPIAKIATKLALGYTLNELKNDVTGGLTPIYFEPVLDYVVTKVP
RFNFEKFPKANKILTTQMKSIGEVMSIGRNFKESLQKALISLEIGVTGIHSNLISLNIKN
YYYKIKQELKYPGYDRIFYISYGFKYGMSINEIFNLSKIDKWFLNQIKEIVTVDQHIFNH
KFSTINYNNLFNYKKQGFSDARLAELLNITENSLRNYRHNLNIYPVYKTVDTCSGEFPNF
TNYLYSTYEEECEIKISNKKKIIILGGGPNRIGQGIEFDYCCVHATLALQECGYEIIIIN
CNPETVSTDYDISDRLYFEPLTFESIIEIIIKEKPIGVIIQFGGQTPLKLSNSLYKAGVK
ILGTIPDVIDTCENRERFKKLIQNLNLLQPKNIIAYNIKEANDRVKNFLGYPLIIRPSYV
LGGRAMEIIYNNIELNYYFINNNEITNKNPILLELFLNNAIEIDIDVISDGKQVIIGGLM
QHVEYAGVHSGDSACSLPAYFLSQKIQNKIREQIKIIALELNIIGMMNVQVALKDNQIYI
LEVNPRASRTIPFVSKCIGISLTQIAALCMIGITLSQQNFTEEILPKLYCIKEAILPFYK
FPGVDPILSPEMKSTGEVMGIGSSFEEAYYKTQLESNKFLLKVNYKDIVLIYIQNCDIKF
IIKICKLLISLGFTLIVMGINARLLLKYKIPVIFISNIIKGVTNICNILKLNKINYIINI
MESKIEIKKTFIIRCTALINQITLITTLPALLANCIAINSYNNIYIKNLSDLYKKNNMPI
PGFEPGTY
NT seq
3267 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctaaacgtaatgacattaaaagtgttctgataataggatcaggacctatagtaatt
ggtcaagcatgtgaatttgattattcaggggcacaagcctgtaaagctttacaagaagaa
aatattaaaattatattaattaattctaatccagctactattatgactgaccccgggatg
gcagatgtaacatatattgaacctattaattttcaatcaatttatcaaataataaacaaa
gaaaaacctgatgctatattacctactatgggggggcaaacagctttaaattgtgcatta
aaccttcataatttaggtatactaaaaaaatttaatatagaaatgatcggggccaatgta
aatgccattttaaaagcagaaaatcgtgctaaatttgatttagctatgaaaaaaatagga
ttagaatgtcctaaatctggaattgctcataatatggaagaagcatgtaatattatatca
tatataggatttccttgtattatacgtccctcttttactatgggtggatctggaggagga
gtagcttataatataaaagaatttaaaaatatttgtaaaaatggttttaaattatcacct
atacatgaattattaattgatgaatctttattgggttggaaagaatatgaaatggaagta
gtacgtgataaaaaagataatgcaattattgtttgtacaattgaaaattttgatccaatg
ggtatacatactggtgattcaataacaattgctccagcccaaacattaacagataaagaa
tatcaaattatgcgtaatgcttcaatagcagtattacgtgaaataggtgttgaaaatgga
gggtcaaatgttcaatttggtataaattataaaactggacgtatgatagttatagaaatg
aatccacgtgtttccagatcatctgcattagcatctaaagcaactgggtttcctattgct
aaaatagcaactaaattagctttaggttatacattaaatgaattaaaaaatgatgttaca
ggtgggttaacacctatttattttgaacctgtattagattatgtagttactaaagttcct
cgttttaattttgaaaaatttcctaaagctaataaaattttaacaactcaaatgaaatct
attggtgaagtaatgtcaataggtcgaaattttaaagaatctttacaaaaagcactaatt
agtcttgaaataggtgtaactggaatacattcaaatttaatctccttaaacattaaaaat
tattattataaaataaaacaagaattaaaatatccaggatatgatcggatattttatata
tcatatggatttaaatatggaatgtctataaatgaaatttttaatttatctaaaatagat
aaatggtttttaaaccaaataaaagagatagtaactgttgaccaacatatttttaatcat
aaattttcaaccattaattataataatttattcaattataaaaaacaaggatttagtgat
gcaagattagcagagttgttaaatataactgaaaattctttaagaaattatagacataat
ttaaatatttatccagtatataaaactgttgatacttgttcaggtgaatttcctaatttt
acaaattatctatattctacttatgaagaagaatgtgaaataaaaatatcaaataaaaaa
aaaataattatattaggtggaggaccaaatagaattggtcaaggaattgaatttgattat
tgttgtgttcatgcaacattggcattacaagaatgtggttatgaaataattattataaat
tgtaatcctgaaacagtttctactgattatgatataagtgatcgtctttattttgaacca
ttaacatttgaaagcataattgaaattataattaaagaaaaaccaataggtgtaataatc
caattcggtgggcaaactccattaaaattatcaaattctctttataaagcaggagtaaaa
attctaggtacaatacctgatgttatagatacatgtgaaaatagagaaagatttaaaaaa
ctaatacaaaatttgaatttacttcaaccaaaaaatataattgcatataatataaaagaa
gctaatgatagagttaaaaattttttaggttatccattaataattagaccttcttatgtt
ttaggaggtcgtgctatggaaattatttataataatattgaattaaattattattttatt
aataataatgaaattactaataaaaatcccattttattagaactgtttcttaataatgca
attgaaattgatattgatgtaatttcagatggtaaacaagttattataggtggtttaatg
caacatgtagaatatgctggagttcattctggagattcagcttgttctttacctgcttat
tttttatctcaaaaaattcaaaataaaattagagaacaaattaaaataatagccttagaa
ttaaatattattggtatgatgaatgtacaagttgctttaaaagataatcaaatttatatt
ttagaggtaaatcctagagcttcacgtacaataccatttgtttcaaaatgtattggtata
tctttaactcaaattgctgcactttgtatgataggtattactctttcgcaacaaaatttt
acagaagaaatactccctaaattatattgtattaaagaagcaattttacctttttataaa
tttcctggtgtagatccaatattatcaccagaaatgaaatctactggtgaagttatggga
attggttcttcttttgaagaagcatattataaaacacaattagaatcaaataaatttctt
ttaaaagtaaattataaagatattgttttaatttatattcaaaattgtgatataaaattt
attataaaaatatgtaaattactaatatcattaggatttacattaatagtaatgggtatt
aatgctcgtttattattaaaatataaaatacctgttatatttatatctaatataataaaa
ggtgttactaatatttgtaatatattaaaattaaataaaattaattatattattaatatt
atggaaagtaaaattgaaattaaaaaaacttttattataagatgtactgctttaataaat
caaataacattaataacaacgttaccagcattattagctaattgtattgctattaattct
tataataatatatatattaaaaacctttctgatttatataaaaaaaataatatgccaata
ccaggattcgaacctggaacctactga
DBGET
integrated database retrieval system