Candidatus Johnevansia muelleri: CEM_359
Help
Entry
CEM_359 CDS
T03696
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
eme
Candidatus Johnevansia muelleri
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eme00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
eme03032
]
CEM_359 (gyrA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
eme03400
]
CEM_359 (gyrA)
Enzymes [BR:
eme01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
CEM_359 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:
eme03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
CEM_359 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
eme03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
CEM_359 (gyrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
Beta-prop_HPS5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CDZ16599
UniProt:
A0A078KIJ0
LinkDB
All DBs
Position
I:345572..348058
Genome browser
AA seq
828 aa
AA seq
DB search
MIKNFIKIDIEDELKKSYLDYAMSVIIGRALPDVRDGLKPVHRRILFAMYKLKNFWNRSF
LKSARVVGNVIGKYHPHGDNAVYDTIVRMAQKFSMRYLLIDGQGNFGSIDGDSAAAMRYT
EIRMNYITNELLVDLDKETVDWVNNYDNSEIIPKIFPTRIPNILINGSSGIAVGMATNIP
PHNLCEVINACLALIDESTLSINYLIKNYILGPDFPTAGIIVGKSGIIEAYKTGKGCIYI
RAKYIINFNKKYFRDIIIITELPYQVNKSKLIEKIVSLIKEKRIEGIYEVRDESDKNGLR
IIIEIKKGKSGNVIINNLFYLTQLETLFYINMIALDEFGKPKKFNLKEVIKSFIDHRKEI
IIRRSIYELNQSEIHVHLIEGLIVAIYNLDEIIKLIKLSSSLKEAKLKLINRKWNLSKEI
IEIFIEKRETYIYCITEKQALAILDLRLHSLTSIEIQKLLYEYDVLLNIVKKLKLILSSN
IILMEVIKKELNFIKKEYGDIRRTEIKNNRVNFTTQDLIYDEYMVCTIYSSCYAKTQPIS
ILKNKKIGFKINLLKNKNEDLIQHFLIASKHETIFFFSNKGKLYCLKIYEIPEASKISRG
IPIINLLSMNKTEQITAILSIKKYKKDSNILLATSLGKVKRINIDKFSRTRSSGLIAIKL
DKGDSLISAAITYGNNNVILITSYGNLILFDEKSILLMERYTYGMIGISLNKNDRVISLI
IPNNKTCYILFAYENGFCNFKKIENFYITNMGGQGIISMQISKRNGLLVSAIQVYKNDKI
IIITNKGNIIILKLNESKINSKGFILISMINQEKLVTIVRWDDNILKL
NT seq
2487 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaaaactttataaaaatagatatagaggatgaattaaaaaaatcttatttagat
tatgctatgagtgttattattggtagggcgctacctgatgtacgtgatggattaaaacct
gtacatcgtagaatattatttgctatgtataaattaaaaaatttttggaatagatctttt
cttaaatcagcacgtgtagtaggtaatgtaattggtaaatatcatcctcatggtgataat
gcagtatatgatactattgtacgaatggcacaaaaattttcaatgcggtatttattaatt
gatggtcaaggtaattttggatctattgatggtgatagtgcagctgcaatgagatatact
gaaatacgtatgaattatataacaaatgaattactagttgatttagataaagaaactgta
gattgggttaataattatgataattcagaaattattccaaaaatatttcctactaggatt
cctaatatattaattaatggatcatcaggtattgctgtaggtatggctactaatatacct
ccacataatttatgtgaagtaattaatgcttgtttagctttaatagatgaatctacttta
tctattaattatttaataaaaaattatattttagggcctgactttcctactgctgggatt
atagttggtaaatcaggtataattgaagcttataaaacaggtaaaggatgtatttatata
cgtgcaaaatatataattaattttaataaaaaatattttagagatataataataattact
gaattgccttatcaagtaaataaatctaaacttattgaaaaaatagtttctttaataaaa
gaaaaaagaatagaaggaatttatgaagttcgtgatgaatcagataaaaatggattacgt
attataatagaaattaaaaagggaaaatctggaaatgtaataattaataatctattttat
ttaacacagcttgaaacattattttatataaatatgattgcattagatgaatttggtaaa
cctaaaaaatttaatttaaaagaagttattaaatcttttatagatcatcgtaaagaaatt
ataatacgtaggtcaatatatgaattaaatcaatcagaaatacatgttcatcttatagaa
ggattgatagtagctatttataatcttgatgaaattataaaattaataaaattatcatca
tctcttaaagaagcaaaattaaaattaattaatcgtaaatggaatttatcaaaagaaata
attgaaatttttattgaaaaaagggaaacttatatatattgtataacagaaaaacaagct
ctagcaatacttgatttacggttacatagtttaactagtattgaaattcaaaaattatta
tatgaatatgatgttttattaaatatagttaaaaaattaaaacttattttatcttctaat
ataatattaatggaagttattaaaaaagaattaaattttataaaaaaagaatatggtgat
attagacgtactgaaattaaaaataatcgtgtaaattttaccacccaagatttaatttat
gatgaatatatggtttgtactatttattcttcttgttatgcaaaaactcaacctatttca
attttaaaaaataaaaaaattggatttaaaataaatttattaaaaaataaaaatgaagat
ttaatacaacattttttaatagcgtccaaacatgaaacaatattttttttttctaataaa
ggaaaattatattgtctaaaaatttatgaaatacctgaagctagtaaaatttctagaggt
attccaataataaatttattatcaatgaataaaactgaacaaattacagctatattatct
attaagaaatataaaaaagatagtaatatattattagctactagtttaggaaaagtaaaa
cgtataaatattgataaattttctcgtactaggtcttcgggacttatagcaattaagtta
gataaaggagatagtttaattagtgcggccattacatatggtaataacaatgttatattg
attacatcatatggaaatttaattctttttgatgaaaaatctatacttcttatggaaaga
tatacttatggaatgataggtattagtttaaataaaaatgatagagtaattagtttaatt
attcctaataataaaacttgttatattttatttgcatatgaaaatggtttttgtaatttt
aaaaaaattgaaaatttttatattacaaatatggggggacaaggaatcatttctatgcaa
atatccaaacgtaatggtttattagtatctgcaattcaagtttataaaaatgataaaatc
ataattattactaataaaggtaatattataatattaaaattaaatgaatctaaaattaat
agtaaaggttttatattaattagtatgataaatcaagaaaaattagttactattgtaaga
tgggatgataatatattaaaattataa
DBGET
integrated database retrieval system
