Elizabethkingia meningoseptica: BBD33_06810
Help
Entry
BBD33_06810 CDS
T04744
Name
(GenBank) capsule biosynthesis protein CapD
Organism
emg
Elizabethkingia meningoseptica
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Polysacc_synt_2
Epimerase
GDP_Man_Dehyd
RmlD_sub_bind
3Beta_HSD
KR
adh_short
NAD_binding_4
Sacchrp_dh_NADP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQX04972
LinkDB
All DBs
Position
1476603..1478537
Genome browser
AA seq
644 aa
AA seq
DB search
MNKIKYAQRRVYSGNNLVNLTDIRYLPRWIVLFIDVLILIFSLTLSFVIVEALNVKPYPS
ISIFQKFVMVISVNVLFMYMFKTYSGIIRHSTFMDLFKLFMASVCTTVVVIVINYSYFAI
TGFHLILIPLLGFYFATSFAFLFLFRLVVKESFHMLREYKRSSLKKRILVLGIGEESIAM
AGAILDNPSLPYYVEGFLTQRYDTTNAKILGKPIYTKEKLESLPEEDIDVEGVLIIKENL
SRDEMNMWVNLFLEKGLLVLKAPSVQKLRDNDLGTNIKSLQIEDLLNRKPIKLDNEEVKK
RHFNKSVLVTGGAGSIGSEIVRQVAQFNPSLIVVLDQAETPLYEIELEMREKFPHVQFRF
VLADISNRHRLERLFQKYEFSMVYHAAAYKHVPLIEENPHEAILVNVLGSKNLACLSSKY
KVNRFVMVSTDKAVNPTNVMGASKRTAELFVQALQNTDGNTTKFITTRFGNVLGSNGSVI
PHFKKQIEKGGPITITHPEIVRYFMTIPEACELVLQAGTMGHGGEIFVFDMGEPVKILDL
AKRMIKLSGFEPETDIKIIYTGLRPGEKLYEELLSDNTKNLPTHNEKIMISKDPNMEYRS
IELLANQVTKAAVRRDKLEVVRQLKIIVPEFKSNNSMFEVLDKQ
NT seq
1935 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaataaaatatgcgcagcggagggtttactcaggaaataatttggtaaatctt
acggatatacgatatctgccccgttggatagttctttttattgacgtcctgattcttatt
ttctcgctgacactttcctttgtaattgttgaagcgctgaatgttaagccttatccttcc
attagtatatttcagaagtttgtaatggtgatttccgtgaatgtactcttcatgtatatg
ttcaaaacttattccggcattatcaggcattctactttcatggacttgttcaaattattt
atggcaagtgtatgtactacagttgtggttattgtgattaattatagctactttgcaatt
actggttttcatttaattcttattccgcttttaggtttttattttgcaacttcatttgct
tttctgtttttattcagacttgtagtgaaagagtcttttcatatgctgcgggaatacaaa
agaagttcccttaaaaagagaattttagtacttggaattggagaagaatcgatcgcaatg
gctggtgctatattagataatcccagcttaccctattatgttgagggtttcttaacccaa
cgctacgatactacaaatgctaaaatattgggtaaacctatttatactaaggaaaaatta
gagtctttaccagaagaagatatagatgttgaaggggttcttattattaaagaaaatctt
tcccgtgatgaaatgaatatgtgggttaatttatttcttgaaaagggattattggttctt
aaggcaccttctgtacagaaattaagagataatgatttaggtaccaatattaaaagtctg
cagattgaagatttattgaatcgtaagcctataaaactggataacgaagaagttaagaaa
cgacattttaataagagtgttttagttaccggtggtgcaggttctattgggagcgaaatt
gttcgtcaggttgctcagtttaacccttcactgattgttgtattagatcaggcagaaacg
ccattatatgaaatagagcttgaaatgagagaaaagtttcctcatgtccagttcaggttt
gttctggcagatatttcaaacaggcatagactggaacgattatttcagaaatatgagttt
tctatggtatatcatgctgctgcctataaacatgtacctcttattgaagaaaatccacac
gaagcaatattggttaatgtattaggatctaaaaatttggcgtgtttatccagtaaatat
aaagtaaaccgctttgtaatggtttctactgataaagcggttaatcctacaaatgtaatg
ggagcatctaaaagaacagcagagctttttgttcaggctttgcaaaatacagatgggaat
acaacaaaattcattacaactcgttttggaaatgttttaggatctaatggttcggtaata
cctcattttaaaaaacaaatagaaaagggagggcctataactattacccaccctgaaatt
gtacgttattttatgacaattcccgaagcttgcgaattggtattacaggcaggaacaatg
ggacatggaggagaaatctttgtttttgatatgggagagcctgtgaaaattttggatctt
gcaaaacgtatgattaaactttcgggttttgaacctgaaacagacattaaaattatatat
acaggcttaagaccgggagagaaattatatgaagaactattaagtgataatacaaagaat
ttgcctactcataatgaaaaaatcatgatttccaaagatccaaatatggagtacagaagc
atagaattactagcaaaccaagttactaaagctgctgtgcgaagagataaattggaggta
gtacgtcagttaaagataattgtacctgagtttaaaagtaataattctatgtttgaagtt
cttgataaacaataa
DBGET
integrated database retrieval system