Elizabethkingia meningoseptica: BBD33_14935
Help
Entry
BBD33_14935 CDS
T04744
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
emg
Elizabethkingia meningoseptica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
emg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
emg02000
]
BBD33_14935
Transporters [BR:
emg02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
BBD33_14935
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQX07098
LinkDB
All DBs
Position
complement(3307871..3310651)
Genome browser
AA seq
926 aa
AA seq
DB search
MKKNILTEKKSKVVLTASVLFFVGLGQVYGQETKKDSIKDKSIDEVVLVGTRSAGRSKAD
SPVPVDVFNLKETSLVLPQTNINQILNSIAPSFTSTVQTNADGTDHLDPAQLRGLGPDQV
LVLINGKRRHTSALINVNGSPGRGTVGTDLNAIPSFALSRIEVLRDGASAQYGSDAIAGV
MNLQLKRDTGKLTGQVSYGGYLTPAAKDHRGDWDGDQIQVDLNYGAKVGNKGGFVNVTFS
SQYRNPTFRAGVESGNIYNAYNAIEKRAAQGGVNLSSYFSNIGQIKGTPAEQQFVGLVHQ
YAQQVGYFDNAFQQKIQGAGTISALQGILNADYTNHELAYRGQDRRDFNMWVGQSKLNNN
QIFVNAEIPLSDSWKVYTFGGYGYRYGTSGGFYRKPNQARTFTGLYPDGYLPKINTDIQD
ISLSAGVKGTWDGWSVDFSNTFGQNSFDYTITNTGNTSLRFNSPSKFDAGGLKFLQNTIN
LDFSKKFDVLEGLNFAFGGEQRHENFKINEGEPASYLTYDVNGNPVTDYVNQTRPTDFFG
NALPGGSQVFGGYRSVNAVSKDRNSYAAYVDAEVNFTKWLLVDGAVRYENYSDFGNTVNF
KLASRVKLNKDLNLRFAGSTGFRAPSIHQIYYNTTSSLYVTVPGNPVGEIQEVGTFSNDS
DIARGFGIPKLKQETSQSVSAGFTYKIPSLNLNITADGYWIKVKNRIVLTDLFSKFKGAN
LTPEQQEVNNTMNALGVDGAQFFANAIDTETRGVDVVISHTYRTGGFSLKNDFAVNLNKT
KRVGDIHSSDLLHNAGLDNVYFSEKSRVYLEESVPRVKASLAHTLQFGKFDVYLRNTYYG
KVSGADIIVQPDTHQIMSDRVITDLSVAYGFSKNVSLTLGANNLFDVYPSRNLPVSSNND
QFVYTRSTSQFGMNGRYVFTRLNFNF
NT seq
2781 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atcaagaaaaacattttgacagaaaaaaaatccaaagttgttcttacagcttcagttctt
ttttttgttgggttggggcaggtatatggccaggaaactaaaaaagacagtataaaagat
aaaagtattgatgaagttgttctggtaggtacgcgttcagcgggcagatccaaggcagac
agccctgtaccggtagatgtgttcaatcttaaagaaacgtctctggtgcttccccagact
aatattaatcagattcttaattctattgcaccttcttttacttctacggtgcaaaccaat
gccgacggaacagatcacctggatcctgctcagttaagaggcttgggaccggatcaggta
ttggtgcttattaacggaaaaagacgtcatacttccgcattaatcaatgtaaatggttct
ccgggaaggggaacagtaggaactgaccttaatgcgattccttcgtttgcgttaagcaga
attgaagtattacgtgatggtgcttctgcacaatacggttcggatgctattgcaggtgta
atgaaccttcagctaaaaagagatactggtaagcttaccggacaggtgagctacggtggt
tacttaacgccagccgctaaggatcacagaggtgactgggacggagatcagattcaggtt
gatctgaattatggtgctaaagttggtaacaaaggtggatttgtgaatgttactttttct
tcccagtacagaaacccaactttcagagcaggtgtggaaagcggaaacatttacaatgct
tataatgctattgagaagagagctgcccaaggtggtgtaaacctttcttcctacttttcc
aatattggtcagatcaaaggaacacctgcggaacagcagttcgtaggtttggtacaccaa
tatgcacagcaggtgggttattttgataatgcttttcagcagaaaattcagggtgcggga
actatttctgcacttcagggaattttaaatgcggattacaccaatcatgagttggcttac
cggggacaggacagacgtgattttaacatgtgggtagggcagtccaagcttaacaataat
cagatttttgttaatgcagaaatccctttaagtgacagctggaaagtatatactttcggt
ggatatggctaccggtatggtacttccggaggtttttacagaaagcctaaccaggccaga
accttcaccggactttatcctgacggttacctgcctaagatcaatacggacattcaggat
atatcattatctgccggagttaaaggaacatgggacggctggagtgttgatttcagtaat
acgtttggacagaattctttcgactatacaattaccaatacagggaatacaagtttgaga
tttaactctccaagtaaatttgatgcaggtggactgaagttccttcaaaatacgattaac
ctcgattttagtaagaaatttgatgtactggagggcttaaactttgcttttggaggggaa
cagagacatgaaaacttcaaaattaacgaaggggaaccggcttcataccttacttatgat
gtgaacggtaatcctgtaacagactatgtgaatcagacacgcccgacagactttttcggt
aatgcattaccgggaggctcacaggtgtttggcggatacagaagtgtaaacgctgtaagc
aaagaccgtaattcttacgcggcatatgtagacgcggaagttaattttacaaaatggcta
ttggtagacggcgctgttcgttatgaaaactattctgactttggtaataccgtgaatttt
aaactggcatccagagtaaaattaaataaagatcttaatcttagattcgcaggatctaca
ggattcagagcaccatctattcaccagatttattataatacaacatccagcttatatgtt
accgttcccggaaatccggtaggagaaattcaggaggtaggaacattcagtaacgattct
gatattgcaagaggttttggaattccaaagctgaaacaggaaacctctcagtcggtaagt
gcaggatttacgtataaaattccaagcttaaacctgaacattacagcggatggttactgg
ataaaagtaaaaaacagaattgtgttaactgacttgttttcgaaattcaaaggagcgaac
ctaacaccggagcaacaggaggtaaacaatacgatgaacgctttgggagttgacggcgct
cagttttttgccaatgctattgatacggaaacaagaggggtagatgtggtgatcagtcat
acttacagaaccggcggattctctttaaagaatgattttgccgttaacctgaataaaaca
aaaagagtaggcgatattcattcttcagatcttttgcataatgcgggactggataatgtt
tacttttctgaaaaatcccgagtatatctggaagaatctgtgccaagggtaaaagcgagt
cttgcacacacgttacaatttggaaaatttgatgtgtacttaagaaatacctactatggt
aaagtaagtggtgctgatattattgtacagccagatacacatcagattatgtctgaccgg
gtaattacagatttatcggtagcttatggcttcagtaaaaatgttagcttaaccctgggc
gccaataacttatttgatgtttatccttcaagaaacttaccggtatcatctaacaatgac
cagtttgtgtatacaagatcgacttcgcagtttggaatgaacggacggtatgtctttaca
agacttaattttaatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system