Entomomonas moraniae: DM558_10665
Help
Entry
DM558_10665 CDS
T06727
Symbol
hrpA
Name
(GenBank) ATP-dependent RNA helicase HrpA
KO
K03578
ATP-dependent RNA helicase HrpA [EC:
5.6.2.6
]
Organism
emo
Entomomonas moraniae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
emo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
emo03019
]
DM558_10665 (hrpA)
Enzymes [BR:
emo01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.6 RNA 3'-5' helicase
DM558_10665 (hrpA)
Messenger RNA biogenesis [BR:
emo03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
Other RNA degradation factors
Others
DM558_10665 (hrpA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3418
OB_NTP_bind
Helicase_C
HA2_C
DEAD
HA2_N
AAA_19
nSTAND3
AAA_22
NACHT
T2SSE
AAA_25
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZS51200
UniProt:
A0A3S9XFN7
LinkDB
All DBs
Position
complement(2257877..2261812)
Genome browser
AA seq
1311 aa
AA seq
DB search
MITERKLDNALLERLDQTMIADRYALRRDFFALKKRFDEKKMAQWIERLQSSSQKVLNRK
QSIPTIHYDDSLPIAAKREEIKKAILDNQVVIIAGETGSGKTTQLPKICLEIGRGIHGMI
GHTQPRRLAARSVGNRVADELGTPFGGLVGYQVRFEDKSTDETLIKLMTDGILLSETQHD
RFLNRYDTIIVDEAHERSLNIDFLLGFLKVLLLKRPDLKLIITSATIDLDRFSKHFNDAP
IIEVSGRTYPVDTWYRPLVSELDSEGNALEEDLSVDQGIIAALSEVEKFEKMNQRSAGDV
LVFLPGEREIRDSADILRKANLRDTEVLPLYARLTPAEQQRIFQPAQTGRRIVLATNVAE
TSLTVPGIRYVIDSGVARISRYSYRAKVQRLPIEAISQASANQRKGRCGRVEAGVCIRLY
SEEDFLSRPLFTDPEILRTNLAAVILQMLHLRLGQIEDFPFIEPPESKAIKDGFTLLQEI
SAVTLKGDLTNLGHQLARLPIDPRLGRMLIEGSRCGVLDELLIISSALSVQDPRERPIEK
QQAADQAHAQWKDPDSDFAALVNLWRGFEEQRQALGANQLRSWCRRNFLNYLRLREWRDA
HRQLLLICREMKLLTHQKTGVNHHESNVNYDAVHRAVLSGLLSHIGQKTEDNDYLGARQK
RFWIHPSTGLAKKGPQWAMAAELVETTKLFARIVAKIDPVWLETLAQHLLKRTYLEPHWE
KKRGQVVAFEQVTLYGLIIVGRRAVHYGPHDPVIARELFIREGLVRGEIISKTKCLEANR
QLMERLDDLEAKARRRDIIADEETLYQYYDQYIPQDIYQTASFDKWYQRESKINPKLLIM
TEADALARTADEVTTNQFPDSLELNGLTLSLSYVFEPGNPRDGVTIKVPAPLLPQLSKER
LNWLVPGLLEQRAIALVRNLPKSIRKNFVPVPDFVKAALATIPFAHDSLYQALGQQLLRM
TGVRIPDEAWLEAEEGLDDYLRMNIEVVDSLAKRLGEGRDLEALVIRFTKESQAALAIPK
EKQVNKTVEAKHFDVLPTTQQHKVAGLSMTVYPALFEENSIVKEGRFSTQAEANYQHRRA
LQRLLLQQLAEQSKFLRNKLPLQTELGLYFKDFGRLDGLLDDILLASVDETILADEAILP
RDAASLAVLAEQKRGAWFDNADLLVRLIANILNLYHGLQKYLKGKIDLSHAVSLADIKQQ
LANLVNLHFVRDTPLEWLKEYPRYLKAIEQRLVKLPTQLQKDRVYSAELSEYWHLYQEKR
DKHLKEGRRDTALFLYRWMIEEYRVSLFAQQLGTKFPISDKRLKKQWQLVD
NT seq
3936 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataactgaaagaaaattagataatgctttgttggagcgtcttgatcaaacaatgatc
gctgatcgttatgctttgcgtcgagatttttttgcgttaaaaaaacgttttgatgaaaag
aaaatggcgcaatggatagaaagattacaaagctcctcacaaaaagtattaaatagaaag
caaagcattcccactattcattatgatgatagtttacctattgcagcaaaaagagaagag
ataaaaaaggccatactagataatcaggtagttattattgcaggggaaacagggtcaggt
aaaacgacacaattgcctaagatctgtctggaaataggccgtggtatccatggaatgatt
ggacacacgcagccaagaagattggctgctcgtagtgtaggaaatcgtgtagcagatgag
ttaggaactcctttcggcggtttggttggctatcaggttcgatttgaagataagagtact
gatgagacactcattaaattaatgacagatggtattttactatcagaaactcagcatgat
cgttttttaaaccgctacgacactattattgttgatgaggcacacgaacgtagtttaaat
atcgattttttgctcggattcttaaaagttttattacttaagcgacctgatttaaagttg
ataataacctcagcaactattgatttggatagattttcaaagcattttaatgatgcgcct
attattgaagtatcaggacgtacatatcccgttgatacatggtatcgcccgctagtcagt
gagttggacagtgaaggaaacgctttagaagaagacttgtcggtagatcagggtattata
gcggcgctttctgaggtagaaaagtttgaaaaaatgaatcagcgctcagccggtgacgtt
ttggtttttttacccggtgagcgtgagattagagattcagccgatattttgcgtaaagct
aatttaagagatacggaggttttaccgctgtatgcaagattgaccccagctgagcagcaa
cgtatttttcaaccggcccaaacaggtcgtcgtatcgtattagcaacaaacgtggcagaa
acatctttgactgttcccggtattcgttatgttatcgacagtggtgttgccagaattagc
cgttatagctatcgtgctaaagtacaacggcttcctattgaagcgatttctcaagccagt
gctaatcagagaaaagggcgttgtggtcgggttgaggcgggggtttgtattcgtttgtac
agtgaagaggattttttaagtcgcccactttttactgaccctgagattttacgtacgaat
cttgcggcagttattttacaaatgctccatcttcgattagggcaaattgaagattttcct
tttattgagccgccggaaagcaaagcgattaaggatggttttacgctattgcaagaaatt
tctgccgttactttgaagggagatttgactaatttagggcatcaattagcacgtttaccc
atagacccacgtttggggcgtatgttgatagaaggttcgcggtgcggtgttttagatgaa
ttattgattattagcagtgcgctttctgttcaagatccgagagagcgacctatagaaaag
caacaagctgccgaccaagctcatgctcaatggaaagatccagactctgattttgcagcg
ttggttaatttatggcgcggctttgaggaacaacgtcaggcattgggtgctaatcagtta
agaagttggtgtcgtagaaattttttaaattatttgcgtttgcgtgagtggcgagatgcg
catcggcagttattattaatttgtcgagaaatgaagttattaactcaccaaaaaacgggt
gttaatcatcatgaatctaatgttaattatgatgcagttcatagagctgttttatcaggg
ttattaagccatattggtcagaaaacagaggacaatgattatttaggtgctagacaaaaa
cgtttttggattcatccctcaacggggttggcaaaaaaagggccgcagtgggctatggct
gctgagttggtggaaaccacaaaattgtttgcgcgtattgttgctaaaatagatcctgta
tggttagagactctggctcagcatctattaaagcgaacttatttagagccacactgggag
aagaaaagagggcaagttgttgcctttgaacaagtgactttatatgggttgattattgtg
ggacgccgagctgttcattatggtcctcatgatcctgttattgctcgagagctatttatt
cgagaaggcttggtaagaggtgagattatatcgaaaacgaaatgtttggaggctaatcgc
cagctaatggagcgtctagatgatctcgaggctaaagcccgtcgccgtgatatcattgcc
gatgaagaaacgctttatcagtattatgatcagtatataccacaagatatttatcaaaca
gcaagttttgataagtggtatcaacgtgagagtaagataaatcctaaactactgataatg
acggaagcagacgctctagcgagaaccgccgatgaggtaacgacaaaccagtttcctgat
agcttagagttgaatggtttgacgttatcgttgagctatgtttttgagccaggtaatcca
cgtgatggtgtaaccataaaagttcctgcgccacttttaccccagttgtctaaagagcgt
cttaattggctagttccgggactattggaacagcgcgcaattgcgttagtgcgtaactta
ccaaaatctattcgtaagaattttgttccagttcccgattttgttaaagcagctttggca
acaataccctttgctcatgacagtttgtatcaagccttaggtcagcagttattaagaatg
acaggtgtccgtattccagatgaggcttggcttgaagctgaagaaggccttgatgattat
ttaagaatgaatatagaggtagttgattcgctagctaagcgactaggtgagggtagagat
ttagaggcactagttattcgctttactaaagaaagccaagcagcattagccattcctaaa
gaaaagcaagtaaataaaacggttgaagcaaagcattttgatgtgttgcctactactcaa
cagcataaagtagcaggattgagtatgacagtttatcctgcactgtttgaggaaaatagc
atcgtaaaagaggggcggttttctacacaggctgaagctaattatcaacatcgacgcgct
ttacagcgcttgttattacagcaattagcggagcagtccaagtttttacgcaataaacta
ccattacaaacagagttagggttatattttaaagatttcgggcgattagatggtttattg
gatgatattttattagcgagtgtagatgaaacgattttagctgatgaagccatactccct
cgtgatgcagcaagtttagccgttttagcggaacaaaaacgcggtgcttggtttgataat
gctgaccttttagtaagattaatcgccaatattctaaatctatatcatggtttacaaaag
tatttaaaaggtaaaatagatctatctcatgctgtttccttagcagatattaaacaacag
cttgctaatttggttaatttgcattttgttagggacacgccattagaatggttaaaagaa
tatccccgttacttaaaagcaattgagcaacgtttggttaagttgcctacacaattgcaa
aaagatcgcgtgtatagtgcagagttgtctgagtattggcatttatatcaagaaaaaagg
gataaacacttaaaagaaggaagacgagatacagcattgtttttgtaccgatggatgata
gaggagtatagggtttctttgttcgcacagcagttggggacaaaatttcctatttcagat
aaacgtttaaaaaaacagtggcaacttgttgactaa
DBGET
integrated database retrieval system
