Endozoicomonas montiporae: EZMO1_4854
Help
Entry
EZMO1_4854 CDS
T09822
Symbol
ompB2
Name
(GenBank) autotransporter
Organism
emp
Endozoicomonas montiporae
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
VacA_C
CBM49
Bactofilin
InlJ_IG
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMO58748
UniProt:
A0A142BJ22
LinkDB
All DBs
Position
complement(5311934..5314933)
Genome browser
AA seq
999 aa
AA seq
DB search
MFSGTSLRTKCLVRTALSTAAFLAVTSPVNATNLSQGSVPYKLAVNDSSVIIVSEDLTAT
GGDAVITLNAMSGGIHIQQGNTIDANPGPFGSSLNPSSATVFIDESGTLTGTLKNEGEIL
DGVFISGKSIHQSGTAYWSLGQDAGNQADLQGGYVVLEGGVTEVMNDHAVLIDDHSSIDF
VVANGALMSLGNGSAAVHVTENAQISDGFVINGTLSAPQGRGIDIAGTANGDLGISSSGV
LSGAGGGMSAGAALLVSGSYTGLLDNDGDIEGGIFISGSYTGTFDNDGDIKGGIFISGTH
EATQGAAYHAQGSLNDPATLSGGYTTVDGGVSRSTNDHTIYLDDNSITDFVVVMGQKSVT
ELSTIEATASDKSAVYVENGAQLGGFAGRTDSDAAIIVKDGGTIKATGADSSAITVRGDL
TGKIHVDNGFITAASATDVALDFTTSNKPMMFEQIGDNAKTTGIISASAQHLNDWAAFRG
GSYEGETIQNVDHLVVSTITKGITMSGNFTLPAQTTIELVKQQQLDDQGQGVTDNNNNPV
YELNSNALMTVSGRLNAMEAGSNIQFKPASATEYKLMKSGALLTLVDPGSIDGGLAGRVT
VDSGSFLIEATEVVSSAGTLQVQIKSRDAASVKQSVMKSGAGSRASEVLGNAVDVINAAS
YADATKGNKLFAKLNSTNYDVKKLSEQVQPRVAGEVQKSAQGVANTAHNIVFNRIHGLRR
GISYGDQFVDGSVWGQMLYNSGKQSKVDNEHGFDSQTWGITLGADAEIDPAVRMGLAVSL
VRSTVDGKDGSTNKNYGYLGTWYNSWNARGYFVDTMLSMGNTLNDMTKTVDGYRIKADFE
VDQWGVRVIGGNNWRIGNWTISPQTEFNYGLIRVQDYDEKGDSGFEQKIQSKDYNTWELG
GGMKFNGEYWFRRGVIKPELTFMGYYDFGTDGVTVKSTYLAGGNSFIVTGPDRDKIRLHM
GLGLGLQLNNSWTFQTGYNYNWKKNFHSHSFTAKARYEF
NT seq
3000 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttttcgggaaccagtctgcgaacaaaatgccttgttcgcacagcgttaagcacagct
gcttttttagctgtcacttcaccagtcaatgcaaccaatctcagtcagggaagtgtcccc
tataaactggcagttaacgattccagtgtcattattgtcagtgaagacctgacggcaaca
ggtggtgatgcagtgattacccttaacgccatgtctggtgggattcacattcagcagggc
aatacgattgatgcaaaccctggtccttttggttcatctctcaatccttcttcagctact
gttttcatcgatgaaagcggcaccctgacaggaacactgaagaatgaaggcgagattctg
gacggtgtttttatctcgggtaaatcaatacaccagtcgggtacggcctattggagcctt
ggacaggatgctggcaatcaggcggatttgcagggtggctatgtcgtgcttgagggtggt
gtcaccgaggtgatgaacgaccatgcggtactgattgatgatcactccagcatagatttt
gttgttgccaatggtgcattaatgtcattaggaaatggcagtgcagcggttcacgtgaca
gaaaatgcccaaatcagtgatggctttgttattaatggaaccctgagtgcgcctcagggg
cggggcattgatattgccggaacggcaaacggtgatctgggtatttcttcaagtggtgtt
ctttccggagccggggggggaatgtctgctggtgcagcattgctggtgagcggttcttac
accggcctcttggataatgacggtgatattgagggtggcatttttatcagcggttcttac
actggcacctttgataatgacggcgatattaagggaggcattttcatcagtggcactcat
gaggctacccagggtgcggcttatcatgctcagggttcgctgaatgatccggctacactg
tctggcggctataccacggttgatggtggtgtttcccggtctaccaatgatcacacgatt
tatctggatgacaattcgatcacggactttgtggttgtaatggggcaaaaatcagtcact
gaactcagcaccatagaagcgactgcaagcgataaaagtgcagtgtatgtggaaaatggt
gcccagttgggtggctttgccggtcgtactgacagtgacgcagccattatcgtcaaagac
ggtggcacgataaaagcgacgggggctgacagtagtgcaattaccgttcgcggtgacctg
actggtaagattcatgtcgataacggttttatcaccgcagccagtgccacggatgttgca
ctggattttaccacctcaaacaaaccaatgatgtttgagcagattggggataacgccaaa
accactggtattatttctgccagtgcccagcatctgaacgactgggcagcgtttcgtggc
ggtagctacgaaggtgaaaccattcagaatgttgatcatctggttgtcagtaccatcacc
aaaggcattaccatgtcgggcaattttaccctgcctgcccagacaacgattgaactggta
aaacagcagcagctggacgaccagggtcagggagtgacggacaacaataataatccggtg
tatgaactgaacagcaatgcgctgatgactgtgtcaggtcgtttgaatgccatggaagca
ggcagcaatattcagttcaagccagcctcggctaccgaatacaagctgatgaaaagtggt
gcattattgactctggttgacccgggcagtattgacgggggattagccggacgggtgacg
gtcgattcaggcagttttctgattgaggctacagaagtagtgtctagtgcggggacactg
caggtgcagattaaatcaagggatgcagcaagcgtcaagcaatccgtaatgaagtccgga
gccggttcccgggcttctgaagtcctcggtaatgcagtggatgttatcaatgccgcaagc
tatgcagatgccaccaaggggaacaagctgtttgccaagctgaattcaaccaactacgac
gttaaaaaactgtctgaacaggttcagccacgtgtagccggtgaagtgcagaagtcagcc
cagggggttgccaatacggcccataacattgtgtttaaccggatacacggcttgcgacgt
ggtatcagttacggtgaccagtttgtggacggttcagtctggggacagatgttgtataac
agcggtaagcagagcaaggttgataacgaacatggttttgacagccagacctggggtatc
accctgggggctgatgccgagatcgaccctgctgtccgaatgggactcgccgtttcactg
gtacgcagcacggtggatggcaaagatggaagcaccaataagaactatggttatctggga
acctggtacaacagctggaatgcccgtggttattttgttgataccatgctgtccatgggt
aatacgctgaatgatatgaccaaaaccgtggacggttatcgcattaaagctgacttcgag
gtagatcagtggggtgtaagagttattggtggtaacaactggcgcataggtaactggacc
atttctccgcagacagagtttaactatggcttgataagagttcaggactacgatgaaaaa
ggcgacagtggttttgagcagaaaatccagagtaaagactacaatacctgggagctgggt
ggtggcatgaagttcaatggtgagtactggttccgcaggggcgtgataaagcccgagttg
acctttatgggttattacgattttggcaccgacggggtgactgttaagtccacctatctt
gccggaggaaattcgttcattgtcaccgggcctgaccgggataaaataaggctgcatatg
gggctgggactgggtctacagctgaacaatagctggacattccagaccggttacaactac
aactggaaaaagaatttccattctcacagctttacggccaaagcacgttatgagttctga
DBGET
integrated database retrieval system