Entomospira nematocerorum: PVA44_05595
Help
Entry
PVA44_05595 CDS
T10560
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K22994
pectate disaccharide-lyase [EC:
4.2.2.9
]
Organism
enem Entomospira nematocerorum
Pathway
enem00040
Pentose and glucuronate interconversions
enem01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
enem00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00040 Pentose and glucuronate interconversions
PVA44_05595
Enzymes [BR:
enem01000
]
4. Lyases
4.2 Carbon-oxygen lyases
4.2.2 Acting on polysaccharides
4.2.2.9 pectate disaccharide-lyase
PVA44_05595
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pel9A-like_beta_helix
DUF7206
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WDI33692
LinkDB
All DBs
Position
complement(1191729..1194128)
Genome browser
AA seq
799 aa
AA seq
DB search
MKLISHRLIYLLMLMVSMGCSDRNVDSPRGDITSDQIWFYRAFGQSTDVFFDNIANAPGQ
NGINHVWINPIWAYNDPLYIQSEHDINQSLLPDIGIHIHANDTIVVESRGGKIAAGHDGM
TFFYTEIPADRNFQLRATMTITAAGPHPDNKGSKGKVVTSFQQQSGGGIMARDVISQHRK
ELAIDGFEELPSVSNFSATGFLGGKIDNNGQRFVNAGTLYRDGQTSIQGNVGVGREGVQD
ALLEVGLPYVYILERTDEGYFSMILSADESEIIVSRTSAGNPDLTNRIDHSHIYVGVGMM
REVRVVVEQLQLKDHGIHRGTTTMPPSYQSESTLRIKSHNYTTSSEYTLALMSNRDGIVI
IHQLDTDDIRAEIQSIEELYIPLILNKKTNKITIKFIDNEEKKQEYQLSVIYDEGGIVAN
QPLYVSPDGSGTGTMDNPASIVDAIQWLQPGQTLYLLDGRYTIPIIIDESNGGLPSYYKT
IKPLPGANVWINTHILIQGNYWYINNLLVGGTEDERIDVSGKGTLGNAVINILGSYNIIE
RVITEYGTGTGLNIGNSGIYKEFFPKYNHILKSESRYNVDLAGNNADGFGAKRVGPGNYF
YQSIAHNNVDDGWDLFNPIDAGASDPVLIEESIAYSNAHNGFKIGGEGQPAHHIVRNSLA
FQNGMAGFSDNFNPGELILEFNTSADNADQNFLMRDNSIFPPQNQLHGVLSWRKDLSHAK
EDYISGSISESALFKNGSILFNQYSITKDDFMSVTPPLYYQRDKNGFIIWGDYMRVRPDS
PLRKYIDIDSSLGVKHLYK
NT seq
2400 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattaattagtcatagattaatttacttactgatgcttatggtttctatgggatgc
tctgatagaaatgtcgattcaccaaggggtgatattacttccgatcaaatatggttttat
cgagcctttggacaatccaccgatgtattttttgataatatagctaatgcaccaggccaa
aatggaattaatcatgtatggatcaatccaatatgggcctataatgatccactttatatt
cagagtgagcacgatatcaaccaatcccttttgccagatattggaatacatatacatgca
aatgatactattgtagtagaaagtcggggtggcaaaattgcagctggacatgatggaatg
acattcttctacaccgagataccagctgatagaaatttccaattacgagccacaatgaca
attaccgctgcagggccacatcccgataataaaggtagtaaaggcaaagttgttacatca
tttcagcaacaaagcggtggtggaataatggctcgtgatgtaattagtcaacatcgaaaa
gagttagcaatagatggttttgaagagttaccatcagtatctaattttagtgcaacagga
ttccttggtggtaagattgataataatgggcaacgctttgttaatgcgggaacgttatac
agagatggtcaaacctctatccaaggaaatgtaggcgttgggcgggagggagtccaagat
gcattactagaagtaggcctaccctatgtctatatactggaacgtactgatgaaggatac
ttctccatgattctatctgcagatgaatccgaaattatcgtctcacgtacctcagctggt
aatccagatcttacaaatcggatagaccacagccatatttatgttggagttggtatgatg
cgtgaggttagagttgttgtggaacagttacaattaaaagatcatggtattcatcgtggt
actacaacaatgccaccttcctatcagagcgaatcaactcttcgtatcaaatcgcataat
tatacaactagctcagagtatactctggccttaatgagcaaccgtgatgggattgttatt
atccatcagctcgatacagacgatattcgtgctgaaatacaatctatagaggaattatat
attcctttgatattgaataaaaaaacgaataaaatcactattaaatttatagataatgaa
gaaaagaaacaagaatatcagttatctgtcatttatgatgaagggggaatagtagcgaat
cagccactatatgtctctcctgatggtagtggcactggcacaatggataatccagcaagc
attgttgatgccatacagtggctacaaccaggtcaaactttatatttattagacgggagg
tatactataccgattattattgatgagagtaatggtggacttcccagctactataaaaca
ataaagccattgcctggtgcaaatgtttggattaatacacatattttgattcaaggtaat
tattggtatattaataatttactcgtcggaggaacagaagatgaacgtatcgatgttagt
ggcaagggaactcttggtaacgccgttatcaatattttgggaagctataatattattgaa
agggttattacagagtatggaacgggtacgggcctaaatattggtaactctggtatatat
aaagaatttttccctaaatataatcacattctaaaaagcgaatctagatataatgtcgat
ctagctggcaataatgctgatggctttggagctaagcgtgttggtcctgggaattatttt
tatcagagtattgcgcacaataatgttgacgatggatgggatttattcaatccaattgat
gctggtgcaagtgatcctgtccttattgaagaatcaatagcctatagtaatgcgcataat
ggctttaaaattggtggtgaaggtcaacctgctcatcatattgtgcgtaattccttagct
tttcaaaatggaatggcaggattttctgataactttaacccaggagagttgattttagaa
ttcaatacttctgctgataatgcagatcaaaattttttgatgcgagataactctattttc
ccgcctcaaaatcagctccatggggttctttcttggagaaaagatttatctcatgctaaa
gaggattacatctctggatcaattagcgaaagtgctcttttcaaaaatggttctatactt
tttaatcaatattctatcactaaggatgattttatgagtgtaactcccccactttattac
cagcgagataaaaatggttttattatctggggtgattatatgagagtacgtcctgattct
cctttaagaaaatatattgatattgatagttcactgggtgtgaaacatttatataagtag
DBGET
integrated database retrieval system
