Emys orbicularis (European pond turtle): 135880482
Help
Entry
135880482 CDS
T11511
Symbol
FBN2
Name
(RefSeq) fibrillin-2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
eob Emys orbicularis (European pond turtle)
Pathway
eob04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eob00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
135880482 (FBN2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
eob00536
]
135880482 (FBN2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
eob00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
135880482 (FBN2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
hEGF
TB
EGF_3
Fibrillin_U_N
Plasmod_Pvs28
EGF_FBN_1st
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
135880482
NCBI-ProteinID:
XP_065262857
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(80716162..80976995)
Genome browser
AA seq
2900 aa
AA seq
DB search
MGRRCGLCPQLYCLWLGCVALWAQGAAGQQKQQQVRPAGGTDSIYPASENREDGAGAATS
RVRRRGQQDVLRGPNVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSRPNMCTC
SSGQISPTCGSKSIQQCSIRCMNGGTCADDQCQCQKGYIGTYCGQPVCENGCQNGGRCIG
PNRCACVYGFTGPQCERDYRTGPCFAQVNNQMCQGQLTGIVCTKTLCCATIGRAWGHPCE
MCPAQPQPCRRGFIPNIRNGACQDVDECQAIPGVCSGGNCINTVGSYECKCPAGHRQNEA
TQKCDDIDECSIVPGICEGGECSNTVGSYFCICPRGYVTSTDGSHCIDQRAGTCFSSLVN
GRCAQELPNRFTKMQCCCESGRCWAIGSVPEMCPVRGSDEYRRLCIDGVPVGGGSRPGGP
GSNGFLPGGNGNSYGPGGTGFIPIPGGNGFSPGVGGAGVGTGGQTHTGNGAIITGLTILN
QTIDICKHHPNLCLNGRCIPTISSYRCECNMGYKQDANGDCIDVDECTSNPCTNGDCVNT
PGSYYCKCNAGFQRTPTKQACIDIDECIQNGVLCKNGRCVNTDGSFQCICNAGFELTTDG
KNCVDHDECTTTNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGFVLAPNGRYCTDIDECQTPGICMNGH
CINIEGSFRCECPPGLAVGVDGRVCVDTHMRSTCYGGIKKGVCVRPFPGAVTKSECCCAN
PDYGFGEPCHPCPAKNSADFHGLCSSGVGITVDGRDINECALDPDICANGICENLRGSYR
CNCNSGYEPDPSGRNCVDIDECSVNRLLCDNGLCRNTPGSYSCTCPKGYVFSTETDTCED
INECEISPCVNGACRNNLGSFNCECSPGSKLDSTGLICIDSLKGTCWLNIQDNRCEVNIN
GATLKSECCATLGAAWGSPCERCELDAACPRGFARVKGVTCEDVNECDVFPGVCPNGRCV
NSRGSFHCECPEGLTLDGTGRVCLDIRMEQCYLKWDEDECIQSVPGKFRMDACCCAVGAA
WGSDCEECPKPGTKEYEALCPRGPGFSNRGDVLTGRPFYKDINECKVFPGMCMNGKCRNT
IGSFKCRCNSGFALDMEERNCTDIDECHISPDLCGSGTCVNTPGSFECECFEGYESGFMM
MKNCMDIDECERNPLLCRGGTCVNTEGSFQCDCPLGHELSPSREDCVDVNECSLSDNLCR
NGKCVNMIGTYQCSCNPGYQATPDRQGCTDIDECMIMNGGCDTHCTNSEGSYECSCSDGY
ALMPDVRTCADIDECENNPDICDGGQCTNIPGEYRCLCYDGFMASMDMKTCIDVNECDLN
SNICMFGECENTKGSFICHCQLGYSVKKGTTGCTDVDECEIGAHNCDMHASCVNVPGSFK
CSCREGWMGNGIKCIDLDECSNGTHKCSVNAQCVNTPGSYRCACAEGFTGDGFTCSDIDE
CAENVNLCENGQCLNVPGAYRCECEMGFTPASDSKSCQDIDECTFQNICVFGTCNNLPGM
FHCICDDGYELDRTGGNCTDIDECADPINCVNGLCVNTPGRYECNCPPDFQLNPTGVGCV
DNRIGNCYLKYGPRGDGSLSCNTEIGVGVSRSSCCCSLGKAWGIPCETCPPVNSTEYNTL
CPGGEGFRPNPITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCECPQGYYLSEETRICED
IDECVAHPGVCGPGTCYNTLGNYTCICPPEYMQVNGGHNCMDMRKSFCYRSYNGTSCENE
LPFNVTKRMCCCTYNVGKAWNKPCEPCPTPGTAEFKTICGNIPGFTFDIHTGKAVDIDEC
KEIPGICANGVCINQIGSFRCECPTGFSYSDLLLVCEDIDECSNGDNLCQRNADCINSPG
SYRCECAAGFKLSPNGACIDRNECLEIPNVCSHGMCVDMQGGYQCICHNGFKASQDQTMC
MDVDECERHPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPGFELTHNNDCMDIDECSSFFGQVCRNGRCFN
EIGSFKCLCNEGYELTPDGKNCIDTNECMALPGACFPGTCQNLEGSFRCICPPGYEVKSE
SCIDIDECNEDPNICLFGSCTNTPGGFQCTCPIGFVLSDNGRRCFDTRQSFCFTNFENGK
CSVPKAFNTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKEEEVAFQDLCPYGHGTIPGIDDTREDV
NECLESPGICSNGHCINTDGSFRCECPMGYNLDYTGVHCVDTDECSIGNPCGNGTCTNVI
GSFECNCHEGFEPGPMMNCEDINECAQNPLLCAFRCINTYGFYECTCPVGYELREDQKMC
KDLDECAEGLHDCESRGMMCKNLIGTFMCICPPGMTRRPDGEGCMDENECRTKPGICENG
RCVNIIGSYRCDCNEGFQSSPSGTECLDNRQGFCFAEVLQTMCQMASSSRNLVTKSECCC
DGGRGWGNQCELCPLPGTTQYKKLCPHGPGYTTDGRDIDECKVMPNLCRNGQCINTMGSF
RCFCKVGYTTEISGTSCVDLDECSQSPKPCNFICKNSEGSYQCSCPRGYILQEDGKTCKD
LDECQTKQHNCQFLCVNTLGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECGSQPSLCGSKGICQNTP
GSFSCECQRGFSLDSTGLNCEDVNECDGNHRCQHGCQNILGGYRCGCPQGYIQHYQWNQC
VDENECTNPNACGTASCYNTLGSYKCACPSGFSYDQFSSACHDVNECSSTKNPCNYGCSN
TEGGYLCGCPPGYYRVGQGHCVSGMGFNKGQYLPLGGDVDEENALSPEACYECKINGYAN
KNSRKKRSVNETEQAEIEQISLESLDIDSPLKMRLNFSGLGNKEHILEFMPAIQPLTNHV
RYVISHGNDYGIFQIHQRDGLSYLHTAKKKSVPGTYTLEITSIPLYKKKELKKLEDSNVD
NYLLGELGEVLRMRLWIELY
NT seq
8703 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggagacggtgcgggctttgcccgcagctttattgcttgtggctgggctgtgtcgcg
ctgtgggcgcagggagcagccgggcagcaaaagcaacagcaggttcgtcccgcgggggga
acagactccatctacccagcctcggagaatcgggaggacggagcaggggccgccaccagc
cgggtccgcaggagaggccagcaggatgtgcttagggggccaaacgtgtgtggctctaga
ttccactcctactgttgccctggatggaaaacactccctggaggaaatcagtgtattgtt
ccaatttgtagaaatagttgtggtgatggattttgttcccgtcctaatatgtgcacttgc
tccagtggacaaatatcacctacctgtggatcaaaatctatacaacagtgcagtatcaga
tgcatgaatggtggaacttgtgcagatgaccaatgccagtgccagaaagggtatattgga
acttactgtggacaacctgtctgtgaaaatggttgccagaatggaggacgttgtattgga
cccaaccgctgtgcatgcgtatatggatttactggccctcagtgcgaaagagattataga
acaggcccctgtttcgctcaggtcaacaaccagatgtgtcagggccagctgactggcatt
gtttgcacgaagactctttgttgtgcaaccatcggacgtgcctggggccatccttgcgag
atgtgtcctgcccagcctcagccatgtcgtcgtggcttcattcctaacatccgcaatgga
gcatgtcaagatgttgatgagtgccaggctataccaggggtctgttcaggaggaaactgc
attaatacagttggctcttatgaatgcaagtgtcctgctggtcacagacagaatgaggca
actcagaaatgtgacgatatcgatgagtgcagtatcgttccaggaatctgcgaaggtggt
gaatgttctaacactgtgggaagttatttctgcatttgtccacgtggctatgtcacatct
acagatggatcccactgtattgatcaaagggcaggcacatgtttctccagcttggtgaat
ggtcgctgtgcacaagaacttccgaataggtttaccaaaatgcagtgctgttgtgaatct
ggtcgatgctgggccattggatctgttcctgagatgtgtcctgtgagaggctctgatgaa
taccgcagactttgcatagatggagttcctgtaggaggtggttccagacctggtggacca
ggaagcaatggattccttcctggtggaaatgggaatagctatggcccgggaggaactgga
tttattcccattccaggtggcaatggcttctcccctggtgtaggaggagcaggtgttggg
actggtggccagactcacactggaaatggtgcaatcattactgggctgacaatcctcaat
cagacaatagatatatgtaaacaccaccccaatctctgcttaaatggacgctgcatacca
acaatttccagttaccgatgtgagtgcaacatgggatataagcaagatgcaaatggggat
tgtatagatgttgatgagtgcacatcaaacccatgcactaatggagattgtgttaataca
cctggatcctattactgcaaatgcaatgcaggtttccagagaacacctaccaagcaagct
tgcattgatattgatgaatgcatacagaatggcgttctttgtaaaaatggccggtgtgtg
aacactgatggaagtttccagtgtatttgcaatgctgggtttgaactaacaacggatgga
aaaaactgtgttgatcatgatgagtgcaccaccaccaacatgtgtttaaatgggatgtgc
ataaatgaggatggtagcttcaaatgtatctgtaaaccagggtttgtcctagctccaaat
gggcgttactgtactgatattgatgaatgccagacaccaggaatttgcatgaatggtcat
tgcatcaacattgaaggttcttttcggtgtgaatgtccaccaggcctggctgttggggtt
gatggccgtgtttgtgtagatactcatatgcgcagcacatgctatggaggaatcaaaaaa
ggagtgtgtgtccgccctttccctggggcagtgacaaaatctgaatgttgctgtgccaat
ccagactatggctttggagagccatgtcacccatgtcctgccaagaactcagctgatttc
catgggctgtgtagcagtggagtagggattactgtggatggacgagatattaatgagtgt
gcattggatcctgatatttgcgccaatggaatttgtgaaaacctacgtggtagctatcgt
tgtaattgtaacagtggctatgaacctgatccctctggaaggaactgtgttgacattgat
gaatgttcagtgaacagactgctgtgtgacaatggcctgtgtcgaaacacacctggaagc
tacagctgtacatgtccaaagggttatgtattcagcactgagactgacacatgtgaagat
ataaatgaatgtgaaatcagcccgtgtgtcaacggcgcctgcaggaacaatcttggttct
ttcaattgtgagtgttcacctggcagtaaactggattctactggattgatttgcattgat
agtctgaaaggaacgtgctggctgaacatccaagacaatcgctgtgaagtaaacattaat
ggtgctacactgaaatcagaatgttgtgctactttaggagctgcttggggcagcccttgc
gagcgatgtgaattagatgcagcttgcccaagaggatttgccagagttaagggagttacc
tgtgaagatgtaaatgagtgtgatgttttcccgggtgtttgtcccaatggacgttgtgtt
aacagcagaggatcatttcactgtgagtgtccagaaggcctgacgctggatggaacaggt
cgagtgtgtttagatatccgtatggagcaatgttacctgaagtgggatgaagatgagtgc
attcagtctgtacctggcaagtttcgtatggatgcctgctgctgtgctgttggtgctgct
tggggctcagactgtgaggaatgtcctaagcctggcaccaaagaatatgaggccttgtgc
cctaggggacctggtttttccaacaggggagatgttctaactggcaggccattttataaa
gatattaatgaatgtaaagtgttccctggtatgtgcatgaatggcaaatgcaggaacaca
attggaagtttcaagtgtagatgtaacagcggatttgctttagatatggaggaaagaaac
tgtacagacattgatgagtgtcatatctccccggacctctgtggaagtggtacctgtgtc
aacactccaggcagctttgaatgtgaatgctttgagggctatgaaagtggatttatgatg
atgaagaattgcatggacatagatgaatgtgaacgtaaccctctcctttgcagaggtggc
acttgtgtgaacacagaaggcagctttcaatgtgactgtcctttgggacatgagctatca
ccatcacgtgaggattgtgtggatgtaaatgaatgctcattgagtgataatctctgcaga
aatggcaagtgtgtgaacatgattggaacatatcaatgttcctgtaaccccggatatcag
gccactccagacagacaaggctgcactgatattgatgaatgtatgatcatgaatggaggc
tgtgacacacactgcaccaactcggagggcagctatgaatgtagttgcagtgatggctat
gctctcatgccagatgtgagaacatgtgcagatattgatgaatgtgaaaacaacccagat
atctgtgatggtgggcagtgtactaatattccaggagaatatcgctgtctttgttatgat
ggcttcatggcttctatggacatgaaaacctgcattgatgtgaatgaatgtgacttgaat
tccaacatctgtatgtttggagagtgtgagaacaccaagggatccttcatttgccactgt
cagctaggatattcagtcaagaagggaaccactggatgcacagatgtggacgagtgtgag
attggtgcccacaactgcgacatgcatgcctcatgtgttaatgtcccaggaagcttcaaa
tgcagctgcagagagggatggatgggaaatggcattaaatgtattgatcttgatgaatgt
tctaatggaacccacaagtgtagtgtgaatgctcaatgtgtgaacactcctgggtcatac
cgttgtgcctgtgctgagggattcactggagatggattcacttgttctgatattgatgag
tgtgcagaaaatgttaatctgtgtgagaatggacagtgcctgaatgtccctggtgcatat
cgatgtgagtgtgaaatgggattcactccagcttcagacagcaaatcttgccaagatatt
gatgaatgcaccttccagaacatttgtgtttttggtacctgcaataacttaccaggcatg
tttcactgtatctgcgatgatggctatgaactggatagaactggaggaaactgtacagat
attgatgagtgtgctgatcccattaactgtgttaatggtctctgtgtgaatacgcctggg
aggtatgagtgtaactgcccaccagatttccagctgaacccaactggagtaggttgtgtg
gataatcgtattggcaattgttacctgaaatatggaccccgaggggatgggagcctatcc
tgtaacactgaaatcggcgttggagtcagtcgctcctcatgctgctgctctttggggaag
gcctgggggatcccctgtgagacttgtccccctgtaaacagcacggaatataatactctg
tgtccagggggtgagggattcagaccaaatcccatcactattatcttagaagatatcgat
gaatgccaggagttgccaggtctctgtcaaggtggaaactgcatcaatacttttggcagc
ttccagtgtgaatgtccacaaggctactacctcagtgaagaaacacggatctgtgaagat
attgatgagtgtgttgcacatcctggtgtctgtggccctgggacctgctacaacactctg
gggaactacacctgcatctgtcctcctgaatacatgcaggtgaatggaggacacaattgc
atggatatgagaaagagcttttgctatagaagctacaatggaacctcctgtgagaatgaa
ctgccctttaacgtgaccaagaggatgtgctgctgcacgtacaatgttggcaaagcctgg
aacaagccttgtgagccgtgtccaaccccaggaacagcggaatttaagaccatatgtggg
aacattcctggcttcacctttgacatccatactggcaaagctgttgatattgatgaatgt
aaggagatcccagggatctgtgcaaatggtgtttgcattaaccagattggcagtttccgc
tgtgaatgtcccacaggattcagctacagtgacctactcttggtctgtgaagatattgat
gagtgcagcaatggagacaatctctgtcagcgaaatgcagactgtatcaacagtcctggg
agttaccgctgtgaatgtgctgcaggtttcaaactttcacctaatggtgcctgtattgat
cgcaatgaatgtttggaaattcctaatgtttgcagtcatggcatgtgtgtggacatgcaa
ggaggttaccagtgcatctgtcacaatggttttaaggcatcccaagaccaaaccatgtgc
atggatgttgatgaatgtgaacgccatccatgtggaaatggaacttgtaaaaacacagtt
ggatcatataactgtctttgttacccaggatttgagctcactcataataatgactgtatg
gatattgatgagtgcagttccttctttggtcaggtgtgcagaaatggacgatgttttaat
gaaattggttctttcaaatgtttatgtaatgaaggatatgaacttactccggatggcaag
aattgcattgatactaatgagtgtatggcacttcctggtgcatgctttcctggtacttgt
cagaatttggaagggtcattcagatgcatctgcccaccaggatatgaagtgaaaagtgaa
agctgtattgatattgatgagtgcaatgaagaccccaacatctgtctctttggctcctgc
actaatactccaggaggctttcaatgcacctgtcccataggctttgtgctgtctgacaat
ggacgaaggtgttttgatacccggcagagcttctgtttcactaactttgaaaatgggaaa
tgctctgtcccaaaggctttcaacaccaccaaggcaaaatgttgctgcagtaagatgcca
ggagagggatggggtgatccttgtgagctctgccccaaggaagaagaagttgctttccag
gatttgtgtccctatggccatggaactatccctgggattgatgatacacgggaagatgtc
aatgaatgtcttgagagcccaggcatttgttcaaatggtcattgtatcaacactgatgga
tcattccgctgtgagtgccccatgggatacaacttagattacactggagtgcactgtgtg
gatactgatgaatgttcgattggcaatccatgtggaaatggcacatgcactaatgtgatt
ggtagttttgaatgtaactgtcatgaaggatttgagccaggcccaatgatgaattgtgaa
gacataaatgagtgtgcgcagaaccctttgctgtgtgcttttcggtgcatcaacacttac
ggtttctatgaatgcacctgtccggttggctatgaactgagagaagaccaaaagatgtgc
aaagacctggatgaatgtgctgaaggtcttcatgattgtgaatcaagaggcatgatgtgc
aaaaatttgattggcaccttcatgtgtatctgccctcctggaatgacccgtagacctgat
ggagaaggctgcatggatgaaaatgaatgccgtaccaagccaggtatctgtgaaaatggt
cgctgtgtgaacattattggaagctacaggtgtgactgtaatgaaggattccagtcaagc
ccatcaggcactgagtgccttgataaccgccaaggattctgctttgctgaagttttacag
acaatgtgccagatggcttccagtagccgtaaccttgtcaccaagtcagagtgctgctgt
gatggagggcgaggctggggtaaccagtgtgagctttgtccactgccaggaaccacccaa
tataagaaactctgtccacatggaccaggatatacaacagatggaagagatattgatgaa
tgtaaggtcatgccaaatctgtgtagaaatggccagtgcatcaacacaatgggttccttc
agatgcttttgtaaagttggctacaccactgaaataagtgggacatcctgtgtggatctt
gatgaatgctcccagtctccaaaaccatgcaactttatctgcaagaactcagaaggaagc
taccagtgctcatgtccccgtggctacatcctgcaagaggatggaaagacatgtaaagat
cttgatgaatgtcaaaccaaacaacacaactgccagttcctctgtgtcaacactcttggg
ggcttcacatgtaaatgtccaccaggcttcactcaacatcatactgcttgtattgataac
aatgagtgtggttcacagccatcactttgtggatcaaaaggaatctgtcaaaacactcct
ggaagtttcagctgtgagtgtcagagaggcttctctctggattctactggattaaactgt
gaagatgtgaatgaatgtgatggaaaccataggtgccaacatggctgccagaacatcctg
ggtggctacagatgtgggtgcccacaagggtacattcaacattatcagtggaatcagtgt
gttgatgaaaatgaatgtaccaaccctaatgcttgtggcactgcttcctgctacaacaca
cttggaagttacaagtgcgcttgtccatctggattttcttatgaccagttctctagtgcg
tgccatgatgtgaatgagtgttcctccactaaaaacccctgcaattacggctgttccaac
acagaaggtggttatctctgtggctgccctcctggatactacagagttggacaaggccat
tgtgtctcaggaatgggatttaacaaaggccagtacctccctctgggtggagatgtagat
gaagaaaatgctttgtcccctgaagcatgttatgaatgcaaaatcaatggctacgccaat
aaaaacagcaggaaaaaaagaagtgtgaatgaaactgagcaagcagagattgagcagatt
agcttggaaagcttagacattgactctcctttgaagatgaggctgaacttctctggactt
ggtaacaaagaacacattctagaattcatgccagccatacagccccttacgaaccatgtc
cgctatgtcatctcccacggcaatgactatggcatctttcaaatccatcagagggatgga
cttagttatctgcacacagctaagaaaaagtcagtgcctggcacttacacactggaaatc
actagcattcctctatacaagaagaaggagctaaagaaactggaagatagtaatgtggac
aactacctcctaggagagcttggagaagtgctcagaatgagactgtggattgaactctat
tag
DBGET
integrated database retrieval system
