Endosymbiont of Sipalinus gigas: NARSGI1_02550
Help
Entry
NARSGI1_02550 CDS
T06000
Symbol
deaD
Name
(GenBank) ATP-dependent RNA helicase DeaD
KO
K05592
ATP-dependent RNA helicase DeaD [EC:
5.6.2.7
]
Organism
eof
Endosymbiont of Sipalinus gigas
Pathway
eof03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eof00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
NARSGI1_02550 (deaD)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
eof03019
]
NARSGI1_02550 (deaD)
03009 Ribosome biogenesis [BR:
eof03009
]
NARSGI1_02550 (deaD)
Enzymes [BR:
eof01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
NARSGI1_02550 (deaD)
Messenger RNA biogenesis [BR:
eof03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Helicases
NARSGI1_02550 (deaD)
Ribosome biogenesis [BR:
eof03009
]
Prokaryotic type
rRNA helicases
NARSGI1_02550 (deaD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
ResIII
P-loop_SecA
Cas3-like_C_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBA85381
LinkDB
All DBs
Position
220706..222256
Genome browser
AA seq
516 aa
AA seq
DB search
MNNISFLDLGIKDFLIKKLNNLNYINPFPIQKLCIPEILSKKDIIGIANTGSGKTLAFVL
PILNNLNLNNLYPQILVLEPTRELAIQVSNVFKKFSCDIKNINISILCGGQNYNNQFKSL
NLGSNIIIGTPGRILDHINRKTLNLSNINTLVFDESDEILKMGFINEVEKIVSNIDNKNY
QTILFSATMSKYIRFNIINKFTKNPKEIIVKNDIVPKIEQNYCIVNSYNKEDVLIKFIEI
INFNLLIIFTKKKYSTIYISDLLRSKGYNSCYLNGDMNQLSREKTIESLSNKKFNILVAT
DIASRGIDIKDIDLVINYEIPENVDTYVHRIGRTGRAGRSGKSILFLNKEFNFIKVLEKK
YNYIINKIEFPKDKEINNLRINKFINLVKSYNDLNLYKNGSLLTNENILNNLLDLYKSDV
NKLILILLNIISNNNNYYEFISKNKTKIVNNLIKIKLDNKYYNLKNNIFDFLYKKFNIDK
KYIKIEKFSEYFLIKIFNKNLNYKDIKSKIYFLINN
NT seq
1551 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataatatttcttttttagatttaggtattaaagattttttaataaaaaaattaaac
aacttaaattatattaatccatttcctatacaaaaattatgtatacctgaaatattatct
aaaaaagatattataggtatagctaacactggaagtggaaaaactctagcatttgtttta
cctattttaaataacttaaatttaaataatttatatcctcaaatattagtattagaaccc
actagagaattagcaattcaagtaagtaatgtatttaaaaagttctcttgtgatattaaa
aatataaatatatctattttatgcggaggacaaaattataataatcaatttaaaagttta
aatttaggatcaaatataataattggcactccaggaagaatattagatcatataaataga
aaaacattaaatttatctaatataaatacattggtttttgatgaatctgatgaaatatta
aaaatgggatttataaatgaagtagaaaaaatagtatctaacatagataataaaaattat
cagactattttattttctgcgactatgtctaaatatataagatttaatataataaataaa
tttactaaaaacccaaaagaaataatagttaaaaatgatatagtacctaaaatagaacaa
aattattgtatagttaattcttataataaagaagatgttttaataaaatttatagaaata
ataaattttaatttattaataatatttactaaaaaaaaatattctacaatttatatttct
gatttattaagatctaaaggttataatagttgttatttaaatggagatatgaatcaatta
tcaagagaaaaaactatagaatcattatcaaataaaaaatttaatatattagttgcaaca
gatattgcctcaagaggtatagatataaaagatatagatttagtaataaattatgaaatt
cctgaaaatgtagatacttatgttcatagaataggaaggacaggaagggctggaagatct
ggaaaatctatattatttctaaataaggaatttaattttataaaagttttagaaaaaaaa
tataattatattattaataaaattgaatttcctaaagataaggaaattaataatttaagg
ataaataaatttattaatttagttaaatcttataatgatttaaatttatataagaatggt
tctttattaacaaatgaaaatatattaaataacttattagatttatataaatctgatgtt
aataaattaatattaattttattaaatattataagtaataataataattattatgaattt
attagtaaaaataaaactaaaatagtaaataatttaataaaaataaaattagataacaaa
tattataatttaaaaaataatatatttgattttttatataaaaagtttaatattgataaa
aaatatataaaaatagaaaaatttagtgaatattttttaataaaaatatttaataaaaat
ttaaattataaagatattaaaagtaaaatatattttttaattaataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
