Escherichia coli O26 H11 11368 (EHEC): ECO26_4198
Help
Entry
ECO26_4198 CDS
T01098
Name
(GenBank) probable outer membrane usher protein
Organism
eoj
Escherichia coli O26:H11 11368 (EHEC)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Usher_TcfC
TcfC
CooC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAI27372
LinkDB
All DBs
Position
complement(4169027..4171729)
Genome browser
AA seq
900 aa
AA seq
DB search
MDFRIAMDKKLLALLILASLSPAEATLTKIPAGFEVIAQGQQEYIEVYFSGKSLGKYYAM
VNLDTVTFLDPASLYNKLELDVDDQKIAHIVKEKLSQPLARHGELACGYVRTDSGCGFLN
TDTLEIIYNDEESSATLFINPQWNSAFDAKSLYLNPDKNTVNAFIHQQDINVLAQDDYQS
LSIQGNGALGITENSYIGAHWNFNGYDADDVSDSNADISDLYYRYDFLRRYYVQAGRMDN
RTLFNAQGGNFTFNFLPLGAIDGMRIGSTLSYLNQAQSQQGTPVMVLLSRNSRVDAYRNE
QLLGSFYLNSGSQFIDTSSFPPGSYSVALKVYENNQLTRTELVPFTKTGGLTDGNAQWFL
QAGKTTSQVSDDESSAYQLGVRLPLHPQYELYAGLANADDVSAFELGNNWTADLGGVGNL
AISASVFRNDDGGKGDMQQANWSNPGWPTLGFYRTNSDGDACTTDSRESYNALSCYESIS
ATVSQNFVGWNMMLGYTRTQNNTDDSLRWDKQQSFENNYLRQTTAQSISETVQLSASRAF
VMRDWILSTSVGVFHRNDNGGDNDDNGLYLSFSLSDTPTMDSNNNSHSTNVSTDYRYSEQ
DGDQTSWQLSHTFYNDSFSHKELGVTVGGLNTDTINSAVNGRWDGQYGNVYATVSDSYDR
KNHDHLSAFTGTYSSTLAVSRYGVNLGASGTDGLLGAVLVDVKGFSEQDEESQDLQLEAR
VAGSRTLQLGQSDSVLFPYPGFQSGFVEVNDSSQGNQQGTTNIINGAGNRELMLLPGKLR
YREVSASFNYNYIGRLLLPAAVKKFPIVGLNSAMLLVAEDGGFTLEINGSEKELYLLSGQ
QFLKCPLSVVKKRASIRYSGDVTCSVVTYSQLPESIQVQAQLKQPKLRGNVQTAQREVAP
NT seq
2703 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatttcaggattgccatggataaaaaattactggctcttttgatcctggcgagtctc
agcccggcagaggcgacattaaccaaaattcccgcagggtttgaggttattgctcaggga
cagcaggagtatatcgaggtttatttttcagggaaaagtctcggtaaatattatgcaatg
gttaatcttgataccgtaacatttcttgatccagcaagtctatataacaagctggaactg
gatgtagacgatcagaaaatcgcgcatatagtgaaagaaaaattatcgcagccgctagct
cgccacggtgaattggcttgcggttatgtacgtactgactcagggtgtggttttctgaat
accgatacgctggaaataatctataatgatgaagaaagttcggcaacgttgtttattaat
ccgcaatggaattcagctttcgatgcgaagtcattatatttaaatccagacaaaaatact
gttaatgcttttatacatcagcaagacatcaatgttctggcacaggatgattaccaatcg
ttgtctattcagggaaacggtgcgctgggaataacagaaaatagttatattggtgcacac
tggaatttcaacggttatgatgcagatgatgtcagtgacagtaatgctgacatcagcgat
ctctattatcgttatgattttttacgtcgttattatgtgcaggcgggtcgcatggacaac
cgcacactatttaatgcacaaggcgggaactttacctttaactttctgccactcggtgca
attgatgggatgcgtatcgggtcgacactgagctatttaaaccaggcgcaaagccagcaa
ggaaccccagtaatggttctgctttcgcgcaattctcgtgttgacgcttatcgtaatgag
caacttttgggatcgttttatctcaatagtggttcgcaatttattgataccagttccttt
ccgccaggcagctacagcgtggcattaaaagtctacgaaaataaccaactcacccgcacc
gagcttgtgccgtttaccaaaaccggcggtctgactgacggaaatgcgcaatggttctta
caggcaggtaaaactacatcacaggtttctgatgatgaaagttcagcttatcagctagga
gtacgcctgccattacatccgcaatatgagctctacgcagggctggcgaatgccgatgat
gtgagtgctttcgagttaggtaataactggacggcagatttaggcggggtggggaatctt
gcaatcagcgccagcgtgttccgtaacgatgacggcggcaaaggtgatatgcaacaggcc
aactggagtaatccgggatggccgacgttgggcttttatcggaccaactctgacggcgat
gcttgtacaaccgacagcagagagagctataacgccttaagctgttatgaaagtatttcc
gcgacggtttcacagaattttgtcggctggaatatgatgctgggttatacccgcacacaa
aataacactgatgatagtttgcgttgggataaacagcagagctttgaaaataactatctt
cgccagacaacagcgcaaagtatctctgaaactgtacaacttagcgcttcccgcgctttt
gtgatgcgtgactggattttgagtacgtcagtcggtgttttccatcgtaatgacaacggt
ggcgataacgacgacaacggcttgtacttatcgttttcgttatctgacacgccaacgatg
gatagcaataacaacagccattcaacaaatgtgtctacggattatcgttatagcgaacag
gatggcgatcaaacgtcatggcagttatcgcataccttttataacgattcattcagccat
aaagaacttggcgtaaccgtcggaggcctgaacaccgataccataaacagcgcggttaac
gggcgttgggatgggcaatacggaaatgtctacgctaccgtatctgatagttatgaccgt
aagaatcatgatcatctttcggcctttacgggcacttatagctctacgctggctgtcagt
cgctatggcgttaatttgggagccagtggtacagacggtttgctgggtgcggtactggtg
gatgtgaaaggcttctctgaacaggatgaagagagtcaggatctgcaactcgaagcgcgg
gtggcaggcagccgaactttgcagcttggtcaaagtgacagtgtgttgttcccttatcct
ggatttcagtctggttttgttgaggttaacgacagtagccagggcaatcagcaggggaca
acaaacatcattaacggtgcagggaatcgtgaattaatgttgttgcctggcaagctgcgc
tatcgcgaagtgtctgccagctttaactacaactatatcggtcgtttattactgccggca
gcggtgaaaaaattcccgattgtggggctgaacagcgccatgttactggtagctgaagat
ggcggatttacacttgaaattaacggcagcgaaaaagagctctatctgctttccgggcag
caattccttaagtgtccactgagtgttgtaaagaaacgcgccagcattcgttacagcgga
gatgttacttgtagtgtggtgacttattcacaattaccggagtcgattcaggttcaggca
cagttgaaacagcctaaattacgtggaaacgttcagacggcgcaaagggaggttgcacca
tga
DBGET
integrated database retrieval system