KEGG   Emticicia oligotrophica: Emtol_1027
Entry
Emtol_1027        CDS       T02272                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K21449  trimeric autotransporter adhesin
Organism
eol  Emticicia oligotrophica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:eol00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:eol02000]
    Emtol_1027
Transporters [BR:eol02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   Emtol_1027
SSDB
Motif
Pfam: PTL_trimer
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFK02177
UniProt: A0ABN4AJ73
LinkDB
Position
804882..807914
AA seq 1010 aa
MSGITLPTMKLRQGIGVCILMLLSTIVSIAQNENVGIGTTKPDNSAILDLTSTNKGLLIP
RMTLAQRANIKAPATGLLVYQIDFFTGFYFFDGTEWKSFYARNSDGTVITTPTAATSTNK
ATSDNAWLIGGNSGLNVDNNFIGTLDTTSLVFKVNNYRSGLIDYRSGNTFLGYRAGYRSR
GFNSVAIGAYALHATNIGLNNVAVGYQTLVSNQTGSDNIAIGANSLYSNITGSQNIALGT
QAGQRSTGDGNIYIGYKAGMNEVGNNKLYISNSYLDAALIYGDFEKGRVGINTQKPNSAL
SIDSKTANISGLEFKNLTSNSPASKSNLKVLSVDSEGKVILVRDSVGIGGTVSGVNYWTA
KGNLIENNNAGDVMVSNLRFKNLRTFSSAINSNGRVLTVDDNGLLVLAKDSVGNQTPSYW
NFNNNTLSNNTSGKVVLNGPIQLTNIKASNSAFRPYGKVLTVDDNGNLILVRDSVATSSS
TIPVSTSSWSINGNNITNNNTGTVYINNGLNLSKLSSNNTVNLTSQKFLTVDANGNVVLA
NIPSMTITTGTSDWNLDANNNITNKNSGGVYVANGLWAKNGIRVQSGTLEVNGGILLPQL
KAASAAGRAYGKVLSVDDNGNVILVKDSVGVAGSIASPWTSNGNDIINSNTGKAFINNGL
SVKSGINIESGNLVTNGSVINRSGLVLNQLKSSFPASRPNGKVLSVDENGNVILVRDSVS
ISNNTNISTPSSWNISGDNITNANAGSVSINNNLVLSKLSSNNTPTITTQKVLSVDANGS
VILVNTPTTTNTNTSAAPELWKSNADGAIYNSNPQVLISGSTDGLSGLQFTKLKASSPAG
NRYGKVLSVDDFGNVILINDGINGTTTNNSTPGVGWTLTDGRLHNSNNGKVVIGTGINSY
PGDYQLYVKGGILTERLRVAVANSDRWADHVFEKGYDLMSLHDVEKFIDYHHHLPNVPSA
EEMEKNGLDVLQTSAKLIEKIEELTLYLIKANKQIEALEKKVENLEKTQK
NT seq 3033 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcaggaataactttacctaccatgaaacttcgtcagggaatcggagtatgcatcttg
atgcttttgagtacaatagtctcaattgcacaaaacgaaaatgtcggcattggcactacc
aagccagataattcagcaattctagaccttacttctacgaataagggtttactaattcct
cgtatgacattggctcaaagagcaaatatcaaagcccccgcaacaggtttattagtgtat
caaattgattttttcacaggtttctatttctttgatggcaccgaatggaaaagtttttat
gctcgtaattccgacggtacagtaataaccacacctactgcagctacttccactaacaaa
gcaactagtgataatgcttggttgattggtggaaattctggtttaaatgtagataataac
tttatcggaacacttgacacaacttcattagtatttaaagtaaacaattatcgttctggt
ttaattgattatcgaagtggtaatacttttctaggttatcgagcaggttatcgtagtcgt
ggttttaattctgttgccattggagcttatgctttacatgcaactaacattggcttaaat
aacgttgcggttggttatcaaacattagtaagtaaccaaacaggaagcgacaatattgcc
attggagctaattcgctttatagtaatatcacgggttcacaaaatattgccttaggtaca
caagcagggcagcgttcgactggagatggtaatatttacatagggtataaagcaggaatg
aatgaagttggcaataataagctttacatcagtaacagttatttagatgctgctctcata
tatggtgattttgaaaaaggtagagttggtatcaatacccaaaagccaaacagtgctcta
tctattgatagtaaaacggcaaatataagtggattagaatttaagaatcttacaagtaat
tctcctgcgagtaaatctaatttaaaagttttatcagttgatagtgaagggaaggttatt
ttagttagagattctgttggtattggaggtactgtttcaggagtaaattattggacagct
aagggaaatttgattgaaaataataatgcaggagatgtaatggtgagtaatttaagattc
aagaacttacgaactttttcctcagcaattaattcaaatggaagagtattaactgttgat
gacaatggtttacttgtattagctaaagactcagttggcaatcagactccatcttattgg
aactttaataataatactctttcaaataatacttctggtaaagtagtattaaacggtccg
attcagctaacaaatataaaagcttcaaactctgctttccgtccatatggaaaagttctt
acagttgatgacaacggtaatcttattttagtacgcgattcggtcgctacttcaagcagt
acaattcctgtaagcacttcttcttggagtattaatgggaataacattaccaataataat
actggtacagtatatattaacaacggtctgaatttatcaaaacttagtagtaataatact
gtaaaccttacatctcagaagtttcttactgtagatgccaatggtaacgtagttttagct
aatattccatcaatgaccattactactggtacatctgattggaacttagatgccaataat
aacatcaccaataaaaattctggtggcgtatatgtagcaaatggtttatgggctaaaaat
ggtattcgcgtacagtcaggaaccttagaagtgaatggtggaattctcttacctcaactt
aaagcggcaagtgcggcaggaagagcatacggtaaagtactttctgttgatgataatgga
aatgtaattctagttaaagactctgttggagtagcgggctcgatagcttcaccttggaca
agcaacggcaatgatattatcaattcaaatacaggaaaagcattcattaataatggttta
tctgtgaaaagtggcattaatatagagtctggaaatttagtaacgaatggttctgttatt
aatcgaagtggcttagttcttaatcagctaaagtcgtcattcccagcatcaagacctaat
ggtaaagtactctcagttgatgaaaacggaaatgtaattttagtaagagactcggtatct
atatcaaataatacaaatatcagtaccccttcttcttggaatattagtggagataatatc
accaatgctaatgcaggctcggtatcaattaacaataatttggtactttctaaactaagt
agcaataatacaccaaccattactactcagaaagtactttctgttgatgcaaacggcagt
gtaattttagtaaacaccccaactacaactaataccaatacgtctgcagcacctgagctt
tggaaaagtaatgctgatggagctatctataacagtaatccacaagtgttgatttctggc
agtacagatggcctcagcggtttacaattcacaaaattaaaagcatcttctcctgcgggt
aatagatatggtaaagtgctatcagttgacgacttcggtaatgtcattcttatcaatgat
ggaattaatggcactactacaaataattctacccctggtgtaggttggacattgacagac
ggacgcttacataattcaaataatggaaaagttgtgatcggtactggtataaattcttat
ccaggtgattaccaactctacgtaaaaggtggtattttgactgaacgtttgagagtagcc
gttgcaaattctgaccgttgggctgaccacgtatttgaaaaaggttatgaccttatgtct
ttacatgatgttgagaaatttatcgactatcatcatcacttaccaaatgtaccttcggca
gaagaaatggagaaaaatggcttagatgttcttcaaactagtgcaaaattaattgaaaag
atagaagagctaacgctttacttaattaaagctaataagcaaatcgaagctttagaaaag
aaagtagaaaatcttgaaaaaacacaaaaatag

DBGET integrated database retrieval system