Emticicia oligotrophica: Emtol_3014
Help
Entry
Emtol_3014 CDS
T02272
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
eol
Emticicia oligotrophica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
Cadherin_5
Cadherin_4
CshA_repeat
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFK04147
LinkDB
All DBs
Position
3225989..3232108
Genome browser
AA seq
2039 aa
AA seq
DB search
MNTLTTNIKIARLLKSALVLFLIFVRIYSYGQIVVNNDCSNISSPTTIDLTKHVIDNHPT
GTTLTWHTGTPATSSNKYLGDPTKAPASSAGIDYYAAYEDVSTGTPCYSPTSSVIRGVLV
NCTGIPLTNTCPTTFVDLTNHVTGTPPAGSTLVWIKGLPLNISNQVSNPSQVAENGDYYA
AFYDAVNNCFSPVGAPITVTINTCANVTLANVCPSTSVDLTSHASPLTSTGGAPLKWFTS
STPSTSTMVVDPSNVSTSGTYYPAYYDAVNNCFSPSGSGVVVTISSCQTLNPDLSVGQPG
IPINGNVSTNDSNVPSGTTYGTPIPASNNPSSCVPVMASNGSYTFTCTTPGDYNFEVPVC
PAGVSVDCPTVPLKVTVSDPKTPNANGPIVNPDIASTLADNPVIVKTLANDVGGNPSEPL
SPSSVSVVEQPKHGTASVDPLTGNITYIPTPGFVGSDTLTYKVCDTGVPASCGTAQQIFT
VLPTNSPNTTVASDDFIVAIVNTPVNGNVSINDGDPEGNTQTVVAGTIPTAGGNLALSSN
GTYTFTPANGFTGSVDIPYTTCDNGTPQACAKATLHINVVPACIKPLLTVQNITCTGSSY
TVTFSSEGTVTTNNGTISGNTLTVSSGNSTLTATSSCGEVTSMVVTAPSCPVPATCTQIA
SLSVGNALCTGTGTYTVSFSALNGTVTSSVGTISGNSVSGIPVGTNVVLTLTPTEATCSG
QSVTVTSPASCVTPSCTDGSVGISYSTVCNNDGTYNINFTTSISNTIVTSSTNSFVNLTG
TVTLTVTKPGCSPNYVDVTPPTCSICQPPTSVVANPNTICSGASSNLSANCSTGTLVWFS
DANLSTIVSSQVNPTTTTTYYGICINGACKSSPTSVVVNVNPSVVVNSNNFTKTDPTACD
GNTGTIKVCNLVAGRSYSIAFNKNNNAQNPLTYTADANGCVTLSGLSAGVYNNFNITDVL
STCTSGVISGVSIELVEPTKATIHLGVKSDPTACSAYDGTFTVSGLAPNTTYVLNYLKDG
FIQTPITFTSVNTSYTVGGLTAGNYSDIKVSNAGCFSNSISAVLSDPAAVALALGVSTNP
SSCGANDGSIILTGLVSGTTYTIKYKKNGVLQAPISYTATTSSYTITGLTAGLYSNITVS
NGNCVSNSLMENLTDPGANIIALGTVTNPTLCGKNDGSFIISGLTNGLNYTLNYLKDGVQ
QTPISFTATGSTFTLSGLLAGNYTGINLTHGGCISNTLSAQLMNPGGAIIDVIAFDAQTC
MPGNDGTLLITGLSQGLNYTLNYMKNGVAQSSINFNATTTSYLILGLTQGVYSNINVSQG
GCISNSVSGTVLPASQSVAPIFSESIVYTDCAICSADLTQIKSRNLPAGTTLEWHSSLPV
SPSNLVSSSAVSEGTYYATFYNAASKCYSATTSITVIQKPCANSDVVTIIDGSTKIINVL
ANDKNPDCTQADLARISTPSIISYPTKGSFVINLDGTISYTPNANTTGTDSFIYQICDKA
NPMVCDTAMVTINIGCSKPLLTIESISCNVNGTYNVTFSSDGVVSSNAGSITGTSVLNVP
SGTNVRLTSTNGCGTTSMVDVNSPNCPTSNCASPMSLSVGQAVCTGTGSYIVSYTIVNGT
LNVSSGASVQQTFVNGSVISGTVTVSSLTNVTLTATSTSSSCGSQVITVVAPTNCGTPSC
NDGDVGISYSTSCNGNGSYNINYSVVSGTSVTSSTGSFVNLTGSVTLTVTENGCSPKTII
VTPPSCIVNNDVKLQLKVFLQGAFFNPSGATDNLMRDDLRTLGVLPTIEPYSGMANSRFT
KVADAGGQSIGAGVLTNSGSDAIVDWVFVELRDASNPTTILKTRAALVQRDGDVVEATDG
LTPVTFSGAVGTSYYVSIKHRNHLGAMTASPILMTATGTVVDFTTMTASQLWDSGLVLTD
GSLGSYNGSEEVIVGNGKMALWAGNTRNTDNKEKYSGTSPDPATVLSQVITYPANTGGLY
NYDYVTPVYMIGDINLDGKVKYAGTFSDTAFTLFNIINKYPNNFTNKLYNFDFMVEQIP
NT seq
6120 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatactttgacaacaaatatcaaaatagctcgcctattgaaaagtgctttggtgctg
tttctgatttttgtgaggatatactcttacggacagatagttgtaaataatgattgtagt
aatatttcaagtcctacaactattgacctaactaagcacgtaatagataatcatcccaca
ggaacaacattgacatggcatacaggcactcctgctacgtcgagtaataagtacctcggt
gatcctacaaaggcacccgcttcttcagcaggaatagactactatgcggcctatgaagat
gtatctacaggtacaccttgttacagtcccactagtagtgttattagaggagtattagtg
aattgcactggtatcccgcttactaatacatgtccaacaacatttgttgatttgacaaac
catgttacgggaactccacccgctggttcaactttagtttggataaaaggattaccactt
aatatctcaaatcaagtaagtaacccttcacaggttgcagaaaatggtgattattacgca
gcattttacgatgctgtaaataattgttttagtccagtaggtgcacccattacagtcaca
attaatacttgtgcaaatgttacgttagcaaatgtatgtccatcgacttctgttgatttg
acatctcatgcaagcccattaacaagtacaggaggtgctccgttgaaatggtttacttca
agtacaccatctacttcaacaatggttgttgatccatcaaatgtaagtacttcaggaaca
tattatccagcatattatgatgctgtgaataactgttttagtccatcaggtagtggagtg
gttgtaacaattagttcgtgtcaaactttaaatcctgatttaagtgtaggacaacctgga
attccaataaatgggaatgttagcactaatgatagtaatgttccttctggtactacctat
gggacaccaataccagcatcaaataatccgagtagttgtgtaccagtaatggcaagcaat
ggaagttatacatttacatgtactactcctggcgattataattttgaagttccagtatgt
ccagccggagtaagtgtagattgtcctactgtgcctttaaaagtaacggttagtgatcca
aaaacacctaatgcaaatggtccaattgttaatccagatattgcaagtactttggctgat
aatcctgtaattgtaaagacattagctaacgatgtaggtggaaatccatccgaacctttg
agcccatcgagtgtaagtgtagtagaacaacctaaacatggaacagcaagtgttgatccg
ttaacaggaaatattacttatattcctacaccaggttttgttggaagcgatactttgact
tacaaggtttgtgatacaggtgtaccagcaagctgtggtacagctcagcagattttcact
gtattacctacgaactctccaaatactaccgtggcatctgatgatttcatcgttgctatt
gtaaatacaccagtcaatggtaatgtaagcattaatgatggagatccagagggaaataca
caaacagtggtagcaggaacaattccaaccgcagggggtaatttagcgttaagttcaaat
ggaacttatacatttactcctgcaaatggttttacaggttcagtagatattccatataca
acatgtgataatggaacaccacaagcatgtgcaaaagcaactttacacataaatgtggta
ccagcttgtattaagccattattaactgtacaaaacatcacatgtactggttcatcatat
actgttactttcagcagtgaaggcacagtaacaaccaataatggtacgattagtggtaac
actttgactgtgagttcgggtaattcgacgttaactgcaacttcaagttgtggcgaggta
acatcaatggtagttacggcaccgagttgtcctgtcccagcaacgtgtacacaaattgca
agcctaagtgtaggcaatgctttatgtacaggtactggtacttatacagtaagtttttct
gcattaaatggtactgtaacaagtagtgtaggaacgatatcaggaaattcagtgtctggg
atacctgttggcactaatgttgtattgactttaacaccaactgaagcaacgtgtagtgga
caaagtgtaacagtaacatcaccagcatcatgcgtaacaccgagttgtacagatggtagt
gtaggaatcagttacagtacagtatgtaacaatgatggtacatataatattaattttaca
acatcaatttcaaatacaatcgtaacatcaagtactaatagttttgtaaatttaactggt
accgtaacccttacggtaacgaagccaggttgtagcccaaattatgttgatgtaacacct
ccaacatgtagtatttgtcagccacctacttctgtagttgctaatccgaatacaatttgc
tctggagcaagtagtaatctatctgctaattgttctacaggtacattggtatggttctca
gatgctaatttatctaccattgtgagtagccaagtaaatccaacaacaacaacaacttat
tatggaatatgtataaatggggcttgtaaaagttcgccaacttcagttgtagtaaatgta
aatccatctgttgtagtaaatagtaataactttacaaaaacagatcctactgcttgtgat
ggaaatacgggaacgataaaagtttgtaatttagttgcgggaagaagttattctattgct
tttaataagaacaataatgctcaaaatccattaacttatacagctgatgctaatgggtgt
gtgactttaagtggtttatctgcaggagtttataataactttaatattacggatgttcta
agtacttgtacttcaggagtaatctcaggagtatccattgaattagtagaaccgactaaa
gcaactatccatttgggagtaaagtcagacccgacagcatgttcggcttatgacggaaca
tttactgttagtggattagcaccgaatactacttatgtgttgaattatttgaaggatggt
ttcattcagactccaattacctttacatcagtaaatacttcttatacagttggtggttta
actgctggaaattacagcgatattaaagttagtaatgctggttgtttttctaattctatt
tctgctgtattgagcgatccagctgctgttgctttagctttaggagtatctactaatcca
agttcttgtggtgctaatgatggttcaattattttaacaggtttggtttcaggaacaaca
tacacaataaaatataagaaaaatggagttttgcaagcacctattagttataccgcaaca
accagttcttatacgattactggtctaactgcaggattgtatagcaatattacagtttcg
aatggtaattgcgtttcaaatagtttaatggaaaacttaacagatccaggtgctaatatt
atagccttaggaacagttacaaatccaacactatgtggtaagaatgatggttctttcatt
attagtgggctaactaatggattaaactatactttaaattacctgaaagatggagtgcaa
caaacaccaatttcatttactgcaacaggatcgacatttacattatctggtttattagcg
ggtaattatactggtattaacttgacgcatggaggttgtatttctaataccttaagtgct
cagttaatgaatcctggaggtgcaataattgatgttatagcatttgatgctcaaacatgt
atgccagggaatgatggtactctattgattactggcttatctcagggtttgaattacact
ttaaattatatgaagaatggtgttgcacaaagctcaatcaattttaatgcaacaacgact
tcatatttaatcttaggtcttactcaaggtgtatattcaaacattaatgtttcacaagga
ggttgtatttctaatagtgtaagtggcacagtattgccagcttcgcaaagtgtcgctcca
atatttagtgaatctattgtttatactgattgtgcaatttgtagtgcagatttaacccaa
attaagtcaagaaatttaccagcaggaaccactcttgaatggcattcttcgttgcctgta
tcgccaagtaatcttgtttcctcttctgcagtatcagaaggaacttattatgcaacattt
tacaatgcagcttcgaaatgctatagtgcaacaacctctatcacagtgatacaaaaacca
tgtgctaattcagatgttgtaacaataattgatggctctacaaaaattattaatgtatta
gctaatgataaaaatccagactgtacacaagctgatttagcgaggataagtactccttca
attatttcgtatcctacaaaaggtagttttgtaataaatcttgacggaacaatttcttat
actccaaatgcaaatacaacggggacagattcgtttatttatcagatttgtgataaagcg
aacccaatggtatgcgacactgcaatggtaactatcaatattgggtgtagtaaaccatta
ttgacaatcgagtcaatatcgtgtaatgtgaatggcacatataatgtgacttttagtagc
gatggagtagtatctagtaatgcaggtagtatcacaggtacaagtgtactgaatgttcca
agtggtacaaatgtgcgtttgacttcaacaaatggttgtggcacaacaagtatggttgat
gtgaattcaccgaattgtccaacatcaaattgtgcaagtccaatgagtttaagtgttggt
caggcggtttgtactggaacaggtagttatatcgtatcatatacgatagtaaatggcaca
ctaaacgtaagtagtggagcaagtgtccaacaaacatttgttaatggaagtgttattagt
ggaacggtgactgtctcatcactgacaaacgtaactttgacagctacatcgacaagtagt
tcatgcggtagtcaagtgattactgttgtagcacctactaattgtggtactccaagttgt
aatgacggcgatgttggaatctcatacagtacaagctgtaatggcaatggttcatataat
atcaattattcagtagtttcgggtacaagtgtgacatcgagtacaggaagttttgtaaac
ttaactggtagtgtaaccttaactgttactgagaatggttgtagtccaaagactataata
gtcacgcctccttcatgtattgtaaataatgatgttaaattacagttaaaagtattctta
caaggggcattttttaatccgagtggtgcaactgataatttgatgcgagatgatttacga
acattgggcgttttaccaacgattgaaccttactcaggaatggctaatagtagattcact
aaagttgcagatgcaggtgggcaatctattggtgcaggagtcttgacaaattcaggttca
gacgccattgtagactgggtatttgttgaacttcgcgatgcctcaaatccaactactatc
ctaaaaacgagagctgcgttggttcaaagagatggtgatgttgttgaggcaactgatggg
cttacaccagttacattctcaggtgcagttggtaccagttactatgtttcgattaaacac
agaaaccatttaggggcaatgactgccagtccaattttaatgaccgctactggaacggtt
gttgattttacaaccatgacagcttctcaattatgggatagtggcctagtgcttacagat
ggaagtcttggttcttataatggttcggaagaagttatagttggtaatggaaaaatggct
ttatgggcgggtaatacaagaaatactgataataaagagaaatactctggtacttcacct
gacccagcaactgttttatcgcaagtaattacgtaccctgcgaatacaggtgggctttat
aattatgattatgtaacccctgtgtacatgattggtgatataaacttagatggaaaagtg
aagtatgccggaacattctctgatactgcatttactttgtttaatatcattaataaatat
ccaaataactttactaacaagctttacaactttgattttatggtagagcaaatcccgtga
DBGET
integrated database retrieval system
