Endosymbiont of Pachyrhynchus infernalis: NARPIN1_00070
Help
Entry
NARPIN1_00070 CDS
T07678
Symbol
rpsA
Name
(GenBank) 30S ribosomal protein S1
KO
K02945
small subunit ribosomal protein S1
Organism
eop
Endosymbiont of Pachyrhynchus infernalis
Pathway
eop03010
Ribosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eop00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03010 Ribosome
NARPIN1_00070 (rpsA)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03011 Ribosome [BR:
eop03011
]
NARPIN1_00070 (rpsA)
Ribosome [BR:
eop03011
]
Ribosomal proteins
Mitochondria/ Chloroplast
Small subunit
NARPIN1_00070 (rpsA)
Bacteria
NARPIN1_00070 (rpsA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
S1
Spt6_S1
S1_RRP5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBA84757
UniProt:
A0A2Z5T2Y4
LinkDB
All DBs
Position
complement(7703..9250)
Genome browser
AA seq
515 aa
AA seq
DB search
MIKNFSNFFKKSVENINVQPGEILKGKVINIFKDFILVDVNLKSESYVPINEFIDNDKLN
IKIGDEIDFILESIDNNYGETIISRDKAKQYEYWNELEEYYKCDKSIYGYVIERIKGGFS
VEINNVRAFLPGSLVDFKSISDSYNLEGKKLEFKVVKIDKKTNNIVVSRKAVIESEDNYE
KKNLINNLKKDDIVKGIVKNITNYGVFLDLGGIDGLLHITDITWKRIKHPSEIVKIGDEI
NVKIIKFDYDKFRVYLGLKQLVDDPWYCIIKKYPKGLIISGKVTNLTDYGCFVEIENGIE
GLVHISEMDWRNKNINPYEIVNLNEVIKVMILNIDISKRRISLGIKQCKKNPWNDFYKKY
KIGDIVIGNIKSITNFGIFIELNNENVDGLVHITDISWLIDKNNDINKYSKGDEIKSIIL
NIDTDKNRISLGIKQLFKDPFEDFINIKSIGDIIPGKIIDINNNNLIIYINDYVLGNYNL
DLNTIKNKDDIYIGNILNFKIHDFDIKNRIIICII
NT seq
1548 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaaaatttttctaatttttttaaaaaatcagtagagaacataaatgtacaacct
ggagaaatattaaaaggaaaagtaataaatatatttaaggattttattttagtagatgta
aatttaaaatctgaatcatatgttcctataaatgaatttattgataatgataaattaaat
ataaaaataggagatgaaattgattttatattagaatcaattgataataattatggagag
acaataatatctagagataaagctaaacaatatgaatattggaatgaattagaagaatat
tataaatgtgataaatctatatatggatatgttatagaaagaataaaaggtggtttttct
gtagaaataaataatgtaagagcatttttaccaggatcacttgttgattttaaatctata
agtgattcatataatttggaaggtaaaaaattagaatttaaggtagttaaaatagataaa
aaaactaataatatagttgtttctagaaaagctgtaatagaatctgaagataattatgaa
aaaaaaaatttaataaataatttaaaaaaagatgatattgttaaaggaattgttaaaaat
ataacaaattacggtgtatttttagatttaggaggtatagatggattattacatataact
gatataacatggaaaagaataaaacatccatctgaaattgttaaaattggagatgaaata
aatgttaaaataataaaatttgattatgataaatttagagtttatttaggattaaaacaa
ttagttgatgatccatggtattgtattattaaaaagtatccaaaaggattaattatatca
ggtaaagttacaaatttaacagattatggttgttttgttgaaatagaaaatggaatagaa
ggattagttcatatatctgaaatggattggagaaataaaaatataaatccatatgaaatt
gttaacttaaatgaagttataaaagttatgatattaaatatagatatatctaaaagaaga
atttctttaggaataaaacaatgtaagaaaaatccttggaatgatttttataaaaaatat
aaaattggtgatatagtaataggcaatattaaatctattactaattttgggatttttatt
gaattaaataatgaaaatgtagatggattagtacatatcacagatatttcatggcttata
gataaaaataatgatattaataaatattctaaaggagatgaaataaaatctattatttta
aatatagatacagataaaaatagaatttcattagggataaaacaattattcaaagatcca
tttgaagattttataaatataaaatcaataggagatataatacctgggaaaattattgat
ataaataataataatttaataatatatataaatgattatgttttaggaaattataattta
gatttaaatactattaaaaataaagatgatatatatataggtaatatattaaattttaaa
atacatgattttgatataaaaaatagaataataatttgtattatataa
DBGET
integrated database retrieval system