Endosymbiont of Pachyrhynchus infernalis: NARPIN1_00540
Help
Entry
NARPIN1_00540 CDS
T07678
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA-directed DNA polymerase
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
eop
Endosymbiont of Pachyrhynchus infernalis
Pathway
eop03030
DNA replication
eop03430
Mismatch repair
eop03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eop00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
NARPIN1_00540 (dnaE)
03430 Mismatch repair
NARPIN1_00540 (dnaE)
03440 Homologous recombination
NARPIN1_00540 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
eop03032
]
NARPIN1_00540 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
eop03400
]
NARPIN1_00540 (dnaE)
Enzymes [BR:
eop01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
NARPIN1_00540 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
eop03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
NARPIN1_00540 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
eop03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
NARPIN1_00540 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBA84796
UniProt:
A0A2Z5T7U1
LinkDB
All DBs
Position
complement(57516..60281)
Genome browser
AA seq
921 aa
AA seq
DB search
MNEFVHLNIHSEYSIFDSLIKIDDLINLANKFNYSSIAINDFSNLFGVIEFYKSCCFNGI
KPIIGSDFYLLEDFNINKFNNFKNLNKITIFCLSNIGYKNLILLISDSYKNKKKSNYPII
NKKLLVKYNKELLILYGNINSYLGINILNNDLDKIHNDIKFYKKYFNNRFYIEISRIKKK
NEELHIYNALKISKYYKLPIVATNEVRFLSKKDFYFHAIKVSIHNNKSISDNLTKYTCEQ
FFKSKDDINNIFSDIPEVISNSVEISKRCNVFLKFNKRFLPKFNIDENYCKKILTNLSYK
GLKNRLKVEYNNINLYKDKINFYEERLNKELNIINNMGFTGYFLIVNEFTKWAIENNIPI
GPGRGSGSGSLVSYSLNITCLDPILFDLIFERFLNPNRISMPDFDIDFCVEKRDMVINHV
IELYGKDFVSRIITFNCMTAKSVIKDVGRVLGYTFNFINNISKSIPFNSKITLNELIKKE
KKFKDLYENDKEIKKIINISKKLEGYVRNIGKHSGGLVISPYKITKFMPLYYDDSNVLTQ
FDKKSIEKIGLVKFDFLGLKTLTIINNIINNIKVKYKKIVNINYISLDDKLSFDMLISCK
TTGIFQLESKGIKKLIKKLKPNTFKDIIDLIALFRPGPLKSGMVDDFINRRNNLEKVYYP
YKNLEHELLINILKPTYGIILYQEQIIKIAQIFSNYSLSEADILRQIISSKNYYEMKKHK
LKFINGALNNGINKELSSKIFDLIEKFSGYGFNKSHSASYALITYQMLWLKSNYTIIFMS
EVMTFNMNNYEKINNLISECKNMNINIINLNINSSKYDFYVNKNNNIEYGIGTIKGLNKN
LITEIINDRIKNGYYKSVLDLCIRIDKNFLNKKSIEILIENGLFNSLKIDKNKEINNLDV
YIKKSNKLNNNILNKQIDMFE
NT seq
2766 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgaatttgttcatttaaatatacatagtgaatattctatatttgatagtttaatt
aaaatagatgatttaataaatttagctaataaatttaattattcatctatagccataaat
gatttttctaacttatttggagtaatagaattttataaaagttgttgttttaatggaata
aaacctataattggttctgatttttacctacttgaagattttaatataaataaatttaat
aattttaaaaatttaaataaaattacaatattttgtttatctaatataggatataaaaat
ttaattttattaatatctgattcttataaaaataaaaaaaaaagtaattatcctataata
aataaaaaattactagttaaatataataaagaattattaatattatatggaaatataaat
agttatttgggaattaatatattaaataatgatttagataaaattcataatgatataaaa
ttttataaaaaatattttaataatagattttatattgaaatatcaagaatcaaaaaaaaa
aatgaagaattacatatatataatgcattaaaaatatctaaatattataaattaccaata
gtagcaactaatgaagtaagatttttaagtaaaaaagatttttattttcatgctataaaa
gtttctatacataataataaatctatatctgataatttaacaaaatatacatgtgaacaa
ttttttaaaagtaaagatgacataaataatattttttctgatattccagaagttatttct
aattcagtagaaatatctaaaagatgtaatgtttttttaaaatttaataagagattttta
cctaagtttaatatagatgaaaattattgtaaaaaaatattaactaatttaagttataaa
ggattaaaaaatagattaaaagttgaatataataatattaatttatataaagataaaata
aatttttacgaagaaagattaaataaagaattaaatattataaataatatgggttttact
gggtattttttaatagttaatgaatttacaaaatgggctatagaaaataatataccaata
ggtccaggtagaggatctggttcaggttcattagtatcttactctcttaatataacatgt
ttagatccaatactttttgacttaatttttgaaagatttttgaatccaaatagaatatct
atgccagattttgatatagatttttgtgtagaaaaaagagatatggtaataaatcatgtt
atagaattatatggaaaagattttgtatctagaataattacatttaattgtatgacagct
aaatcagttattaaagatgtaggaagagtattaggatatacatttaattttattaataat
atatcgaaatctataccttttaattctaaaataacattaaatgaattaattaaaaaagaa
aaaaaatttaaagatttatatgaaaatgataaggaaataaaaaaaataataaatatatcg
aaaaaattagaaggatatgtaagaaatataggaaaacactctggaggattagttatatca
ccttataaaataactaaatttatgccattatattatgatgattctaatgtattaacacaa
tttgataaaaaaagtatagaaaaaattggattagttaaatttgattttttaggattaaaa
acattaactattataaataatattataaataacataaaagtaaaatataaaaaaatagtt
aatataaattatatatctttagatgataaattaagttttgatatgcttatttcatgtaaa
acaactggaatattccaattagaatcaaaaggaataaaaaaattaataaaaaaattaaaa
ccaaacacatttaaagatataatagatttaatagcgttatttagaccaggaccactaaaa
tctggtatggttgatgattttattaatagaagaaataatttagaaaaagtttattatcca
tataaaaatttagaacatgaattattaataaatatattaaaaccaacatatggaataatt
ttatatcaagaacaaataataaaaatagcacaaattttttctaattattcattatctgaa
gcagatattctaagacaaattataagtagtaaaaattactatgaaatgaaaaaacataaa
ttaaaatttataaatggagctttaaataatggaataaataaagaattatcaagtaaaata
tttgatttaatagaaaaattttctggatatggatttaataaatctcattcagcatcttat
gcattaataacatatcaaatgttatggttaaaatcaaattatactattatatttatgtct
gaagtaatgacttttaatatgaataattatgaaaaaataaataatttaatttctgaatgt
aaaaatatgaatataaatattattaatttaaatattaattcaagtaaatatgatttttat
gtaaataaaaataataatatagaatacggaataggaactataaaaggattgaataaaaat
ttaattacagaaataattaatgatagaatcaaaaatggatattataaaagtgtattagat
ttatgtataagaatagataaaaattttttaaataaaaaatctatagaaatattaatagag
aatggattatttaattcattaaaaatagataaaaataaagaaatcaataatttggatgta
tatataaaaaaatctaataaattaaataataatattttaaataaacaaattgatatgttt
gaataa
DBGET
integrated database retrieval system
