Endosymbiont of Pachyrhynchus infernalis: NARPIN1_02450
Help
Entry
NARPIN1_02450 CDS
T07678
Symbol
deaD
Name
(GenBank) ATP-dependent RNA helicase DeaD
KO
K05592
ATP-dependent RNA helicase DeaD [EC:
3.6.4.13
]
Organism
eop
Endosymbiont of Pachyrhynchus infernalis
Pathway
eop03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eop00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
NARPIN1_02450 (deaD)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
eop03019
]
NARPIN1_02450 (deaD)
03009 Ribosome biogenesis [BR:
eop03009
]
NARPIN1_02450 (deaD)
Messenger RNA biogenesis [BR:
eop03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Helicases
NARPIN1_02450 (deaD)
Ribosome biogenesis [BR:
eop03009
]
Prokaryotic type
rRNA helicases
NARPIN1_02450 (deaD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
DbpA
DUF1694
AAA_22
STAT_int
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBA84959
UniProt:
A0A2Z5TNY9
LinkDB
All DBs
Position
216064..217635
Genome browser
AA seq
523 aa
AA seq
DB search
MSYNKTFLDLGLEVNICNKLSELGFDKPFPIQIESIPKLINGLNIIGNARTGSGKTIAFV
TPFLNKIDINLKYPQFLIIEPTRELVIQVSKVIYDISSGIKKINISSLYGGQNYNIQFKS
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QIALFSATLSKEIKNIAYKFTDNLVEVVVNDSDCSNSKIEQNYIIIDYNLNKKLVLLTFI
EISKFKLCIIFVNTKNLTIEISDLLKKFDYNSSYINGDINQKIREKTIKIFVEEKINILV
ATDIVARGIDINKVDLIINYDSPNNIDTYIHRIGRTGRAGKDGKSFIFINKNDFKILKII
KNKFNINRYFLPSLEELNKLKESKFIDKIKNSSINIKLIDFNKIITKLLDLFNNDYINLI
NVILNILNKEKPIILNEKIKDFKNNSIKNKKYYIFKINIGKNNKIDKKFIINILLKNFSI
TYNNIGYIVIYNYFSKIQLFNFINNIISYNNFLKKNIKLELIK
NT seq
1572 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
