Endosymbiont of Rhynchophorus ferrugineus: NARRFE1_00880
Help
Entry
NARRFE1_00880 CDS
T07618
Symbol
rne
Name
(GenBank) ribonuclease E
KO
K08300
ribonuclease E [EC:
3.1.26.12
]
Organism
eor
Endosymbiont of Rhynchophorus ferrugineus
Pathway
eor03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eor00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
NARRFE1_00880 (rne)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
eor03019
]
NARRFE1_00880 (rne)
03009 Ribosome biogenesis [BR:
eor03009
]
NARRFE1_00880 (rne)
Enzymes [BR:
eor01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.26 Endoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.26.12 ribonuclease E
NARRFE1_00880 (rne)
Messenger RNA biogenesis [BR:
eor03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
NARRFE1_00880 (rne)
Ribosome biogenesis [BR:
eor03009
]
Prokaryotic type
rRNA processing factors
NARRFE1_00880 (rne)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_E_G
RNase_E_G_Thio
S1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBA85038
UniProt:
A0A2Z5T3R9
LinkDB
All DBs
Position
80654..82318
Genome browser
AA seq
554 aa
AA seq
DB search
MKKILINLSYNEELRIAIINDKNILDNLYIININYKNNKSNIYKGKVVKIEPSLNAAFID
YGEGKNGFLSIKEISDNYIKNNKNSINKILYKNQELIVQVIKEEKKNKCAYLSTFICLAG
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INHFIVFIKNILLF
NT seq
1665 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
