KEGG   Endosymbiont of Rhynchophorus ferrugineus: NARRFE1_01240
Entry
NARRFE1_01240     CDS       T07618                                 
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
  KO
K02469  DNA gyrase subunit A [EC:5.6.2.2]
Organism
eor  Endosymbiont of Rhynchophorus ferrugineus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:eor00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:eor03032]
    NARRFE1_01240 (gyrA)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:eor03400]
    NARRFE1_01240 (gyrA)
Enzymes [BR:eor01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.2  DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
     NARRFE1_01240 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:eor03032]
 Prokaryotic type
  DNA Topoisomerases
   NARRFE1_01240 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:eor03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   NHEJ (non-homologous end-joining)
    SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
     Facilitator
      NARRFE1_01240 (gyrA)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_topoisoIV DNA_gyraseA_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: BBA85066
UniProt: A0A2Z5T915
LinkDB
Position
complement(110735..113239)
AA seq 834 aa
MNIKDTTNNKNFIENELKDLYIKYSISVITNRAIPDSKDGLKPVHRRILYSMYKLNNYYN
KPFKKSARIVGDVIGKYHPHGDIAVYNSIIKMVQKFTSRYPLIDGQGNFGSIDGDPAAAM
RYTEIKMSKICHELFNDLNDNIIEFEKNYDGTENIPKILPSKIPNLLINGTYGIAVGIIT
NIPPHNINEVIDGCIELIKNPNISIEDLNKIIIAPDFPTSGIIINKNDNILNIYKNGYGK
FVIKSKVKITNNSIIVYEIPYQVNKLKLIESIVKLIKNKYINGISNIYDESDKNGLRIII
EIKKNYIPYNILNELFEKTKLKINYSINMIALYNNKPKRFNLKELIESFINYRKYIIKKK
IYNIFKNNLKRMNIIEGIIIAIYNINDLINIIINSKKYKDLIKNINNLNIKIINNYKNIN
NELLINNIKNKNNNNSFRFNKEQIKSILNLKISKLMNIEYNKIIQEYEYINNINNKYKLI
LNDKNELNNYIIEELLKIKKEYFDNRITKVIYNDENNIKNINNKNNNKIMNKNFFIILTD
NGYIKYKHIDEYKIQNRKCKGKLITKIFNNDKINKICLTDISSILLIFTNLGKIYSYKTE
NIIKLCNENKNINNIISILKNENINYILSIHNNEFDKSIIICTKLGFIKKIKLTLFKKIR
SNGILIMKLNNNDEIVNVNVFNDDDNDKDIIIFTKNGKSLRFNKNIIKYTTRNSYGIKSI
RLSNFDIVISILLIKTNDYIFNITEKGFGKITHEKEYIKKSRLTKGIKSIKLSDKIGKLK
NTLSLNNNDNILIFTNLGYLLKINSNSINKTKRNTKGVLIIKLNKEENIIYIHK
NT seq 2505 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatataaaagatactacaaataataaaaattttatagaaaatgaattaaaagattta
tatataaaatattctatatcagttattacaaatagagctatacctgattctaaagatggt
ttaaaacctgtacatagacgtatattatattctatgtataaattaaataattattataat
aaaccttttaaaaaatctgcaagaatagttggtgatgttataggtaaatatcatcctcat
ggagatattgctgtatacaattctataatcaaaatggtacaaaaatttacatcaagatat
cctttaatagatggccaaggtaattttggatcaatagatggagatccagctgcagctatg
agatatacagaaataaaaatgtctaaaatatgtcatgaattatttaatgatttaaatgat
aatataatagaatttgaaaaaaattatgatggaacagaaaatataccaaaaatattacca
agcaaaatacctaatttattaataaatggtacatatggtatagctgtaggaataataaca
aatatacctcctcataatataaatgaagttatagatggatgtatagaattaattaaaaat
ccaaatatatcaatagaagatttaaataaaataataatagctccagattttccgacatca
ggaattataataaataaaaatgataatatattgaatatatataaaaatggatatggtaaa
tttgtaataaaatcaaaagtaaaaataactaataattcaattattgtatacgagatacca
tatcaagttaataaattaaaattaatagaatcaatagtaaaattaataaaaaataaatat
ataaatggaatatctaatatatatgacgaatcagataaaaacggattaagaataataata
gaaataaaaaaaaattatattccatataatattctaaatgaattattcgaaaaaactaaa
ttgaaaattaattatagtataaatatgattgcgttatataataataaaccaaaaagattt
aacttaaaagaattaatagaatcttttataaattatagaaaatatataattaaaaaaaaa
atttataatatatttaaaaataatttaaaaagaatgaatataattgaaggaataataata
gcaatatataatataaatgatttaataaatataataataaattctaaaaaatataaagat
ttaataaaaaatattaataatttaaatataaaaataataaataattataaaaatataaat
aatgaattattaataaataatattaaaaacaaaaataataataattcttttagatttaat
aaagaacaaattaaatctatactaaatctaaaaattagtaaattaatgaatatagaatat
aataaaattatacaagaatatgaatatataaataatattaataataaatataaactaata
ttaaatgacaaaaatgaattaaataattatataatagaagaattattaaaaataaaaaaa
gaatattttgataatagaataactaaagttatttataatgatgaaaataatataaaaaat
attaacaataaaaacaataataaaataatgaataaaaatttttttataatattaacagat
aatggatatataaaatataaacatattgatgaatataaaatacaaaatagaaaatgcaaa
ggtaaattaataacaaaaatatttaataatgataaaatcaataaaatttgtttaacagat
ataagtagtatattattaatatttacaaatttaggtaaaatttattcatataaaacagaa
aatatcataaaactttgtaatgaaaataaaaatataaataatataatttctatattaaaa
aatgaaaatataaattatatattaagtatacataataatgaatttgataaatcaataata
atttgtacaaaattaggttttataaaaaaaataaaattaactctttttaaaaaaataaga
tctaacggaatattaattatgaaattaaataataatgatgaaatagttaatgttaatgta
tttaatgatgatgataatgataaagatataataatatttacaaaaaatggtaaatcttta
agatttaataaaaatataataaaatatacaacaagaaatagctatggtataaaaagtatt
agattatcaaattttgatatagttatatctatattattaataaaaacaaatgattatata
tttaatataactgaaaaaggttttggaaaaataacacatgaaaaagaatatataaaaaaa
tcaagattaacaaaaggtataaaatctattaaattatctgataaaattggaaaattaaaa
aatactttaagtttaaacaataatgataatatattaatatttactaatttaggttattta
ttaaaaataaattctaattcaattaataaaactaaaagaaatacaaaaggagttttaata
ataaaattaaataaagaagaaaatataatatatatacataaataa

DBGET integrated database retrieval system