Endosymbiont of Rhynchophorus ferrugineus: NARRFE1_01330
Help
Entry
NARRFE1_01330 CDS
T07618
Symbol
mrcB
Name
(GenBank) penicillin-binding protein 1B
KO
K05365
penicillin-binding protein 1B [EC:
2.4.99.28
3.4.16.4
]
Organism
eor
Endosymbiont of Rhynchophorus ferrugineus
Pathway
eor00550
Peptidoglycan biosynthesis
eor01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eor00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00550 Peptidoglycan biosynthesis
NARRFE1_01330 (mrcB)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
eor01003
]
NARRFE1_01330 (mrcB)
01011 Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:
eor01011
]
NARRFE1_01330 (mrcB)
Enzymes [BR:
eor01000
]
2. Transferases
2.4 Glycosyltransferases
2.4.99 Transferring other glycosyl groups
2.4.99.28 peptidoglycan glycosyltransferase
NARRFE1_01330 (mrcB)
3. Hydrolases
3.4 Acting on peptide bonds (peptidases)
3.4.16 Serine-type carboxypeptidases
3.4.16.4 serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase
NARRFE1_01330 (mrcB)
Glycosyltransferases [BR:
eor01003
]
Polysaccharide
Bacterial polysaccharide (excluding LPS)
NARRFE1_01330 (mrcB)
Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:
eor01011
]
Peptidoglycan biosynthesis and degradation
Glycosyltransferase/DD-Transpeptidase (Class A PBP)
NARRFE1_01330 (mrcB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Transgly
Transpeptidase
UB2H
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBA85074
UniProt:
A0A2Z5TPU0
LinkDB
All DBs
Position
118446..120518
Genome browser
AA seq
690 aa
AA seq
DB search
MHFHKNVIFKLLFIFITFYIIFNLYIKNLNSYISNYLQNKNNNFLLYSKIFKISKKKNFY
KNKIIDILLNHNYNLSKFILKPGDLIINKNNLIFYHRSFNYIKKIDKNLIIKIKFKNNKL
YKIINICKNKKINKILINPIIINLINYDKKSNINYCNFIFNINIFPRILLDILILIEDKN
FYNHYGINFKSIIRALLQNIYKLKFMQGASTITQQLSRNIFLNNKKNIIRKLKEIFISFC
IEKNINKNRIIELYLNKVFLGQSGNIKINGFYLASLYYYNKYIYELNINELIILVSMLKG
LNYNPIRNYNLSLNRRNMILLKLKNNDLINEKLYYQLINKKIKINLNNKIKNKYWCYTSK
VYKEIKDIKYDFNFNNNYEIFSNIDILKYNSFKKSINIFNKKNNYKNFDFLSIMVNKRGK
LINLFYSLNFNIINNINKIYKKKHIGSLIKPILNSIILDVPFNFRLDTNIPNNKLYIEDN
NNKWIPKNHNEFYSNNVTLLDSLINSLNIPYINIGYYIGLKNVLKKIYYFLEDKNIFKLN
NDSIFIGSLDLSIIELSQIYQTIYNNGNLIKIGSIKYIIDNNNNIIYSNKYNIFKKIISN
RSCLLTLYNMKKVTELGTAVKLNKFNFLNIFSKTGTTKNYINNWFIGIDGEDICIIWIGN
YNNIKNFNFKPINIYFEYLNNYKYNLKNIL
NT seq
2073 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcactttcataaaaatgttatatttaaattattatttatatttataactttttatata
atatttaatttatatataaaaaatttaaattcttatatatcaaattatttacaaaataaa
aataataattttttattatatagtaaaatattcaaaatttctaagaaaaaaaatttttat
aaaaataaaataattgatatattattaaatcataattataatttatctaaatttatatta
aaaccaggagatttaataataaataaaaataatttaattttttatcatagatcttttaat
tatataaagaaaatagataaaaatcttattataaaaataaaatttaaaaataataaatta
tataaaattataaatatatgtaaaaataaaaaaataaataaaatcttaataaatcctatt
ataataaatttaattaattatgataaaaaaagtaatataaattattgtaattttattttt
aatataaatatctttcctagaatattactagatatacttattttaatagaagataaaaat
ttttataatcattatggtataaattttaaatctattataagagcattattacaaaatatt
tataaattaaaatttatgcaaggagcaagtactattactcaacaattatcaagaaatata
tttttaaataataaaaaaaatattataagaaaattaaaagaaatttttatatcattttgt
atagaaaaaaatattaataaaaatagaataatagaattgtatctaaataaagtattttta
ggtcaatcaggtaatataaaaataaatggtttttatttagcaagtttatattattataat
aaatatatttatgaattgaatataaatgaattaataattcttgtaagtatgttaaaaggt
ttaaattataatccaataagaaattataatttatcactaaatagaagaaatatgatttta
ttaaaattaaaaaataatgatcttataaatgaaaaattatattatcaattaattaataaa
aaaataaaaattaatttaaataataaaataaaaaataaatattggtgttatacaagtaaa
gtgtataaagaaataaaagatataaaatatgattttaattttaataataattatgaaata
tttagtaatatagatatattaaaatataattcttttaaaaaatctataaatatttttaat
aaaaagaataattataaaaattttgattttttaagtataatggtaaataaaagaggaaaa
ttaataaacttattttattctttaaattttaatattattaataatataaataaaatttat
aaaaaaaaacatataggttcattaattaaacctatattaaattccataatattagatgta
ccttttaattttaggttagatactaatataccaaataacaaattatatatagaagataat
aataataaatggattcctaaaaatcataatgaattttatagtaataatgttactttatta
gattctcttataaattctttaaatataccttatattaatataggttattatataggatta
aaaaatgttttaaaaaaaatatattattttttagaagataaaaatatatttaaattaaat
aatgattctatttttataggttctttagatttatctataattgaattatcccaaatatat
caaactatatataataatggaaatttaataaaaattggttcaataaaatatattattgat
aataataataatataatatatagtaataaatataatatatttaaaaaaataatttctaat
agatcttgtttattaacattatataatatgaaaaaagttacagaattaggtacagcagta
aaattaaataaatttaactttttaaatatatttagtaaaacaggtactactaaaaattat
attaataattggtttataggtatagatggtgaagatatttgtattatatggataggaaat
tataataatattaaaaattttaattttaaaccaataaatatatactttgaatatttaaat
aattataaatataatttaaaaaatatattataa
DBGET
integrated database retrieval system
