Endosymbiont of Rhynchophorus ferrugineus: NARRFE1_01500
Help
Entry
NARRFE1_01500 CDS
T07618
Symbol
rpoB
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta
KO
K03043
DNA-directed RNA polymerase subunit beta [EC:
2.7.7.6
]
Organism
eor
Endosymbiont of Rhynchophorus ferrugineus
Pathway
eor03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eor00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
NARRFE1_01500 (rpoB)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
eor03021
]
NARRFE1_01500 (rpoB)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
eor03400
]
NARRFE1_01500 (rpoB)
Enzymes [BR:
eor01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
NARRFE1_01500 (rpoB)
Transcription machinery [BR:
eor03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
NARRFE1_01500 (rpoB)
DNA repair and recombination proteins [BR:
eor03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
NARRFE1_01500 (rpoB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_1
RNA_pol_Rpb2_2
RNA_pol_Rpb2_45
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBA85085
UniProt:
A0A2Z5T7S5
LinkDB
All DBs
Position
130570..134571
Genome browser
AA seq
1333 aa
AA seq
DB search
MNYLYFNKKRIRKNFSKVVNKLEVTNLLSIQIESFKNFINKNNNFYSIDNVLNNFFPIFD
NNKNIEVRYIDYILDKSLFNTKECRIKGLTYSYSLKINLLLLQKNISTNKIIEIPFNNLY
VCEIPYMTVNGTFIINGTERVVVPQLSKSPGVFFNYIKEKSSYKKKIYNAKIIPYRGSWI
DIEFDNKNILFIKIDKKKKILLTVFLRAMGIKRYDILNFFFKTINVFFCDNCNIILEFIL
DNFNNEDLNVIDNIKNNFKIIEDYIDKNIRKIKISNKYLINKIIHSYNEKKYFDIKDSLI
TDKKLEFLLKNKIKNIKILFIEKYNYLPIYNTLFIDNINSQNESLIEIYKIIKQGDVPDI
KIVKNLFNNLFFCGNKYNLSFIGRMKINNSLYKNNLYKNEDIKNNEDKYINKYDILFTIR
KLIDIKNKKYNIDNLDDLSNKRIKLIGEMIENQFRIGISRLEKSIKEKISYISNIENLNK
NDLVNSKLISSIIKEFFTSSQLSQFMDQNNSLSEITHKRRISSLGPGGLTRDRAGFEARD
VHYSHYGKLCPIETPEGPNIGLINSLSLYCRVNKYGFLETPYFKVINRMITNDIVYLSSL
EDYNLFITQSDIKINNNYIEDEYVMCRFKGNFLLVNSCKVNYIDISPQQIISAGVSLIPF
LEHNDANRALMGTNMQRQAVPIMGCEYPLVGTGYEKIIADNSSNIIFSKRGGKVIYIDSK
YIVVKVNLSEIDYNSDFDLGLDIYELNKFDRSNQNTLINNKICVELFENVNKKSILADNQ
CTDIGELCLGRNLKVAFMSWNGYNFEDSIIISEDLVKKDLFTSIHIQEFSCIQRETKLGP
EEITCSIPNINNHNISMLDKSGIVCIGSYVNEGDILVGKLTPKEEVQLTPEEKLLRAIFG
DKKLNVEDSSLRVPNGVSGTVIDIQIFHSNKFKNKDFNENSNIFIKYNIIKKNLLFIINE
LNNIYNIDKDLILEFIKCSDNNLYEKLLIEINKNIKNNDLFLFYKKILYKYININNLLNK
DIELENIKNINISELSPGIIKIVKIYISTKRKIKEGDKISGRYGNKGVISKICPIEDMPY
DEDGNIIDIILNPLGVPSRMNIGQILETNLSMGLKKIGENIEKILKDNNIIELRNYMNKI
YNLFNKNCEIDFNKLKESELLMLSNNIKNGLPVSVPPFEGINEYEIKSIFEFVNFPNNGK
ITLYDGITGEKFNRKITVGYMYMMKLNHLVDDKIHARSTGSYSLITQQPLGGKSQFGGQR
FGEMEVWALEAYGAAYTLQEMLTVKSDDIYGRIKMYKNIIKNNLTIDPSIPESFNVLLKE
LKSLCLNIDLKKK
NT seq
4002 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattatttatatttcaataaaaaaagaataagaaaaaatttttcaaaagtagttaat
aaattagaagttactaatttattatctatacaaatagaatcatttaagaattttattaat
aaaaataataatttctatagtatagataatgtcctaaataatttttttccgatatttgat
aataataaaaatatagaggtaagatatatagattatatattagataaatcattatttaat
actaaagaatgtagaataaagggtttaacttattcttattcactaaagataaatttatta
ttattacaaaaaaatatatctactaataaaattatagaaataccttttaataatttatat
gtatgtgaaataccatatatgacagtcaatggaacttttataataaatggtacagaaaga
gttgtagttcctcaattatctaaaagtcctggtgttttttttaattatataaaagaaaaa
tcttcatataaaaaaaaaatatataatgctaaaataattccttatagaggttcatggata
gatatagaatttgataataaaaatatattatttattaagatagataaaaagaaaaaaata
cttttaacagttttcttgcgtgctatgggtataaaaagatatgatatattaaattttttt
tttaaaacgattaatgtatttttttgtgataattgtaatataatattagaatttatttta
gataattttaataatgaagatttaaatgttatagataatataaaaaataattttaaaata
atagaagattatatagataaaaatataagaaaaattaaaattagtaataaatatttaata
aataagataattcacagttataatgaaaaaaaatattttgatataaaagatagtttaata
accgataaaaaattagaatttttattaaaaaataaaattaaaaatataaaaatattattt
attgaaaaatataattatttacccatatataatactttatttatagataatataaatagt
caaaatgaatcattaatagaaatttataaaattataaaacagggggatgtacctgatata
aaaatagtaaaaaatttatttaataatttatttttctgtggaaataaatataatttatct
ttcataggtagaatgaaaataaataattctttatataagaataatttatataaaaatgaa
gatattaaaaataatgaagataaatatattaataaatatgatattttatttactataaga
aaattaatagatataaaaaataaaaaatataatatagataatttagatgatttatctaat
aaaagaataaaattaataggtgaaatgatagaaaatcagtttagaataggtatatctagg
ttagaaaaatctataaaagaaaaaatatcttatatttctaatatagaaaatttaaataaa
aatgatttagttaattcaaaattaatatcttcaataataaaagaattttttacatctagt
caattgtctcaatttatggatcaaaataattctttatctgaaattactcataaaagaaga
atatcttcattaggtcctggtggattaactagagatagagctggttttgaagctagagat
gttcattatagtcattatggtaaattatgtcctatagaaacaccggaaggtcctaatata
ggtttaataaattcattatcattgtattgtagagttaataaatatggatttttagaaact
ccttattttaaagttataaatagaatgattacaaatgatattgtatatttatcttcttta
gaagattataatttatttattactcaatctgatataaaaataaataataattatattgaa
gatgaatatgttatgtgtagatttaaaggaaattttttacttgttaatagttgtaaagtt
aattatattgatatttctccgcaacaaattatatcagctggagtttcattaataccgttt
ttagaacataatgatgctaatagagctttaatgggaactaatatgcaaagacaggctgta
ccaataatgggatgtgaatatccattagttggaacaggatatgaaaaaattattgctgat
aattcttctaacattattttttctaaaagaggtggaaaagttatatatatagattctaag
tatattgttgttaaagttaatttatcagaaatagattataattcagattttgatttagga
ttggatatttatgaattaaataaatttgatagatctaatcaaaatacattaataaataat
aaaatttgtgttgaattatttgaaaatgttaataaaaaaagtattttggctgataatcaa
tgtactgatataggagaattatgtttaggaagaaatttaaaagttgcttttatgtcttgg
aatggttataattttgaagattcaattataatatctgaagatttagtgaaaaaagattta
tttactagtatacatatacaagaattttcatgcatacaaagagaaactaaattgggtcca
gaggaaattacttgttctattcctaatataaataatcataatatttcaatgttagataaa
tccggtatagtttgtataggatcgtatgttaatgaaggtgatatattagttggaaaatta
acaccaaaagaagaagttcagttaacacctgaagaaaaattacttagagctatatttggt
gataaaaaattaaatgttgaggattcatctttaagagtacctaatggagtaagtggtaca
gtaatagatattcaaatatttcatagtaataaatttaaaaataaagattttaatgaaaat
tctaacatatttattaaatataatataataaaaaaaaatttattatttataataaatgaa
ttgaataatatttataatatagataaagatttaattttagaatttataaaatgtagtgat
aataatttatatgaaaaattgttaattgaaataaataaaaacataaaaaataatgattta
tttttattttataaaaaaattttatacaaatatataaatataaataatttattaaataaa
gatatagaattagaaaatatcaaaaatattaatattagtgaattatcaccaggtataata
aaaatagtaaaaatttatatatctacaaaaagaaaaataaaagaaggtgataaaatatct
ggtagatatggtaacaaaggtgttatttcaaaaatatgtcctatagaagatatgccttat
gatgaagatggtaatattatagatataatattaaatcctcttggagttccatctagaatg
aatataggacaaatattagaaacaaatttatctatgggtctaaaaaaaataggagaaaat
atagaaaaaatattaaaagataataatattattgaattacgtaattatatgaataaaata
tataatttatttaataagaattgtgaaattgattttaataaattaaaagaaagtgaatta
ttaatgttatctaataatattaaaaatggattacctgtttcagtacctccatttgagggt
attaatgaatatgaaataaaaagtatttttgaatttgttaatttccctaataatggtaaa
ataactttatatgatggaataacaggtgaaaaatttaatagaaaaataactgttggttat
atgtatatgatgaaattaaatcatttagttgatgataaaatacatgctagatctacagga
tcatatagtttaataactcaacaaccgttaggtggtaaatctcaatttggaggacaaagg
tttggtgaaatggaagtttgggctttagaagcttatggagcagcatatacattacaagaa
atgttaactgttaaatctgatgatatatatggtagaataaagatgtataaaaatataata
aaaaataatcttactatagatcctagtatacctgaatcatttaatgttttattaaaagaa
ttaaaatcattgtgtttaaatatagatttaaaaaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
