Endosymbiont of Rhynchophorus ferrugineus: NARRFE1_01510
Help
Entry
NARRFE1_01510 CDS
T07618
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
eor
Endosymbiont of Rhynchophorus ferrugineus
Pathway
eor03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eor00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
NARRFE1_01510 (rpoC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
eor03021
]
NARRFE1_01510 (rpoC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
eor03400
]
NARRFE1_01510 (rpoC)
Enzymes [BR:
eor01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
NARRFE1_01510 (rpoC)
Transcription machinery [BR:
eor03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
NARRFE1_01510 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
eor03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
NARRFE1_01510 (rpoC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBA85086
UniProt:
A0A2Z5T944
LinkDB
All DBs
Position
134583..138599
Genome browser
AA seq
1338 aa
AA seq
DB search
MNNINENEFSYKNFDFIEISIASPDKIRSWSYGEIKKPETINYRTLKPEKDGLFCSRIFG
PINDYECICGKYKKIKYKDMICEKCGVEIISSKSRRNRMGHIELVSPVCHIWFLRSLPSK
ISILLNISLKDIEKVIYFENYIITESFISNVKVGNIINEEDYILLNKKYFGKFVAKIGAE
AIFDLLKKINLKKEYLLLIKKFNLENKLEKRNRIYKRMKIIKSFINSNNKPEWMILTVIP
VLPPDLRPLVPLEGGRFATSDLNDLYRRIINRNNRLKRLIDLSAPNIIIKNEKRMLQESV
DFLLDNGRRGKYVLNSNKKQLKSLSDMIKGKYGRFRQNLLGKRVDFSGRSVIIPGPNLKL
NQCGIPKKIAIELFKPFIYGKLEYLKISSSIKMSKKILNKEDPIILDILEDIMKDHPILL
NRAPTLHRLGIQSFDPVLINGESIQLHPLVCSAYNADFDGDQMAIHVPLTIESQLESRIL
MMSVNNILSPANGDPVIFPSQDMVLGIYYLTKVGNSTINKNIYDINEIEKFFNLNILGIN
DNIKVRITDYDNNKNEYKIIVNTTVGRCILWNVIPKFIPFYLINNTLNKSLILNIISYSY
FNLNLKDTVILLNNLMKIGFKYATISGISIGLDDLIIPNEKDKIINDTNNEVNYINKQYE
LGLLTYNEKYNKIIDIWSEVSEVISKITIDKISDVKLDYNNIFMMIDSGARGSLAQIRQL
SGIRGLMTKTDGYIIENPIKSNFKEGLNIIEYFISTHGARKGLSDTALKTANSGYLTRRL
VDVAQDIVILLKDCKTNNGIKIELDNVNNDNYISLFKDRIIGRILSHDIYDNNKLLFSRN
TLIDYKIFDIIIKLYINHIYIRSPITCELNNGICSLCYGIDLSKGNIVNIGESVGIIAAQ
SIGEPGTQLTMRTFHIGGAISIIGSSNIKFKNPGILKLFNCKFLKNSNNENVIISKNSEV
GILNINLNKIIEKYKLPYGSILNKLENDLVDKNEIIASWDYGSIPIISEFKGKILFENII
ENKNFINKIDEYTGIPCKIMISNYNNYDYKPYINIVDSNNNILKKYYIPEKSIIHINNFD
NINLGDVIAITPQNINEIKDITGGLPKVSDIFEARKPKNSCLLAEETGFISFKIEKNKKK
ILIRNNNNVIIHENYINKNKNMIVFENDYVNKGDIISTGNISIHDILRIKGLDSLVNFII
NEIQNVYKLQGVKINSKHIEIIIKQMLKIVIILDSGDSKLIKNSYIKLNYVRKINKKLIK
NKKRVVVYKYSLIGITKSSLLTDSFISSASFQETTKILTNSAICSKIDFLKGLKENVILG
RLIPAGTGYYYYNKNKKK
NT seq
4017 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaataatattaatgaaaatgaattttcatataaaaattttgattttattgagatatct
atagcatctcctgataaaattagatcatggtcttatggtgaaattaaaaaaccagaaact
attaactatagaactttaaaacctgagaaagatggattattttgttctagaatatttggt
cctataaatgattatgaatgtatatgtggtaaatataaaaagataaaatataaagatatg
atatgtgaaaaatgtggagtagaaataatttcttctaaatctagaagaaatagaatggga
catatagaattagtatctccagtttgtcatatatggtttttaagatcacttccttctaaa
ataagtattttattaaatataagtttaaaagatatagaaaaagttatatattttgaaaat
tatataattacagaatcatttattagtaatgtaaaagttggaaatataataaatgaagaa
gattatatattattgaataaaaaatattttggtaaatttgttgctaagataggagctgaa
gctatatttgatttgttaaagaaaataaatttaaaaaaggaatatttattattaattaaa
aaatttaatctagaaaataaattagaaaaaagaaacaggatatataaaagaatgaaaata
ataaagtcttttattaattctaataataaacctgaatggatgattttaacagttattcca
gttttacctcctgatttaagaccattagttccattagaaggaggtagatttgctacttct
gatttaaatgatttatacagaagaataataaatagaaataatagattaaaaagattaatt
gacttgtctgctcctaatataataataaaaaatgaaaaaagaatgttacaggaatctgta
gattttttattagataatggtagaagaggtaaatatgttttaaattcaaataaaaaacag
ttaaaatctttatctgatatgataaaaggtaaatatggaaggtttagacaaaatttatta
gggaaaagagttgatttttcaggtagatctgttattataccaggtcctaatttaaaatta
aatcaatgtggaataccaaaaaaaatagctatagaattatttaaaccttttatatacgga
aaattagaatatttaaaaatttcttctagtataaagatgtctaaaaaaattcttaataaa
gaagatccaataatattagatatattagaagatataatgaaagatcatcctatattgtta
aatagagctccaactttacatagattaggtattcaatcatttgatcctgttttaattaat
ggagaatcaatacaattacatccattagtttgttcagcatataatgctgattttgatgga
gatcaaatggctatacacgttccattaactattgagtctcaattagaatcaagaatatta
atgatgtctgttaataatatattatctcctgctaatggagatccagtaatatttccttca
caagatatggtattaggtatatattatttaacaaaagttggaaattctactattaataaa
aatatttatgatataaatgaaatagaaaaattttttaatttaaatattttaggaataaat
gataatataaaagtaagaattacagattatgataataataaaaatgaatacaaaataata
gttaatactactgtaggtagatgtattttatggaatgtgataccaaaatttatacctttt
tatttgataaataatacgttaaataaatcattaatattaaatataataagttattcatat
tttaatttgaatttaaaggatactgttatattattaaataatttgatgaaaataggtttt
aaatatgcaactatttctggtatatcaataggattagatgatttaattattccaaatgaa
aaagataagattataaatgatactaataatgaagttaattatattaataaacagtatgaa
ttaggattgctaacttataatgaaaagtataataaaattattgatatatggtcggaagtt
agtgaagttatatctaaaattacgatagataaaatttctgatgttaaattagattataat
aatatatttatgatgatagattctggagcaagaggatctttagctcaaataagacaatta
tctggtataagaggtttaatgactaaaacagatggatatataatagagaatcctattaaa
tctaattttaaagaaggtttaaatataatagaatattttatatctactcatggtgctaga
aaaggtttatctgatactgcattaaaaactgctaattcaggatatttaacaagaagatta
gttgatgtagctcaagatatagttatattattaaaagattgtaaaactaataatggaatt
aaaatagaattagataatgtaaataatgataattatatatcattatttaaagatagaata
attggtagaattttatcacatgatatatatgataataataaattgttatttagtagaaat
actttaatagattataaaatatttgatataattataaaattatatattaatcatatatat
attagatcacctataacttgtgaattaaataatggaatatgttctttatgttatggtatt
gatttatcaaaaggtaatattgttaatataggggaatctgttggtataatagcagcacaa
tctataggtgaacctggaacacagttaacaatgagaacatttcatataggtggagctatt
tcaataattggtagttctaatataaaatttaaaaatcctggaattttaaagttatttaat
tgtaaatttttaaaaaattcaaataatgaaaatgttattatatctaaaaattctgaagtt
ggtattttaaatattaatttaaataaaataatagaaaaatataaattaccttatggtagt
atattaaataaattagaaaatgatttagtagataaaaatgaaataatagcttcatgggat
tatggatcaatacctataatatctgaatttaaaggtaaaatattatttgaaaatataata
gaaaataaaaattttataaataaaatagatgaatatactggtataccttgtaaaattatg
atttctaattataataattatgattataaaccttatataaatatagttgatagtaataat
aatatattaaaaaaatactatattccagaaaaatctattatacacataaataatttcgat
aatattaatttaggtgatgttatagctataactcctcaaaatataaatgaaataaaagat
attacaggtggtttaccaaaagtttcagatatatttgaagctagaaaacctaaaaattca
tgtttattagctgaagaaacaggatttataagttttaaaatagaaaaaaataaaaaaaaa
attcttataagaaataataataatgttattattcatgaaaattatataaataaaaataaa
aatatgatagtttttgaaaatgattatgttaataaaggagatattatttctacaggtaat
atatctatacatgatatattaagaataaaaggattagattctttagttaattttattata
aatgaaatacaaaatgtttataaacttcagggtgttaaaataaatagtaaacatatagaa
ataataattaaacaaatgttaaaaattgttattatattagattctggtgattcaaaatta
ataaaaaatagttatataaaattaaattatgttagaaagattaataaaaaactaattaaa
aataaaaaaagagttgttgtttataaatatagtttaattggtataactaaatcttcttta
ttaactgattcttttatttcttcagcatcgtttcaagaaactactaaaatattaactaat
tctgctatttgtagtaaaatagattttttaaaaggattaaaagaaaatgtaatattaggt
agattaataccagctggtacaggttattattattataataaaaataaaaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
