Exiguobacterium profundum: OE059_14870
Help
Entry
OE059_14870 CDS
T08917
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
epf
Exiguobacterium profundum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
ResIII
Helicase_C
DUF3638
Flavi_DEAD
AAA_34
AAA_30
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WED55276
UniProt:
A0ABY8B265
LinkDB
All DBs
Position
complement(2848583..2851783)
Genome browser
AA seq
1066 aa
AA seq
DB search
MFDARTSELLQEAPSLNDLDASLLPELLTQHYAELVSLRLQGQEEIESIGLNKQWPLKRI
ADVYETIASIHEDSRLRKSSAFVSGTARLILARSENLTSRISGYYPLSRDKVEPSVSAAI
LFLAAEQYADAFEAGKFILNPKGPKEIEILGLHIKDLVTGNLNSILNRSGEWRRESTEHR
NIQDNALCALSATIIEGIELLTFEIMSVSPSDALSGKYKTSKEAFQHVIKLSSKTTEYQG
ISLLTTYAGPSHLASLLLLASDSLEYAALTKIPPPTGIDDSFWKKWISWRANNMPFLWPN
HREAVNKQFYQTGYSSVLVLPTGAGKTTVSTLKIAATLAKNKKVIFLVPTHALVEQVTED
LQEIFPKHEFGLYISDDYDSLFVEESYFKDIEVMTPERCLAMLSFNPESFSQVGLLVFDE
CHLLTPQSGKLGRSLDGMLCVLTFHEVVPEADMLFLSAMLKNGEEFADWIANLTKRSCVA
INLLWKPSRQARGVVVYREQEINAIQEQALKIQNKINIQKGKEAKSLRVLASNELKASPH
AIWGLQNNWLLTNSLAITKILNEPIQLTGTLTNDIRKRIWISPNANQVAAQIASKATEAN
LKTIVFVNKKNDAVSTSKKISELFENKIELNDLETKLWNSLVLELGDEKHAIFDKENISA
VPHHASMLRIERMLAERLFRRENGSSVIVATPTLAQGLNLPANFAILAGDKRTGDNQMRE
NLETHELLNAAARAGRAGHLANGVVLLIPEPIMTFSSHPSVSMELKKKLLSILPENDQCV
TISDPLQVVLDRISEGELNDRDVKYVINRFVSLTLEVEKSIERDFFSKSYGKFLAMKHHS
EKEYEQKVEGLRREIQKLLENDYYEADVKIAAQSGLSLSLLERLHIRLTSQVGNLPLSIK
DWVDWTCSWLIEDSESCDELLQDGYKSALISVGKTKTCLLTESNLKTILKAMHGWIEGKQ
LNEIEVILGGDPDGRERLCPRSRELTSVFIPRGFSYILMIITRMVDELDFYSLQENLDRT
LVTSLSSAVRRGFDTVDKLEFSNNHKHIRGRVETHKLYHDKYKNLI
NT seq
3201 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttgatgcacgaacttcagaattgttgcaagaagccccaagcttaaacgacttagac
gcatctttacttccggaactattaactcagcactacgctgaacttgtttctttacgttta
caaggtcaagaagaaatagagagtataggcttgaataagcaatggcctcttaagcgtata
gcagacgtttatgagactattgcatcgatacatgaagattcaaggcttagaaaatcttct
gcttttgtatctggaacagcaagacttattttagcaagaagtgaaaacctaacctcaaga
attagtggctattaccctcttagtcgagataaagttgagccatccgtatctgctgctatt
ttatttttagcagcagaacaatatgctgatgcttttgaggctggaaaatttatattaaat
cccaaaggaccaaaggaaatagagattcttggtttgcacataaaagatttagttaccgga
aatctaaactccatattgaatcgatctggtgaatggaggagggagtcaacagaacataga
aatattcaagacaatgcactttgtgcactatcggctactatcatagaaggaattgaacta
cttacttttgaaataatgtcagtatctccatctgatgcattatcaggaaaatataaaact
tcaaaggaagcttttcagcatgtaataaaactttcctcaaaaaccacagaatatcagggt
atttcacttttgacgacatatgctggtccaagtcacttagcttcgttattattacttgca
tcagattctttagagtatgctgctttaaccaaaatacctccgcctactggaatagatgat
tctttctggaaaaaatggattagttggagagctaataatatgccttttctttggccgaat
catcgtgaggctgtaaataagcagttttatcaaacaggctattcttcggtattggtttta
ccgactggggcaggtaaaacaactgtcagtacattaaaaatagcggccacgctagctaaa
aataaaaaagttatttttttagtcccaactcatgctttagtggaacaggtaaccgaagat
ttacaagaaatattcccgaaacatgagtttggattatatatatctgatgattatgattct
ttatttgttgaagagtcttattttaaagatatagaagtaatgacgcctgaaaggtgcctt
gcaatgttgtcttttaatccagagtctttttcgcaagttgggctattggtttttgacgaa
tgccatcttctgaccccacagtcaggtaaactgggaagatcattagacggaatgttgtgt
gtattaacttttcacgaggtagtacctgaggcagatatgttgtttttgtcagccatgttg
aagaatggagaagagtttgcagactggattgcgaatttaacaaaaagatcttgtgtagcc
attaatttactttggaagccgagtcgtcaagctagaggtgtcgtggtttatcgtgaacaa
gaaatcaatgcaattcaggaacaagcacttaagatacaaaataagattaatattcaaaaa
ggtaaagaagccaaatcattacgagtacttgcatctaacgaattaaaagcttctccacat
gctatttggggtttacaaaataattggttacttaccaactcactcgcgattacaaaaata
ttgaatgaacctattcagcttactggaacactaactaatgatatccgaaaaaggatttgg
ataagtccgaatgccaatcaagtagccgcacaaattgcttcaaaggcgacagaagcaaat
ttaaaaacaattgtatttgttaataaaaaaaatgatgcagtgagcacttcgaaaaaaatt
tctgaattattcgaaaataaaattgagcttaatgatctagaaactaaactatggaacagt
ttagtcttggaactaggtgacgagaaacatgctatttttgacaaagaaaatattagtgca
gttccgcatcacgcatctatgcttcgaatagaacgcatgttagctgaaagactttttcgc
agagaaaatggttcaagtgtgatagtggctacaccaacgctcgctcaaggattaaatctt
ccggctaattttgcgatattagctggtgataaacgtaccggagacaatcaaatgcgtgaa
aatctcgaaacacacgaacttttaaatgcagcagcaagagcaggacgagcagggcattta
gcaaatggtgtagtgttgttaatacctgaacctattatgactttttcttctcatcctagt
gttagtatggaattgaagaaaaaattattgtcgattctacctgaaaatgatcaatgtgtt
acgataagcgatccattacaagttgtacttgaccggatttctgaaggtgagctaaacgat
agagatgttaagtatgttataaacagatttgtttcattaacacttgaagttgagaaatcg
atagagagagattttttttcgaaatcttatgggaaatttttagcaatgaaacatcacagt
gaaaaagagtacgaacaaaaggttgagggattacggagagagattcaaaaattacttgaa
aatgactattatgaagcagatgttaaaattgcagcccaaagtggcctttcattaagttta
ttggaacgtttgcatataagattaactagccaagtaggtaatctaccactttcaatcaaa
gactgggttgattggacttgttcttggttgattgaagattctgaatcatgtgacgagttg
ttacaagatggttataaatctgccttgatttcagttggtaaaactaagacttgtttgcta
actgagagcaatttaaaaacgattcttaaagctatgcatggatggatagaaggaaaacaa
ttgaacgagattgaagtaatattaggaggtgacccagacggtagagaaagactctgtcca
cgttcacgagaattaacttctgtgtttattccgagggggttctcttatattttaatgatc
atcactagaatggtagacgaacttgatttctacagtttacaagagaatttagatagaact
ttagtgactagtctttcgagtgcagtaagaagagggtttgatactgtagataaacttgaa
ttttcaaataatcataaacatatacgaggacgtgtagaaactcataagctctatcatgat
aaatataaaaatctcatttag
DBGET
integrated database retrieval system
