Eremothecium cymbalariae: Ecym_6243
Help
Entry
Ecym_6243 CDS
T02237
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K20307
trafficking protein particle complex subunit 10
Organism
erc
Eremothecium cymbalariae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
erc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
erc04131
]
Ecym_6243
Membrane trafficking [BR:
erc04131
]
Endosome - Golgi transport
Tethering complex
TRAPP complex II
Ecym_6243
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NTS_TR130
TRAPPC10_1st
TRAPPC10
Ig_TR130_2nd
Foie-gras_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
11469033
NCBI-ProteinID:
XP_003647442
UniProt:
G8JVE6
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(454101..457373)
Genome browser
AA seq
1090 aa
AA seq
DB search
MNKSHRGYTVKISYFDPLAVFDTIQSELEARLPLSSLHWKPDGGSLKTIDQLPVDLVPSV
SGAENALSEDVPFIFIIFVTCSSVQEYRNKVRPLIRKWTPGEETSSDVKQDARIIIPSKY
MIFFHCNSEVVDSNLFKSVSLIEKFHRDFPTVKVHEIKTVYKNAKEKQEFWNLTVSLLKN
TLLDILEKRLEIFNGELQSKSLSFQDSLVYRENLLRLYLSFNIHEEASIQLTEIESLLLQ
NGVSELPNGDMEVPFTSEKHSGTIVSIAHSINEGSLTKYVLYKYIFTHQLELLQRLTSTT
TDYQNLFQISRAFYSHINKVFLESPNILQFNYFFLETLLSDSLISEGKSKLSKIIYSTFK
LEQRDCWLRLVYANTDFRLDSIVFSPNSIRYEDNLLKQTFQSEDIFHNTFIEMTKGLLTS
FGKCEGRGQRTMDWLSVQMGMLYFQKKEYRKAFDLLQSCYEFYMESNWDVIGGHLLEIFV
KCLLMCPEIEYLENDGESIPVSSILSNCFLNLLIFSKDSKAYWWDEFLKLNNASEANLIY
PLDNLFTVKISHNPFLSKPNTYALRIKLENNIVPIAIMVSAIKLSLKNSKDEFLTFLASD
QIIKPGSNTFTLETTEISFSTYEVLNLEITVGDTVFSKEFETFAAQDTLVMEELYHHEDF
RCTLTNIRKALFNAASLEIKYENKEHIDNFNLQLSALARDTDKPPEFAFNNDKEFPLYQI
TINDFKIDKIPYFTNGVVGRISLGFDLSFERGNQKFQQYQVLEIDVSLPIAVSVEDIFKK
DAFYFKFIISSSSIEMPVIVHSCSLNVNQKYIVSDAFEPDEPIILPAGSSSHYLNYYKIQ
VKEGYTFDMTDVFELFVNYSTMKEHIDDLVTKKFLSINEGNGKYLFEKWSIFWRHVILPK
LIYDYNSFERDKCIILLSDVQPLIRLVKSQILDSSVSKKYYECIKALAAGVQISDYPVQN
SVVELNTLTVPVTFPSIKQLFSVQLEPRSSDEYHVGQLIPFDIIIKNLSQNWAITKNDNT
YVLEVSNSNEWAINGKRRTVLHSNYLTFLIHLIPLRCGYLTYPKIEIFTSGRTKVMEVDY
LNAYETLLVI
NT seq
3273 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataagtctcataggggttatactgtgaagatcagctactttgatcctttagctgtg
tttgacaccattcaatcggaattagaagctaggctgccattaagctcattacattggaaa
ccggatggaggttctctgaagactattgaccagttacctgtggatcttgttccgtcagta
tctggtgctgagaatgctttatctgaagatgtcccctttatttttattatatttgttacg
tgttcatcggtacaagagtatcgaaataaggtgaggccattgattaggaaatggacacct
ggggaagaaactagttctgatgtcaaacaggatgctcgtataataattccttccaagtac
atgatcttttttcattgcaattctgaggttgttgattccaacttgtttaaatcggtttca
ttgatagaaaagttccacagagatttccctactgttaaggtacatgagatcaagacggtg
tataaaaatgcgaaggagaagcaggagttttggaacttgacagtttcgctgctgaagaat
actttgttagatatactggaaaagcggttggaaatatttaatggtgagctccaatcgaag
tctctttcgttccaagactctttggtatatcgcgaaaatctattaaggctgtacctcagt
tttaatattcatgaagaagcatcgattcaattgactgaaattgagtctcttttactccaa
aatggagtgtctgagctaccaaatggtgacatggaggttccatttacttcagagaagcat
agtggtacaattgtatcaattgcgcattccattaacgaaggttcactaacaaaatacgta
ttgtacaagtacatttttactcaccaactagaattattgcaacggctgacttctacaacg
accgattatcaaaatctcttccagatatcaagggctttctattctcatataaacaaagtg
tttctggaatcgcccaatatattgcaattcaattacttctttttggaaacgcttttaagt
gatagtttgataagtgaaggcaaatcaaaattatcaaaaataatctatagcacatttaag
ctcgaacaacgcgattgttggctcaggttagtatatgcgaatactgatttccgattagat
tcgattgtgttttctcctaattcaattcgttatgaggataatttgttgaaacaaacattt
caatctgaagatattttccataatactttcattgagatgactaaaggtttgctaacttcc
tttgggaagtgtgagggtagaggacaacgaacaatggattggctatctgtgcagatgggc
atgttgtacttccagaagaaggaatatagaaaggcatttgaccttttacaatcttgctat
gagttctatatggaatcgaattgggatgtaattggtggtcatttgcttgaaatttttgtt
aagtgtttgttgatgtgcccagaaattgaatacttggaaaatgatggcgaatctattcca
gtatccagcattttaagcaattgctttttgaatttactcatattttcaaaagattctaag
gcctactggtgggatgaattcttaaagctgaataacgcctctgaggctaatttaatatat
ccattggataatttattcaccgttaaaatttcccataacccttttctttctaagccaaat
acatacgctttgcgtattaaattagagaataatatagtgcctatagctataatggtttcg
gcaattaaattgtcattgaaaaattctaaagatgaattcttaacctttttagcaagtgat
caaattattaaaccgggatccaatacttttacacttgaaacaactgaaatatcattttca
acttatgaggtgttaaatcttgaaataactgttggtgacactgtttttagcaaagaattc
gaaacttttgctgctcaagatactctagtaatggaggaattgtatcatcacgaagacttc
agatgtacactaaccaacattagaaaagctttatttaatgcggcgtctctggagataaaa
tatgagaataaagaacatatagataactttaatttacagttatctgcattagcacgggat
actgataaaccacctgaatttgcatttaataatgataaagaatttcctctgtatcagatc
acgataaatgactttaagatagacaaaattccttactttactaatggtgtggtaggccgt
ataagtctaggctttgacttgtcttttgaaagaggaaatcagaaattccagcaatatcaa
gtgcttgaaattgatgtttctttacccatcgcagtgtccgtcgaggatatctttaaaaag
gatgccttctactttaaatttattataagttcatcgtctattgagatgcctgtcatagtt
cattcctgttcattgaatgttaaccaaaaatacattgtttcagatgcttttgaaccagat
gaaccaataatcttgcctgctggttcgtctagccattatttaaattattataagatccaa
gtcaaagaggggtatacatttgatatgactgatgtttttgagctttttgttaactacagt
acaatgaaagagcatattgatgatttggtaactaaaaaattcctcagtataaacgaaggg
aatggcaaatatttatttgaaaaatggagtattttctggcgtcatgtgatattaccaaaa
ctaatttatgattataacagttttgaacgtgataaatgtatcattcttctgtccgacgta
caaccactgataaggttagttaaatctcaaattttagactcaagcgtctccaaaaaatat
tatgagtgcattaaagctttggcagccggtgttcagatatcagattatcctgtacaaaac
tctgttgtagagctaaataccttaacggttccggtgacttttccttcaattaagcagctt
ttcagcgttcagttggaaccaagaagttctgacgaataccatgttggtcaactaattcca
tttgatattataattaaaaatttatcccaaaactgggcaattactaaaaatgataatact
tacgttttagaagttagcaacagtaatgaatgggcaattaatggtaaacgtcgcaccgtt
ttacactcgaactatctaactttcttgattcacctcatcccattaagatgcgggtatttg
acatatccgaagattgaaatatttaccagcggtagaaccaaagtcatggaggttgattat
ttgaacgcatatgaaactttattggttatatag
DBGET
integrated database retrieval system
