Ehrlichia ruminantium Gardel: ERGA_CDS_02730
Help
Entry
ERGA_CDS_02730 CDS
T00232
Name
(GenBank) Conserved hypothetical protein
KO
K16899
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
erg
Ehrlichia ruminantium Gardel
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
erg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
erg03400
]
ERGA_CDS_02730
Enzymes [BR:
erg01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
ERGA_CDS_02730
DNA repair and recombination proteins [BR:
erg03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
ERGA_CDS_02730
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PDDEXK_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAI27725
LinkDB
All DBs
Position
454043..456784
Genome browser
AA seq
913 aa
AA seq
DB search
MGKVFSVHCSESFLNVVAEFTLDVSSYSSTNSVSSIIVIVSSNEEMTLLDKLLAKYSYGN
YSSLKIKVISLSDIDHDVLVNNSDFVKIISPLRKLMLLMEFIKLWNSEHCDNYPLSLSYE
LSALLNEMYTHCIPLSSFENLFEYDLPEHSQKAVEFLSCFSKKWTEILQQENVLDILEHR
SLYINTLIRYLEEGSSNSTIIFAGMAFNTLIIDFVRTLYKLPNTQIILPYVDVGIDEKNW
KLLEESHYQYCVKNLLDVLKIGRNDVVFLGKQNNRVFIDSIFNFDLFLEEYHKGRIQICD
SCDYVQVITCMSDEEESHVISALMKKYKSKDVAVFTNNVLLSKRVDSIVNLENLPHELDI
NYLILSFVSNVLEVVVSFWNPISLLSLLKHPFINLGYSEDEYSTLISNFELKVIRLYSSY
DFVSIDGNVREKVPDLIHFWEKITSIVLPLVDVKHCTISSIVKAHIVCLRGLLTGSTVFS
YEKIEGFFDNFQSACANIRMSGIDIYYEILISVLHNNLFVENYRLSSVNLYKREVVIFSG
FNELNYGTGLHSTLLNNRMRSKLGLPSIQREKGYFAYMLYSFFYSDKIYITRSLKSFGKV
NEESIWIKKIKIMAKIYNYKNLEREDYLRSENGCTNSVTNLCYLRPQPNPEINHRVMAFN
ILSTTAVEILVKNPYVFYLNNILNILPYKDINEKFSMRDFGIIVHNVLHKYLVTPKNQQD
YERLIKIAESEFLNKYKNFPQVETILWPKFQQIAEQFFEMNLNRNSNIDKIITEHFFSWE
INNNVKIISKCDRVECLKDNSIAIIDYKTGVIPSQLDISRGIALQMIIQALTVKKSLKKN
ISDLMYWKIGAEDIKVVSIDNYEEIMEKTEIALKELILEYLVNRKPFIASHDIAGFGSYD
LLIRLKEWWNVIY
NT seq
2742 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggaaaagttttttcagttcattgttcagagtcttttttgaatgtagtagcagaattt
acgctagatgtgtcgtcttatagtagtacaaattctgtttctagtattatagttatagtt
tctagtaatgaagagatgacattattagataagttattagctaaatactcttatggtaac
tattctagtctcaaaataaaagttatatcattgtctgatatagatcatgatgtattagta
aataatagtgattttgtcaaaattattagtccacttagaaagctaatgctattgatggaa
ttcataaaattatggaattctgaacattgtgataactatcctttatctttaagctatgaa
ttatctgctttgttaaatgaaatgtatacgcattgtataccattatctagttttgaaaat
ttatttgaatatgatttacctgaacattctcaaaaagctgtagaatttctgtcgtgtttt
tcaaagaaatggacagaaatactacaacaagagaatgtacttgatatattagagcatagg
agcttgtatattaataccttaattaggtatttagaagaaggttctagcaatagtactatt
atatttgctggaatggcatttaatactctgattatagattttgttagaactttatataaa
ttgcctaatactcaaataatacttccatatgtagatgtgggtattgatgaaaaaaattgg
aaattgttagaagagtcacattatcaatattgtgtgaaaaatttgttagatgttttaaaa
attggtagaaatgatgttgtttttttgggaaaacaaaataatcgtgtatttatagatagt
atatttaatttcgatctatttttagaagagtatcataaaggtaggattcagatatgtgat
agttgtgattatgttcaagtaattacttgtatgtcagatgaagaagaatctcacgttata
tctgcacttatgaaaaaatataagtctaaagatgttgctgtatttacaaataatgttttg
ttaagtaagcgagtagattcaatagtaaatttagagaatctacctcatgagttagatatt
aattatttgatattatcttttgtatctaatgtattagaagttgttgttagtttttggaat
cctatatcgttactctcattactgaaacatccttttatcaatttaggatatagtgaagat
gaatacagtactttaatatctaattttgaattgaaagttattagattgtattctagttat
gattttgtgagtatagatggtaatgtaagagaaaaggttcctgacttaatacatttttgg
gaaaagataactagtattgtacttcctttagttgatgtaaagcattgtactatttcttct
atagtaaaggctcatattgtatgtttacgtggtttactaactggtagtactgtgtttagt
tatgaaaaaatagaagggttttttgataattttcaaagtgcatgtgctaatatcagaatg
agtggtatagatatatattatgagattttgatatcagtgttgcataataatctttttgtt
gaaaattatagattatcttctgtgaatttatataaaagggaggttgtgattttttcagga
ttcaatgaactaaattatggaactggcttacatagtacattattaaataaccgaatgcgt
agtaaattaggattgccttctattcaaagggaaaaaggttattttgcctatatgttatat
agttttttttattcagataagatttatattactcgatctttaaaaagttttgggaaagtc
aatgaagaatctatctggataaaaaaaattaaaattatggcaaaaatctataactataaa
aatttagagcgtgaagattatttaagatcagaaaatggatgtacaaatagtgttactaat
ttgtgttatttaagacctcaacctaacccagaaattaatcatagggtaatggcatttaat
atcctttcaacaactgctgtggaaattttagtaaaaaatccatatgtattttatttaaac
aatattctcaatattttgccgtacaaagatattaatgaaaaattttctatgagagatttt
ggaattattgtacataatgtgttacataagtatttagtgactcctaaaaatcagcaggac
tatgaaagattaataaaaattgcagaatcagaatttcttaataagtataaaaattttcct
caagttgaaactattttatggcctaaatttcaacaaatagctgaacaattttttgaaatg
aacttaaatagaaatagtaatatcgataaaattatcacagaacattttttttcttgggaa
attaacaacaatgttaaaataatatctaagtgtgatagagtagaatgtttaaaagataat
agtattgcaattattgattataaaactggtgtgattccttctcaattagatatcagccgt
ggaattgcattacaaatgataatacaagcattaactgtaaaaaaaagtttgaaaaaaaat
atttcggatttgatgtactggaaaataggtgcagaagatattaaagtagtttctatagat
aattatgaagaaattatggaaaaaacagagattgctttaaaggaactgatattagaatat
ttagttaatagaaaaccatttattgcatctcatgatattgctggatttggtagttatgat
cttttaattcgtcttaaagagtggtggaatgtaatatattaa
DBGET
integrated database retrieval system
