Erysipelothrix rhusiopathiae Fujisawa: ERH_0088
Help
Entry
ERH_0088 CDS
T01525
Symbol
tgt
Name
(GenBank) tRNA-guanine transglycosylase
KO
K00773
queuine tRNA-ribosyltransferase [EC:
2.4.2.29
]
Organism
erh
Erysipelothrix rhusiopathiae Fujisawa
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
erh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
erh03016
]
ERH_0088 (tgt)
Enzymes [BR:
erh01000
]
2. Transferases
2.4 Glycosyltransferases
2.4.2 Pentosyltransferases
2.4.2.29 tRNA-guanosine34 preQ1 transglycosylase
ERH_0088 (tgt)
Transfer RNA biogenesis [BR:
erh03016
]
Prokaryotic type
tRNA modification factors
Other tRNA modification factors
ERH_0088 (tgt)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TGT
SF3a60_Prp9_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK31147
LinkDB
All DBs
Position
106968..108119
Genome browser
AA seq
383 aa
AA seq
DB search
MSLGNKPLKLTLIKKSNESKARLTTIETHHGTVETPMFMPVGTLASVKFLSPEDLRKIGS
QVILSNTYHLWLRPGEDVVRQAGGLHKFMNYNGPILTDSGGFQVFSLGKIRTISEEGVEF
RSHLSGEKLFLTPEKAIQVQNALGPDIMMSFDECPPYPATYEYMKNSVERTIRWAARGKA
AHQNPETQALFGIVQGGKYADLREHCAKELVAMDFPGYSIGGTSVGEPKDVMWQMIDHTI
DFLPEDKPRYLMGVGSVDAIFEGVLRGVDMFDCVLPTRIARHGTAMTSTGRVNIKNRKWE
YDFSPLDENCDCECCQNYTKSYLRHLIRCNEGFGMRLLSIHNLRFLLKLMEDIREAIKED
RLLELRDEVYESYGITGDDHPGW
NT seq
1152 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtttaggcaataaaccattgaaattgactttaattaaaaaatcaaatgaatccaag
gcgcgtcttacaactattgaaacgcaccatggtactgttgaaacaccgatgtttatgccg
gtagggacgctagcaagcgtaaaatttctgtcaccagaagatttacgtaaaataggttcc
caagttattttaagtaatacgtatcacctatggttaagacctggggaagatgtagttcgt
caagctggcggactccacaaatttatgaattataatggaccaattttaacagacagtggc
ggatttcaagtgttctcacttggaaaaattcgcacaatttctgaagagggtgttgagttt
agaagtcaccttagcggtgagaaactattcttaacgcctgaaaaagcaattcaggttcaa
aatgcattaggaccagacattatgatgagtttcgatgaatgtcctccttatcctgcaact
tatgaatatatgaaaaattctgtagagcgcacaattcgttgggctgctcgtggtaaagcg
gcacatcaaaatcctgagacacaagcgttattcggtattgtccagggtggtaagtatgct
gaccttcgtgagcattgcgctaaagaattagttgcaatggatttcccaggttattcaatc
gggggaacaagcgttggtgaacccaaagatgttatgtggcaaatgatcgatcatacgatt
gatttcttgcctgaagataaacctcgttatttaatgggtgtaggaagtgttgatgcaatt
tttgaaggcgtactacgtggtgttgatatgtttgactgcgtattacctactcgaattgct
cgacatggtacagcaatgacctctacaggtcgtgttaatattaaaaaccgtaagtgggaa
tatgatttttctccacttgatgaaaattgtgactgcgaatgctgtcaaaactatacaaaa
tcttatttacgacacttaatacgttgtaatgaaggatttggtatgcgtcttctatccatt
cataaccttcgattcttattgaaactcatggaagacatccgtgaggcaattaaagaagat
cgtttacttgaacttcgtgatgaagtttatgagagttatggcattacaggagatgaccat
ccaggatggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
