Erysipelothrix rhusiopathiae Fujisawa: ERH_0922
Help
Entry
ERH_0922 CDS
T01525
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III, alpha subunit
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
erh
Erysipelothrix rhusiopathiae Fujisawa
Pathway
erh03030
DNA replication
erh03430
Mismatch repair
erh03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
erh00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
ERH_0922 (dnaE)
03430 Mismatch repair
ERH_0922 (dnaE)
03440 Homologous recombination
ERH_0922 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
erh03032
]
ERH_0922 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
erh03400
]
ERH_0922 (dnaE)
Enzymes [BR:
erh01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
ERH_0922 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
erh03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
ERH_0922 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
erh03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
ERH_0922 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
HROB
tRNA_anti_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK31977
LinkDB
All DBs
Position
complement(979424..982489)
Genome browser
AA seq
1021 aa
AA seq
DB search
MATHLMVRSHYSLLKGMMPVELICEKAKHNESKSIALTDRHVLFGALDFYDAARKHHIKP
IYGMEITILEDESYYDSLVLARTNEGYQGLIHLSYLLSKQAYISEVDVVPFESELIFIAY
SEQGPFEKGMLSKNLDEVANTMERLKKMFSYFYIGLSHQESGFFSNVNDQLRQMAVLREI
ECVALPKVYYENKDDEEAFRALQAIDKSTYLEDKTLVSSPNRNFISDDDFKVLYTEAELS
LTDTIAEMCNVSIMNLKTELPEFETHQDVSNKVFLEQLSHFGLKRRLNNSVPEKYRERLN
YELKIINEMNFTDYFLIVYDVIRYAKKEGIYVGPGRGSSAGSLVAYCLGIVEIDPIEYDL
LFERFLNPERVSMPDIDIDFPDDKRQYVIDYVRNKYGDDYVAHIVTFGTLKARQAFRDTA
RVLQVPIRKVDQVSKLIDPMMGLRDNYNKNSRFKSLIQSEDLLKKTFELACKIEGMPRHT
STHAAGIVLSKKPLDVVVPVIQLDSETKAVQYEMSHLESIGLVKIDFLGLRNLTIIDNIS
RQINESEAFDIMSIPLDDQKTYELISRAETVGVFQLESDGMKALLKKVKPHKFSDIVDTV
ALFRPGPMENIPLYLENRDHPEKVKYIHDDLKRITESTNGILIYQEQIMQVAQIMAGFSL
ARADILRKAMGKKNAKELDGLKTEFIQGCIDKGHKETFAEELFSLIYKFANYGFNKSHSV
AYGLIAYQLSYLKANYPHLFYTYLLTSVIGSEVKTRQYIDECRRRKVDLRPVNLEQSRNS
YTLEGYAIRLPFTVIKGISKSIGTKIQNEVHDNGPYLNYYNAISRLNLVGIKKNQFELLI
QAGAFDYLNSDRLSMIASLEEALRYANIIRVEKDGQSSLNMDLISEPIFTVVSENRRQVL
NDELVVLGFYFSEHPTLRLKKKHESDSLIEVKVRDKYFRIIAMVDRIKLHRTKKGDQMAF
IQLSDDTGLIDGVVFPSVYDKIKVNLEIGALVLVKGQMREPGSLIIMDMYRFDSKPEFHE
S
NT seq
3066 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgacacacttaatggtccgcagtcattattctcttttaaagggaatgatgcctgtt
gaattaatctgcgaaaaagcaaaacataatgaatcaaagagcatcgccttaacagatcgg
catgttctttttggtgcattagatttttatgatgcagcacgtaaacatcatattaaaccg
atttatggcatggaaattacaatcttggaagatgagtcttattacgattcattagtgctt
gcacgaacaaacgaggggtatcaaggcttaatccatttatcatatttactctcaaaacaa
gcttatatttccgaagtagatgtagtgccttttgaatctgaattaatatttatcgcgtat
tcagaacaaggtccatttgaaaaaggcatgttgagtaaaaatcttgatgaggttgcgaat
acgatggaacgtttaaaaaagatgttttcatatttttatattggtttatcccatcaagaa
tccggattcttttcaaatgttaatgatcagctccgacaaatggctgttttacgtgaaatt
gaatgtgttgcacttcctaaagtgtattatgaaaataaagacgatgaggaagcgtttcga
gcactacaagcaatcgataagagcacgtatttagaagataaaacgcttgtgtcttcgccg
aatcgaaactttattagtgacgatgattttaaagttctttataccgaagcagagctatca
ctgactgatacaatcgctgaaatgtgtaatgtgtcaattatgaatcttaaaacggagtta
ccggaatttgaaacccatcaagacgtaagtaataaggttttcttagaacaactaagtcac
tttggtttgaaacgaaggttaaacaattctgttccagaaaaatatcgtgaacgcttaaat
tatgagctgaaaattatcaacgagatgaattttaccgattatttcttaattgtttacgat
gttattcgttatgctaagaaggaggggatttatgtaggaccagggcgtgggagttctgca
ggttcacttgtcgcatattgcttgggtatcgtcgaaattgatcccattgaatacgacctg
ttgtttgaacgttttttaaacccagaacgtgtttcaatgccggatattgatattgatttt
ccggatgataaacggcaatacgtaattgattacgtgagaaataaatatggtgatgattat
gttgcgcacattgtaacctttgggacacttaaagcacgtcaagctttccgtgatacagca
cgtgttttacaagttcccattcgtaaagtcgatcaagtatcaaagttgattgatccgatg
atgggattaagagacaattataataaaaacagtcgatttaaatcgcttattcaatcagag
gatcttttgaaaaagacctttgaactcgcatgtaaaatagaggggatgccaagacatact
tcaacgcatgcggcaggtattgttttaagcaagaagccgcttgatgttgttgttccagtt
attcagttggattcggaaacaaaagcggttcaatacgagatgagtcatcttgagtccatt
ggtcttgtgaaaattgattttttaggtttgagaaatctaacaattattgataatattagt
cgacaaattaatgaatccgaagcatttgatattatgtcaattccattggatgatcaaaaa
acgtacgaactaatatcacgggcagagacggttggtgttttccaactcgaatcggatgga
atgaaggcgcttttaaagaaagttaaaccacataagtttagtgatatcgtcgatacagtc
gcactatttagaccgggtccaatggaaaatattcccttgtacttggaaaatcgcgatcat
ccagaaaaggttaaatacatccatgatgacttgaagagaattacagaaagtaccaatggc
attctgatctatcaagaacagatcatgcaagttgctcaaatcatggctggatttagttta
gctcgagcagatattttacgaaaagcaatgggtaaaaagaatgctaaagaacttgatggt
ttaaaaacagaattcatacaaggatgtattgataagggccataaggaaacatttgcggaa
gaacttttctcgcttatttataaattcgcaaactatggttttaataaatctcactccgtc
gcgtatgggttaattgcttatcaattgtcatatttaaaggctaattatcctcacttgttc
tatacgtatcttttaaccagtgttattggtagtgaagttaaaacacgccaatacattgac
gaatgtcgacgacgaaaggtcgatttgcgtcctgttaatctagagcaaagccgtaacagt
tatacacttgagggctatgcaattcgtttgccatttaccgttattaaaggtattagtaag
agtatcggtaccaaaattcaaaatgaggttcatgataatggtccgtatttaaattactat
aatgccatcagtcgtttaaaccttgtaggaattaagaaaaaccagtttgaattacttatt
caagcgggtgcatttgattatttaaattcagatcgtctaagtatgattgcatcacttgaa
gaggcattgcgctatgcgaatatcattcgtgttgaaaaagatggtcaatcatcattaaat
atggatttaatcagtgaacccatttttacagtggtatctgaaaatcgaagacaagtttta
aatgatgaattggttgttttaggattttatttcagtgaacatccaaccttacgtttgaag
aaaaagcatgaatcggattcgctgattgaggtcaaagttcgtgataaatattttagaatc
atcgccatggtcgatcgaattaagctgcatcgaaccaaaaaaggggaccaaatggccttt
attcagttaagcgatgatacaggtttgattgatggagtggtatttccgtcagtatatgat
aaaataaaagtgaacctagaaataggagcacttgtcttagtgaaggggcagatgcgtgaa
ccaggatctttgatcataatggatatgtatcgatttgattcaaaaccggagtttcacgaa
tcataa
DBGET
integrated database retrieval system
