Erysipelothrix piscisicarius: EEI45_07910
Help
Entry
EEI45_07910 CDS
T05733
Name
(GenBank) choline-binding protein
Organism
eri
Erysipelothrix piscisicarius
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Choline_bind_3
Choline_bind_1
Glucosaminidase
SH3_3
Choline_bind_2
NusG_II
SH3_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZK44652
UniProt:
A0A3Q8S871
LinkDB
All DBs
Position
complement(1597877..1601134)
Genome browser
AA seq
1085 aa
AA seq
DB search
MKSKKMLALLLSLVILVTSVTYNTFAVDERLNTDVTQEVDVNQKMEFEKESETTEGEASS
EVEEQERPEVQEIKPEVSSKIPVQSLSSVDKLCVQNGWIQKGSAWYYCENGNPIKNWKEI
GGFWYFFKPDGVMKSEVWHQSGNEWYYFSKSGSAVKDDWAQIGGYWYLFDAKSVMLKDQW
TQSGGHSYYLDSEGRAVKSQWKQVGDSAYYFDASSHLIRETSASHTYSVKKIQDDGSIAP
GKPSFVSNSLTEAIGKMNQMGSGYVVTSQDGLSHLGIVAMSSGYAHSLPDRKGLIKDLAS
SETLKIYDNRNLSGSTMTYISSNYKMQYKGTELTDSGKPVIRVNIQGAEGYVDFNKVDLI
PMYYVDKKIPIYLGGNLNDDGYRKVVSPDYYWVKNGEMSLYFSQTYANSGEQGITYAQAP
SWLPESGNPYYSKDGVHFFSDKELNRPMMDGNQPGEFYAYYQWLPVRSFSNIGADDLNAR
LRYLDKTDSIMYGNEQAFIESGHLYGMNPLLLFAQAAHESAYGTSWLAKNKFNLFGWNAV
DSDPSQALAYTGVYNSINYHMSKQLSSYFDVGEWRNAGLSFGNKGSGITVRYASDPFYGI
KVAGIAYTTDRAAGFKDHNGYDLARIKNQTSTSVYKGSNTHSGVYYATNSGLNDQVVINL
GEESGYMKTYLSMPVVNGSVSVKAMPVDLPANLGYIANNAVNKLKANGVKKASAPNLRVT
VADTSKKYTVKQDLNMRSGWGTSNRILATIPAKTIVQAYPTTNGWAKLVYNNQIGYVSQD
YLTTESIPTAPKKGWIKEASKWYYYENNKPVKGWREIGGSFYLFNNSTGVMYANTWTKDA
SGRWSYLNADGKALRNEWFKSAGKWYYAANDGKMLRSGLHLIKGSWYEFGSDADMKLNKW
AKNSKGKWHYLNSSGAAVKNAWVKVSGKWYYADANSEMVTGWKKINGSWYVFDSSTAMLA
NQWYKNASGSWSYVSGSGAALTSQWTKSGGKWYYFLSHAGTARGIHRIGGSSYAFGTDSV
MYANQWVKLNQKWYYATGSGALQKGWIKLGGSWYYLNPSDCVMISNTTMTINGTRYRFDR
SGRML
NT seq
3258 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagtaaaaaaatgctcgcgttgttattgtcgctggtaattcttgtaacgtctgtt
acgtataatacgtttgctgttgatgaacggttaaatacagatgtcacccaagaagttgat
gtaaatcaaaaaatggaatttgaaaaggagtctgagactacggaaggtgaggcatcatca
gaagttgaagaacaagaacgcccagaagttcaagaaataaaaccggaagtttcttcgaaa
attcctgttcaatcattgagctctgttgataaactttgtgttcaaaatggttggattcaa
aaagggtctgcttggtattactgtgaaaatggaaatccaattaaaaattggaaagaaatt
ggcggtttctggtatttctttaaaccagatggagtgatgaagtcggaagtttggcaccaa
agtgggaacgaatggtattattttagtaaaagtggaagtgcagtcaaagatgattgggct
caaattggtgggtattggtatttatttgatgcgaagtcagtcatgcttaaagatcagtgg
acgcagtccggaggtcattcttattaccttgattcagagggacgcgcagtgaaatcgcaa
tggaaacaggtgggggattctgcctattattttgatgcatccagccacctcattcgtgaa
accagtgcatcacatacgtattcagtgaaaaaaatacaagatgacggcagtatcgcaccc
ggaaaaccaagttttgtaagcaatagtctgactgaggcgattggaaaaatgaaccaaatg
ggaagtggctatgttgttacgtcacaggatgggttaagccatttagggattgtcgcaatg
agttctggatatgcgcattcacttccagatcgaaaaggtctaattaaagatcttgcaagt
agtgagacgcttaaaatttatgataatcgtaatctttcaggatctacaatgacatatata
tcaagcaattacaaaatgcaatataaaggaactgagttgacagattcagggaaacccgta
attcgtgttaatattcaaggtgctgaagggtatgttgattttaataaagttgacttaatt
ccaatgtattatgttgataaaaagattcctatttatttaggtgggaatcttaatgatgat
gggtaccgtaaagtagtttctccagactactattgggtgaaaaatggtgaaatgtcactg
tacttctctcaaacgtacgcaaacagtggtgaacaggggataacttatgcccaagcacca
tcatggcttcctgaatcggggaacccttattactcaaaagatggagtacacttttttagt
gacaaagaactgaatcgaccaatgatggatggcaatcaacctggggaattttatgcatat
tatcaatggctccccgttcgaagtttttcaaatataggggccgacgatttaaatgctcgt
cttcgttatttggataaaactgattcaataatgtatggaaatgaacaagcatttattgaa
agtggtcatctctatggaatgaatccactgcttttattcgcacaggctgcgcatgaatct
gcatatggtacatcgtggcttgcgaaaaataagtttaatttatttggatggaatgctgtt
gattctgatccaagtcaagcattggcctatacaggtgtttataatagcattaattatcat
atgtcaaagcaattaagttcttactttgatgttggggagtggcgcaatgcgggacttagt
tttggaaataaaggatcgggaatcacagtaaggtatgcatcagatcccttctacggtatt
aaagtagcgggtattgcgtataccacagatcgagctgctggctttaaagatcataatggt
tatgatttagcgcggattaaaaatcaaacaagtacgtccgtatataaaggctcaaacact
cattcgggggtctattatgcgacgaactcgggtctaaatgatcaagtagttatcaatctt
ggtgaggaatcgggttatatgaagacttatctctcaatgcctgttgtgaatggttcggta
tctgtaaaggcgatgcctgttgatttacctgcaaatctgggttatattgctaataatgcg
gtaaataaacttaaagcgaatggtgtcaaaaaggcgagtgccccaaatttacgtgtgact
gttgcggacacgtccaaaaaatatacagtcaaacaagatcttaacatgcgcagtggttgg
gggacatcaaaccggatcttagctacaattccggcaaaaacgattgttcaagcatatccg
actacaaatggttgggctaaacttgtttacaataatcagattgggtatgtttctcaagat
tatctaacgactgaatcaattccaaccgctcctaaaaagggttggattaaagaagcttca
aaatggtattattatgaaaacaataaaccggtaaaagggtggcgtgaaataggtggtagt
ttttacctctttaataatagcactggagtgatgtatgcaaacacctggactaaggatgca
tcaggccgttggagttatctcaatgcggatgggaaggcattaagaaatgaatggtttaaa
tctgcagggaaatggtattatgcagctaatgacggtaagatgcttcgatcaggtcttcac
ctcataaaaggttcgtggtatgaatttggttcagatgctgatatgaaactcaataaatgg
gctaaaaattcaaaaggaaaatggcattatctcaattcaagtggtgctgctgtaaaaaat
gcatgggttaaagtgagtggaaaatggtactatgctgatgcaaacagtgaaatggtcacg
ggatggaaaaaaatcaatggaagttggtacgtctttgattccagtacagcaatgcttgcg
aatcaatggtataaaaatgcaagtgggtcatggtcttatgtttcaggatcaggggctgcg
ttaacaagccaatggacaaagtcagggggtaaatggtactacttcttaagtcatgccgga
actgctcgcggcattcatcgcattggtggttcgagttatgcatttggtacagattctgta
atgtatgcgaatcaatgggttaaactgaatcaaaaatggtattatgccacaggttcgggt
gcacttcaaaagggttggattaaattgggcggttcttggtattatttaaatccaagtgat
tgcgtaatgatatcaaatacaacaatgaccataaatggaacgcgttatcgctttgatcgt
tcaggtcgcatgctctag
DBGET
integrated database retrieval system