Thomasclavelia ramosa: EYR00_02220
Help
Entry
EYR00_02220 CDS
T06753
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
erm
Thomasclavelia ramosa
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TNFR_16_TM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QMW73567
LinkDB
All DBs
Position
457471..460152
Genome browser
AA seq
893 aa
AA seq
DB search
MKSATQNVTAQTSKIKSAISGIKSALVGLAVGTGLLKLGKEALQVASDLTEVQNVVDVAF
GSMAWKAEKFSKSALEAFGMSELSAKKTSGTYMTMAKSAGINENAASDMAVTLAGLTGDV
ASFYNISQDLADVRLKSVFTGETETLKELGVVMTQTNLQAYALSQGINKNISDMNQAEQT
TLRYNFVLDRLAFVQGDFARTSSSWANQIRILQERFKQLLGIIGNGLIAALTPVVQFLNM
IIGKLITFANVVSAVFGRLFGKKSAGQQASNGFTSASNAAKTATASTGGLNNALKGTEGQ
AKKTAKALGSLAGFDELNTISASDSSSGSGGSGAGTGGGGYAIDPIDWGSAFEEPDTSGI
EATVDKVMVYVNRLKEFLKTNAPVITSLLSGVLAGFVAFEVIKNWAALTGPIKNLFTNIG
ALFALFKDVGVIETLSVMLTGLNTPMLAIVGVITAVTAALVYLYQTSESFRNLVNDAVGA
LLGILQNFYTSCLLPIFDTLVMLFNTVLLPLGNLLTDVFLTVVEAIASIALAFWTNILAP
IADFLVSVLGIAIQAVCDILQGWMPAINTVIETLSKLWNTMLKPIVEFIKTAFITIFEIA
GSVIKTVADIILGAFQVVADFFVGIFTLNMSDTWEKVCKIFSNAWDSICETFAPLGEWFG
QQWENVKTAFSDVAEWFGTIFDHAWDNICGAFSRTGEFFKGVWNNITDAFGNIVDWFKGK
FSDAWTAVKNVFSTGGAVFDGIKDGILNGLKAVVNAIIKGINKVIKIPFDGINSALKSIK
KVSILGLKPFDWISTISVPQIPLLAEGTVVNKPTLGIFGEAGTEAVIPLKRNTQGLDLIA
EKLADRLSFDGDSGNGATYVINFVLENGKVLTKMVIDNIKEYEVQTGKPVFDY
NT seq
2682 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagtcagctacccagaatgttactgcgcagacatctaaaatcaaatcagctatatca
ggtataaaatcagcacttgtaggattagcggttggaactggactgttaaaacttggtaaa
gaggctttacaggttgcaagtgatcttactgaagtgcagaacgttgtagatgtagcgttt
ggctccatggcgtggaaagctgaaaagttttctaaatcagcacttgaagcatttgggatg
agcgagttaagcgccaagaaaacatcgggcacttacatgactatggctaaaagtgccggt
ataaatgaaaacgcagccagtgatatggcggtcactttggcaggtttaacaggtgatgtc
gcatcattttataacatatctcaagatcttgctgatgtgcgtttaaaatctgtttttaca
ggtgagacagaaactttaaaagagctaggtgttgtaatgactcaaacaaatctccaggct
tatgcattgtcacaaggtattaataaaaatataagtgatatgaatcaggcagagcaaaca
actttaagatataactttgttttggatagattagcctttgttcaaggcgatttcgcaaga
acaagcagcagctgggctaatcaaattcgtatccttcaggaacgatttaaacagcttttg
gggattatcggaaacggcttgattgccgcattaacgcctgtagtacagtttttgaatatg
attattggaaaactgattacatttgcgaatgttgtaagtgcagtttttggtaggttattt
ggcaagaagtcggcaggacagcaggcatcgaatggttttacttctgctagtaacgctgca
aaaacagcaacagcttctacaggtggactaaataatgcattaaagggtacagaaggtcaa
gccaagaaaacggctaaggcgttaggttcattggccgggtttgatgaattaaatacaatc
agtgcgagtgattctagttctggtagtggtggctctggcgctggtaccggaggtggcgga
tatgccattgatccaatcgactggggcagtgcgtttgaggagccggatacgagcggtatt
gaggctactgttgataaggtgatggtctatgtcaataggcttaaagagtttctcaagacc
aatgctcctgtcattacaagtctgttatctggagttttagcgggctttgttgcttttgag
gtgatcaaaaattgggccgcattaacgggcccaataaaaaatttatttactaatataggt
gcattatttgctttattcaaggatgttggggtaattgaaacattgagtgttatgcttacc
ggattaaatactccaatgcttgcaattgtaggtgttattacagctgtaaccgcagcactt
gtttatttatatcagactagtgagtcttttagaaatcttgtgaatgatgcggtaggtgct
ttattaggaatacttcagaatttttatacaagctgccttttaccaatttttgatacgctg
gtaatgctttttaatacagtgctgctcccattggggaatttattaacagatgtattttta
acagtagtagaagctatagcaagcattgctttagcattttggactaacattcttgccccg
attgcggattttcttgtcagtgttttaggaatagcaatacaagctgtgtgcgatattctt
cagggatggatgccggctattaatactgttattgaaactttatcaaagttatggaataca
atgctaaaacctattgtcgaatttataaagacagcgtttattacgatatttgaaattgct
ggctctgttattaaaaccgttgccgatattattcttggtgcatttcaagtggtagctgat
ttctttgttggaatctttacactaaatatgagtgatacatgggagaaggtttgtaagata
tttagcaatgcatgggatagtatctgtgaaacatttgcgcctttaggtgaatggtttggg
cagcagtgggaaaatgttaaaactgcattttctgatgttgcggaatggtttggaactata
ttcgatcatgcatgggacaatatatgcggtgctttcagcagaactggggagtttttcaaa
ggcgtatggaacaatattactgatgcatttggaaatattgtggactggttcaagggcaaa
ttcagcgatgcatggacagcagttaaaaatgtatttagtacaggaggtgctgtattcgat
ggtatcaaagacggtattctaaatggcttaaaggctgttgtaaatgcaattattaaagga
atcaataaagtaattaaaattccattcgatggtataaacagtgcattaaaatcaataaaa
aaagtaagtattttaggacttaaaccttttgactggattagcacgataagcgtaccacaa
attcctttgctagccgaaggaacagtggtaaacaaaccaactttaggtatttttggtgag
gcaggtactgaggctgtaattccattgaaacgtaatacccagggacttgatctgattgct
gaaaaattagcagatagattatcttttgatggggatagtggaaatggagcaacttatgtc
attaattttgttttggaaaatgggaaggtactgaccaagatggtaattgataatattaaa
gaatatgaggtacaaactggtaaaccagtgtttgattattaa
DBGET
integrated database retrieval system
