KEGG   Thomasclavelia ramosa: EYR00_04880
Entry
EYR00_04880       CDS       T06753                                 
Name
(GenBank) stage V sporulation protein D
  KO
K08384  stage V sporulation protein D (sporulation-specific penicillin-binding protein)
Organism
erm  Thomasclavelia ramosa
Pathway
erm00550  Peptidoglycan biosynthesis
erm01100  Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:erm00001]
 09100 Metabolism
  09107 Glycan biosynthesis and metabolism
   00550 Peptidoglycan biosynthesis
    EYR00_04880
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01011 Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:erm01011]
    EYR00_04880
Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:erm01011]
 Peptidoglycan biosynthesis and degradation
  DD-Transpeptidase (Class B PBP)
   EYR00_04880
SSDB
Motif
Pfam: Transpeptidase PBP_dimer PASTA
Other DBs
NCBI-ProteinID: QMW74068
LinkDB
Position
1023268..1025169
AA seq 633 aa
MIYEITKKKIKWVKVVTVLIVIAIILKVGYIQIIDRVNIYNKAVDLWQRSFPVEANRGLI
VDSDNNVLATNLTTASLVVVPSQIKDVAATADKIANILNVDVKVMQEKLSKKVSIQRIQP
EGRQLDDEVAAQIDRLKLPGVYLIKDTKRYYPNDNYLGQTLGFVGIDNQGLLGLELKYDN
YLNGNNGSIDYYMDAKSNPLSLYPSVYSAPTSGFNLQLTIDGDIQDIVERELNNAYDTYN
PDGIWALAMEPSTGKVLAMASKPDYNPNDYQNADKDVYNHNIPIWKSYEPGSTFKIITFS
SALNENLFDMDKDTYFDKGYEIVGGARIKSWKKGGHGLQTFREVLQNSSNPGFVEIGRRL
GKDKLYEYVKKFGLTEKTGIDLPGESKGIMFDYDAFNELEQATVAFGQGISITPMQLVRA
VCACVNGGTLYKPYLVDKIIDSYSNDIVYEHKPEALRKVISEDASKKMRDALESVVTDGG
GKNAYIDGYRIGGKTGTAQKAVNGSYVDGGYILSFIGIAPIDDPKIVLYVAMDNPKNCVQ
YGGTTVAPIARKMLVDILPSMNVKKVSSQRQKAYTFMDTKTLKVENYIGKSKKEVSNPEL
KFEFIGEGDKVIDQLPRVGESVEAGSTIVIMLG
NT seq 1902 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatctatgagataacaaaaaagaaaatcaaatgggtaaaagtagtaacagttttgatt
gtaattgcaataattttaaaagttggctatattcaaattattgatcgagtcaatatttat
aataaagcagtggatttatggcagcgtagttttccagttgaagctaatcgtggattgatc
gttgatagtgataataacgttctagcaacaaatctaacaactgcttcactagttgttgtt
cctagtcaaattaaagatgtggcggctactgctgataaaattgcaaatattttaaatgtt
gatgttaaagtaatgcaagaaaaattaagtaaaaaagtttcaatccaaagaattcagcca
gaaggacgacaattagatgatgaagtagcagcacaaatcgatcgtttaaaattacctggg
gtatatttaattaaagatactaaacgatattatcccaatgataattatttaggacagact
cttggcttcgtaggaattgataatcaaggattattaggtttagaattaaaatacgataat
tatttaaacggaaataacgggagtattgattattatatggatgccaaaagtaacccgttg
tcactgtatccaagtgtttatagtgctccaacgagtggttttaatttacaattaacgatt
gatggtgatattcaggatattgttgaaagagaactgaacaatgcatatgacacttataat
cctgatggaatctgggctttagcgatggaaccaagtactggaaaagttttagcgatggca
agtaaacctgattataatcccaatgattatcaaaatgccgataaggatgtttataatcat
aatatcccaatttggaaatcttacgaaccaggatcaactttcaagatcattactttttca
tcggctttaaatgaaaatctatttgatatggataaagatacttattttgataaagggtat
gaaattgttggtggtgcccgaattaagtcatggaaaaaaggtggacatggacttcaaacc
tttagagaggttcttcagaattcttccaaccccggatttgttgaaatcggtcgccgtcta
gggaaagataaattatatgaatacgtcaaaaaatttggtttgacagaaaaaaccggtata
gacctaccaggtgaatctaaaggaattatgtttgattatgatgccttcaatgagttggaa
caagcaacagttgcttttggtcaaggtatttcaattacacctatgcagctggtgagagca
gtttgtgcttgtgttaacggtggaactttatataaaccatatttggttgataaaattatt
gatagttattctaatgatattgtttatgaacataaaccagaggcactacgtaaagttatt
agtgaggatgcttccaaaaaaatgcgagatgctttagaatcagttgttacagatggaggg
ggtaaaaatgcctatatagatggttaccggatcggtggtaaaacaggtactgcccaaaaa
gcagtaaatggtagttatgttgatgggggttatatcttatctttcattggtattgcgcca
attgatgatcctaaaattgttttatatgttgcaatggataaccctaaaaattgtgtgcag
tatggaggaacgacagtagctccaattgctcgcaaaatgcttgttgatattttgccaagc
atgaatgtaaaaaaagtttcttcacagcggcaaaaagcttatacatttatggatactaaa
acgttaaaggttgaaaactatattgggaaaagtaaaaaggaagttagtaatccggaatta
aaatttgaatttattggcgaaggtgataaagtaatagaccaattaccacgagttggtgag
tcagttgaagccggatcaacaatcgttattatgcttggttaa

DBGET integrated database retrieval system