KEGG   Thomasclavelia ramosa: EYR00_04890
Entry
EYR00_04890       CDS       T06753                                 
Symbol
rlmD
Name
(GenBank) 23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD
  KO
K03215  23S rRNA (uracil1939-C5)-methyltransferase [EC:2.1.1.190]
Organism
erm  Thomasclavelia ramosa
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:erm00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:erm03009]
    EYR00_04890 (rlmD)
Enzymes [BR:erm01000]
 2. Transferases
  2.1  Transferring one-carbon groups
   2.1.1  Methyltransferases
    2.1.1.190  23S rRNA (uracil1939-C5)-methyltransferase
     EYR00_04890 (rlmD)
Ribosome biogenesis [BR:erm03009]
 Prokaryotic type
  rRNA modification factors
   23S rRNA modification factors
    EYR00_04890 (rlmD)
SSDB
Motif
Pfam: TRAM Methyltransf_31 MTS tRNA_U5-meth_tr MetW
Other DBs
NCBI-ProteinID: QMW74070
LinkDB
Position
1026567..1027874
AA seq 435 aa
MKKNVEIKKLGINGEGIGYIDRKIVFVPGALPQEEVIVEIIKQTRTYSEGKLLQVVKPSK
DRVTPKCRSYDNCQGCTMLHLSYFKQLNAKKEAVRESIRKYTEYDLSRTIFKDVIAAPSQ
EGFITAVNLPIVDFKGKISFGIYQRDSKYLTLMTRCFKQHPIINECLLKLEEILTTNKCK
TYSDKFRTGLRFLKVKLIDNKLQLVFITGRDGLKEEIVKEISQLPHVASIFMSVNTSKHQ
EFDELGYSKLYGATRLELHDDKNQYLVSVKSKLPENIEMMWKQNQTIKSLVQDSQKIISL
NCGIGLLELNLDQEIVAIDEKRYQIDDAKLNAKYLKKENVTFIAGDLDSKIVTYAKKKVY
DTLIIQNERYGLSDTIKDTIKIAKFKTIIYACQSHSTLAKDLADLEKNYKLERIIGLDTS
CHNSYLTTIVKLVRK
NT seq 1308 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaagaaaaatgtagaaattaaaaaattagggattaatggtgaaggtatcgggtatatt
gatcgaaagatcgtttttgttcctggagcgttgccacaagaagaagttattgttgaaatt
attaaacagactagaacttatagcgaagggaaattactacaagtagtaaaaccatcaaaa
gatcgtgttacgcctaagtgtcgttcgtatgataattgtcaagggtgtacgatgttgcat
ttaagttatttcaagcagttgaatgcaaaaaaagaagctgtacgcgaatcaattagaaaa
tatacagagtatgatttatcaagaacaatttttaaagatgtaattgcggcgcctagtcaa
gagggctttattactgctgttaatttgcctattgttgattttaaagggaaaattagtttt
ggaatctatcaacgtgatagtaaatatttaacattaatgacaagatgttttaaacaacat
ccaataattaatgagtgtttattaaaattagaagagattttaactacaaataaatgtaaa
acatatagtgataaatttagaacaggattaaggtttttaaaggttaaattaattgataat
aaattacaattagtttttattacaggtcgtgatgggttgaaggaagaaattgttaaagaa
attagtcaattgccacatgttgctagtatcttcatgtctgttaatacttcaaagcatcaa
gagtttgatgagttaggatattcaaaattatatggggcaacgagactagagttgcacgat
gataaaaatcaatatctagtatcggttaaaagtaaattaccagaaaatattgagatgatg
tggaaacaaaatcaaacaattaaatcattagtacaggacagtcaaaaaataatttcgttg
aattgtggaattgggttattagaacttaatcttgatcaagaaattgtagcgattgatgaa
aaaagatatcaaattgatgatgctaaattaaatgctaagtatttaaagaaggaaaatgtt
acttttattgctggtgacctagatagtaaaattgttacatacgctaaaaagaaagtctat
gatactttaattattcaaaatgaacgttatggattaagtgatacaatcaaagatacaatt
aaaattgctaaatttaaaacaattatctatgcttgtcagtcacattcaactttagcaaag
gatttagctgatttagaaaaaaattacaaattggaaagaattattggcttagatacatct
tgtcataattcatacctaacaacgattgtaaaattggttcgaaaataa

DBGET integrated database retrieval system