Thomasclavelia ramosa: EYR00_10420
Help
Entry
EYR00_10420 CDS
T06753
Symbol
pepF
Name
(GenBank) oligoendopeptidase F
KO
K08602
oligoendopeptidase F [EC:3.4.24.-]
Organism
erm
Thomasclavelia ramosa
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
erm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
erm01002
]
EYR00_10420 (pepF)
Peptidases and inhibitors [BR:
erm01002
]
Metallo peptidases
Family M3
EYR00_10420 (pepF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_M3
Peptidase_M3_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QMW75093
LinkDB
All DBs
Position
2133357..2135132
Genome browser
AA seq
591 aa
AA seq
DB search
MERKDIDIKDTWDLSTIYNSHEAFYQDLEKTKSLINDLITFKGKICNSIDSFYNFLTTKD
TVERLMNKLYCYAHLNCDVEPKNQEYQTMMATIMGVLEASSVQISFVDNEIIEAKDKVLE
YLKDPKLEKYTYKINSLLSYEAHILPKEQEELLAKVESIADTSSQVFNALRLEYEDVEED
GKLKTLNNATLNQFLKNKDEKVRKQAYTNFFKEYQRYENVFAQTLAGVMKKDAFYADVRK
FNSALEASVFDDDVPSELFFKVLESANVKYRHLFHRYNRLKKELLKKDVIYNYDLNIPLV
SSINKKYTIDQCFEIINECLRPFGQDYLDIINKARNERWIDYYPTPGKRIGAYSSGSYDT
NPFILMNFIGDYNSLSTMIHELGHSVHSYLSNHHQDAVNANYRIFVAEVASTVNETLLIN
YMIKNAKNDQEKAYFIYEQLENCVGLIFRQPMFADFEYKLHTMAENNEPLSSKVITDLYA
RLNQEYYGKDVTMDELVGWSCYYVPHFYYDYYVYKYTLGMTVALAIVNRILKGNQQQVTD
YLNFLKSGGSKAPVELLKQAGVDPLDDQIYEDAFKYFEELLNQFETIKKNA
NT seq
1776 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagagaaaagatattgatattaaagatacatgggacttaagtactatctataatagc
catgaagctttctatcaggatttagaaaaaactaaatctttaattaatgatctaattact
ttcaaaggtaaaatttgtaatagtattgatagcttttataattttttaacaacaaaagat
acggttgaacgattaatgaataaattatattgctatgctcatttaaattgtgatgtcgaa
ccaaaaaatcaggaatatcaaactatgatggccactataatgggagttttagaagcttcg
tcagtacaaatatcatttgtcgataatgaaatcattgaggctaaagataaagtactggaa
tatttaaaagatccaaaattagaaaaatatacttacaagattaattcattattatcatat
gaagcacatattctgcccaaagaacaagaagaattattagctaaagtggaaagtattgct
gatacttctagtcaagtattcaatgctcttcgtcttgaatatgaagatgttgaagaagat
ggaaagttgaaaacattaaataatgctactttaaaccaattcctaaagaataaagatgaa
aaagtacgtaaacaagcatatactaatttctttaaagagtatcagcgctatgaaaatgtc
tttgctcaaacattggccggggtaatgaaaaaggatgctttttatgccgatgtacgtaaa
ttcaatagtgctcttgaagctagcgtttttgatgatgatgttcctagtgaattatttttt
aaagttttagaaagtgcaaacgtcaaatatcgacacttatttcatcgctataaccgacta
aaaaaagagcttctaaagaaagatgttatttataattatgatttaaatattccactagta
tcttcaatcaacaaaaagtatacgattgatcagtgttttgaaattattaatgaatgtctt
agaccatttggtcaagattatttggacattattaataaagctcgaaatgaacgctggatt
gattattatcctacaccaggtaaacgaattggtgcttattctagtggcagttatgacact
aatccttttatcttaatgaattttattggtgactataattctctttctactatgatccat
gaacttggtcatagtgttcatagttatttatctaatcatcatcaagatgcagttaacgct
aattatcgtatttttgttgctgaagttgcttcaactgttaatgaaacgttactgattaat
tatatgatcaaaaatgctaaaaatgatcaagaaaaagcatactttatttatgaacaatta
gaaaactgtgttggtttgatttttagacagccaatgtttgctgattttgaatataaattg
cacacgatggcagaaaataatgaaccattatcatcaaaagttattactgatctatatgca
cgacttaaccaagaatattatggaaaagatgtaactatggatgaactagttggctggtca
tgttattatgtaccacatttctattatgattattatgtatataaatatacgttaggtatg
accgttgccttagccatagttaatcgtattttaaaaggtaatcagcagcaagtaactgac
tacttaaatttcttgaaatctggaggcagcaaagcacctgttgagcttttaaaacaagcg
ggtgttgatcctttagatgatcaaatttatgaagatgcatttaaatattttgaagaacta
ttaaatcaatttgaaacaattaaaaaaaatgcttag
DBGET
integrated database retrieval system