Thomasclavelia ramosa: EYR00_11845
Help
Entry
EYR00_11845 CDS
T06753
Name
(GenBank) transcription antiterminator
KO
K03491
probable licABCH operon transcriptional regulator
Organism
erm
Thomasclavelia ramosa
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
erm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
erm03000
]
EYR00_11845
Transcription factors [BR:
erm03000
]
Prokaryotic type
Other transcription factors
BglG family
EYR00_11845
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PRD
HTH_11
Mga
HTH_Mga
HTH_DeoR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QMW75371
LinkDB
All DBs
Position
complement(2445667..2447526)
Genome browser
AA seq
619 aa
AA seq
DB search
MSVVTKRQLNLLQVFMDSNRYLTGQKLSQLLNVSSKTIRNEIKILNQLMNNFALIQSIPS
HGYQISIFDDDLFNCWIDKVSKQWSYFIPTNPLERAYYILGLMLESQEFIKIDDISDILF
IDRTSVSRSLKYIRERLNDFDLKIVQKTGKGLKIEGEEFRYRLCMAEYIYHKIGMLSTKI
GEDHEFIDELRKVIFNDGITMPQRVFQNFIIHIQVQLNRIQRKCYISFHDNEIEKMKMEY
EFLVAKDVSKVINKYFHIELSVEEQCYLAIHILGKKSNSTSAIESCINDQLKEEIDIIVE
KMFNQVKKVFNIDFHNDMYLRKALGIHINPMENRLKFNTYSRNPLIYVIKENYTLAYILS
MEAWLAIYNNADYINVEDEIGYIAIHFQYALERRKRNIAKKRVLLINEYNVAMSELLSFS
ILKRYKDSLVIEKTISAGELSKYHLESYDYIITTVPLDESLDIPVIHIHPIITTHDFEVL
NKYFRQINEYKLSDFLKKEDTYFIDCETKDDVISYIFEHESVSFETFYHTNPLIGFETSL
QTVIHYMPIYNQKSSINAYLLSKPIVWKNKLVKIIFVLKLGIDSEQLLQSLQEFFFQKEC
MDTFLNNMFLEEGDEHNKL
NT seq
1860 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgttgttactaagagacaattaaatcttttgcaagtatttatggattctaataga
tatttaactggacaaaaactatctcaattattgaatgtgagttctaaaactattagaaat
gaaattaaaatacttaatcaattgatgaataactttgcacttattcaatcaattccttct
catggttatcaaattagtatttttgatgatgatttgtttaattgttggattgataaagta
tctaagcaatggagttattttattcctacaaatcctttagaaagggcttattatatttta
ggtttaatgctcgaaagtcaagagtttattaaaatcgatgatatatctgatattttattt
attgatagaacttctgttagtcgaagtttaaaatacataagagaacggctaaatgatttt
gacttaaaaatagtgcaaaaaaccggtaaaggattaaaaatagaaggtgaagaatttcgt
tatcgattatgtatggcggaatatatttatcataagatagggatgttatcaacgaaaatt
ggtgaagatcatgaatttatagatgaattaagaaaagttatttttaatgatggtattacg
atgccccaaagggtatttcaaaattttattatacatattcaagttcaattgaatcgtatt
caaagaaaatgttatatctcatttcatgataatgagattgaaaaaatgaaaatggaatat
gagtttttagtagcaaaggatgtttcaaaagttattaataaatattttcatattgaatta
tcagtagaggaacaatgctatttagctattcatattttaggaaaaaaaagcaattcaact
agtgcaatcgaaagctgtatcaatgatcaattaaaagaagaaattgatataattgtagaa
aaaatgttcaatcaggttaaaaaagtctttaatattgattttcacaatgatatgtactta
agaaaagcattggggattcatatcaatccaatggaaaatcgtttgaaatttaatacttat
tcacgaaatccgctgatttatgttattaaagaaaattatactctagcatatatcttgagt
atggaagcatggcttgctatttataataatgcagattatataaacgttgaagatgaaata
ggctatatcgctattcattttcaatatgctttagagagaaggaaaagaaatattgcgaag
aaacgggttttattaattaatgagtacaatgtggcaatgagtgaattattaagtttctct
attttaaaaagatataaagattcattggttattgaaaaaacaatctctgctggggaactt
agtaaatatcatttagaaagttatgattatattattacaactgtaccacttgatgaaagc
cttgatattcctgttatacatattcatcctataataactactcatgattttgaagtttta
aataagtattttcgacaaattaatgagtataaattatctgattttttaaaaaaagaagat
acttattttattgattgtgaaacaaaagatgatgttatttcatatatatttgaacatgaa
agtgtctcatttgaaacattttatcatacaaatccattaattggttttgaaacaagttta
caaactgttattcattatatgcctatctataatcaaaagagttcaataaacgcttatctt
ttatcgaaaccgattgtatggaaaaataaattagttaaaattatttttgtattgaaatta
ggaatcgatagtgaacagcttttacaaagcttacaagaattcttctttcaaaaagaatgt
atggatacatttttaaataatatgtttttagaagaaggcgatgaacataataagttataa
DBGET
integrated database retrieval system