Thomasclavelia ramosa: EYR00_15220
Help
Entry
EYR00_15220 CDS
T06753
Name
(GenBank) EAL domain-containing protein
Organism
erm
Thomasclavelia ramosa
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_3
PAS_9
PAS_11
DUF4284
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QMW75991
LinkDB
All DBs
Position
complement(3180506..3183040)
Genome browser
AA seq
844 aa
AA seq
DB search
MGFDDFKQLVDNMQINLYLTDIQTNEIIFMNNKMKETYNLKDPEGKICWKTLQKNQSGPC
PFCPLIKLKQINNLYQSISWRENSDLTNRIFENYDSLIKWENGKIVHMQQSIDITDSEIL
SHQASIDDLCGLLNRRAGKEKLLEFMVKKKKAKESFTIALLDINNLKRVNDSFGHQEGDF
LLKQIAYAVKQDLDKEDLIFRLGGDEFVLVFGHKNTKDSAKFLIENQKNIQKLQALYNKP
YGFSYAFGMYTVLPTNKLTVNDVITRADEQMYQEKLRYRRTQLAELEDVSVGSTNVACFQ
YDPTQLYEALIKSTDDFIYICNMKTGIFRYSPAQVKVFNLPGEIIDHPLPFWKAIVHPQD
WERFYKSNMAIGENKMDYHSVEFRAMNSDGEYIWLKCRGQLMRDEFGEPNLFAGIMTQLD
RQNKIDPLTHLYNRQEFAKAFELKTKDKAIDNLGIMVIDIDDFKNINEIYDRSFGDFIIK
TVAQLTQAVLPGNTSIYKLDSDQMGLLIENSTELEITKLYNEIQKQLLHEQLLKRYKCPI
QISAGCAIYPKDGLTYNELNKYADYSLQYAKDNGKNKLTFFSNYILEHKMRSLEILKYIR
ESVSDDYRGFELNYQPQVEVSSKQIKGVEALLRWQCQELGKVSPVEFIPILEESGLIIPV
GLWVIKKAIQACSKWVVYDPEFSVSINVSALQMLNSDFVKDVKKVLKKEKLAPKNIVLEL
TESYMVRNMDLLRTIFEQLRELGFKIAMDDFGTGYASLEILKTVPADIVKIDQTFVRDIK
ISKFDKTFIRFIAQICHDVDIEVLLEGIETEEEFNVVEPMELDYIQGFLFGRPQSEEEIT
NKLI
NT seq
2535 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggttttgatgattttaagcagctggtagataatatgcaaattaatttatatcttaca
gatattcaaacaaatgaaataatttttatgaataataagatgaaagaaacttataatttg
aaagatccagaaggtaaaatatgttggaaaacacttcaaaagaatcaaagcggaccatgt
ccattttgtccacttatcaaattaaaacaaattaataatttatatcagtcgattagctgg
cgtgaaaatagtgatcttactaatcgtatttttgaaaactatgatagtttaattaaatgg
gaaaatggtaaaattgttcacatgcaacagtcaatcgatattactgattctgaaatccta
agtcaccaggctagtattgatgacttatgtggattattaaatcgtcgtgctggaaaagaa
aaactgctcgagtttatggtgaaaaagaaaaaagctaaagaaagctttacaattgcttta
ttagatataaataatttaaaaagagtaaatgattcttttggtcatcaagaaggagatttt
ttattaaaacaaattgcttatgcagtaaagcaggatcttgataaggaagatcttatcttt
agattaggtggagatgaatttgttctagtttttgggcataaaaatactaaggatagtgct
aaatttttaattgagaatcaaaaaaatatacaaaagctgcaagctttatacaataagcct
tacggattttcatatgcttttggaatgtatacagttttaccaactaataaattgactgtt
aatgatgtgataactagagcagatgaacaaatgtatcaggaaaagttgcgatatcgtcga
actcagttagcagagttggaagatgtttcagtaggatctactaatgtagcttgttttcaa
tatgatccaacacaactttatgaagctttgatcaaaagtaccgatgattttatttacata
tgtaatatgaagacaggtatttttagatattcaccagcccaagtaaaagtttttaattta
ccaggagaaattattgaccatcctttaccattttggaaggcaatcgtacatccccaagat
tgggaacgtttttataaatcaaatatggcaattggcgaaaataagatggattatcattct
gttgaatttcgagcgatgaatagtgatggtgagtatatttggttaaaatgtcgtggacag
ttaatgcgcgatgaatttggtgagcctaatttatttgctggaataatgacacagttagac
cgtcaaaataaaattgatcccctaactcatttatataatcgtcaagaatttgcgaaagct
tttgagcttaagactaaagataaagcaatcgataatcttggaattatggttattgatatt
gatgactttaaaaatattaacgaaatatatgaccgttcatttggggattttattattaaa
acagtagcccaattgactcaggcagttttgccaggtaatactagtatttataaattggat
agcgatcaaatggggctgttgattgaaaatagtaccgaattggaaattactaaattatat
aatgagatacagaaacaattattgcatgaacaactattaaaacgttataaatgtccgatt
caaatttcagctggatgtgcaatttatcctaaagatgggttaacatataatgaactaaat
aaatatgctgattattcattacaatatgccaaggataatggaaaaaataaattaactttc
ttttcaaactacatccttgagcataagatgcgttcattagaaattttaaaatatattcgt
gaaagtgtaagtgatgattatcgtggcttcgagttaaattatcagccccaagttgaggtg
agtagtaaacaaatcaaaggagttgaggcattgttaagatggcagtgtcaagaattagga
aaagtatcaccagttgaatttattcccattcttgaagagagcgggctaattatcccagtt
ggtctatgggttataaagaaagcaattcaggcttgttcgaagtgggtcgtatatgatcct
gaattttctgttagtattaatgtatctgcgcttcagatgttaaatagtgattttgtgaaa
gatgtaaaaaaggttctgaaaaaagaaaagctggcacctaaaaatattgtcttagaatta
acagagagctatatggttaggaacatggatttactaagaacaatttttgagcagcttcgc
gaattgggatttaaaattgcaatggatgattttggaacggggtatgcctcattggaaatt
ttaaagactgttcctgctgatattgtcaagattgatcaaacgtttgtacgtgatattaag
attagtaaatttgataaaacttttattcgttttattgctcaaatttgccacgatgttgat
attgaggtattgttggaaggaattgaaacagaagaggaatttaatgttgttgaaccgatg
gaattagattatattcaaggattcttgtttggacgtcctcaaagtgaagaagaaattacg
aataagttgatataa
DBGET
integrated database retrieval system
