Etheostoma spectabile (orangethroat darter): 116703650
Help
Entry
116703650 CDS
T08457
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 2-like
KO
K20995
Notch 3
Organism
esp
Etheostoma spectabile (orangethroat darter)
Pathway
esp04330
Notch signaling pathway
esp04371
Apelin signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
esp00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
116703650
04371 Apelin signaling pathway
116703650
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
EGF_2
Ank_2
Ank
NODP
Notch
NOD
EGF_3
Ank_3
Ank_5
Ank_4
EGF_Teneurin
cEGF
EGF_DL_JAG
DUF7472
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
116703650
NCBI-ProteinID:
XP_032394412
LinkDB
All DBs
Position
15:complement(11564659..11593920)
Genome browser
AA seq
2473 aa
AA seq
DB search
MEGDIPWIILSFLLFMHICEGFRCVDKYRPCENGGTCLDSSSRCICRPGFIGPLCQHLDP
CHRSPCLNGAACKSQVVNGIPQYTCVCQRGFRGQDCSLIDACATSPCANGARCANWNNHY
NCSCPPGFQGKNCRNDIDECRKPGTCLNGGLCINTHGSFHCKCQPGYSGRTCEVSTLPCA
PSQCLNGGTCRQTSDHSYECACLPGFEGHNCENNVDDCPGHKCMNGGICVDGVNTYNCQC
PPEWTGQYCAEDVNECLMQPNACHNGGTCFNTIGGHTCVCVNGWTGDDCSENIDDCVIAV
CFNGATCHDRVASFFCECPVGKTGLLCHLDDACVSNPCNEGAVCDTNPLNGRAICTCPAG
FVGGACNQDMDECSIGANPCEHFGKCVNTEGSFQCQCGRGYAGPRCEIDINECLSMPCQN
DATCLDRIGEFTCICMPGYMGTYCEVDVDDCESNPCVNDGICRDMVNGFTCTCQPGFTGT
MCQIDIDECASTPCQNGAKCYDRPNGFECRCAEGYEGTLCESNINNCQPDPCHHGTCVDG
IASYTCNCDAGYTGYRCENQLNECHSNPCQNGGKCVDLVNKYICQCQHGTSGTNCEINFD
DCASNPCDYGICKDGINRYDCVCKPGFTGSKCNVEIDECASSPCRNGGTCVDEENGFHCQ
CPEGFKPPYCYSQVDECGSSPCVHGSCRDDINGYRCDCEPGWVGKNCDLDRNDCLPSPCQ
NAGTCIDQLNGFTCKCRQGFRGNLCQVNINECASSPCLNKGTCVDGVASFTCLCELPYSG
PTCADVLTPCSPNPCANHAICTHTPDYLGYQCNCQSGWQGQLCNIDVNECISNPCKNSGT
CTNTLGGFVCSCRAGFTGLTCETDVNDCSPNPCLSGGSCTDGVNSFHCNCLAGFTGPRCA
LEINECQSSPCKNGATCTDYVNSYTCTCRPGFTGIHCETNIPDCTESSCFNGGTCTDKIN
GYSCTCRSGFTGSHCQYEVNECDSQPCLNGGICQDALESFRCSCPRGYTGTRCQTPVDWC
RRSSPCQNGGRCRQKDASFICDCTNGWSGRYCDISRVSCETAARHRGLQTDELCHHGGHC
VNTGNAHYCKCPVDYTGSYCESQVDHCEDKPCRNGATCRGYVGGYQCDCMPGFTGQNCEI
EINECQSHPCQNGGTCIDLVGHYICSCPPGTLGVLCEINEDDCALPLRLRSAPPKCLNNG
TCVDRVGGYRCNCPPGFRGERCEGDINECLSNPCSPSNSLDCIQLPNDYQCVCKPGFTGR
RCQSRFSVCESQPCQSGGVCSVFSGSALGYTCTCQLGYAGPNCERSMSCRELSCYNEGSC
TLTSRGARCTCQPGYGGLQCQHRSNEGCSSLPCRNGGLCTEETSFPFFYCQCPSGWTGKR
CEQSSRSLEAPTPSCPLADCHDKANDGVCNKECNTFLCRWDGGDCSLAVNPWARCADCWR
VFNNSQCDESCNKVECLYDNFDCKSKEKVCNPIYEAYCIDHYADGKCDQGCNTEECGWDG
LDCADKVPEALADGVLVLVVLLPPEELLRTSTAFLQKLSAILHTALRFRLDPNGKAMIRP
YTRREARLKRELQPQQEVIGSIVYLEIDNRLCSQGSEDCFPTADSAADYLGALSAVEMLR
FPYPLKEVRGERLPPIIDPIPQWGKLMLVGIASLFLLVILVIGMLIARRKREHSTLWFPE
GFFLKKEPSSNKNRREPVGQDALGMKHMPKTVEESLLGDHSDQWMDADCPEAKRLKVEEP
SMLSDCEDAVDSRQWTQHHLAAADIRVPPTMALTPPQGEFESDCMDVNVRGPDGFTPLML
ASFCGGGLEPEVAEEEENEECSANIISDLIYQGASLAAQTDRTGETALHLAARYARADAA
KRLLDAGADANAQDNTERTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATDLDSRMYDGSTALILAAR
LAVEGMVEELITCHADVNAVDEMGKSSLHWAAAVNNVDATIALLKNGANKDMQDLKEETP
LFLAAREGSCEAVKVLLAHFANREITDHMDRLPRDIAQERMHHDIVQLLDEYNTVRSPQG
HGGPGHHLTGGHTLSPLMCPPSAFLPSLKNTPQGKKNRRPGAKGSSLGSQHANSLKESVK
ARNKKLTLDMQSALLESSVTLSPVDSLDSPHGGASNAGYITNPTSPVAMQSPGLFHSSMS
VPNTPMVHSSMLEGGGPFAVSLAQLNDMGAGGMSLQGRVSMASDVNHGYVLSSGQMGLNM
GLVSPVSVPFDWHSRMASSHCGQQVVNLLQSSQAGMHPQSPAMQQQNMLMHQQQLYRNAM
LQPTPVTSTPSISPVKLPSIAEQQQQQQQQQQLINHTITNQQSMARMGTSTPPTPQTSQP
PPSFFQQQQMPQQPSQPQPPAHPPQAVTPAAQPTQALPSQPSGSTAGTEDYPTPPSQHSY
SSALDATPKHYLHLPSEHPYLTPSPESPEPWSSPSPHCVSDWSDSTPSPAVAGPAQTQIT
QIPEVNGKMQVFA
NT seq
7422 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaggggatattccatggattattttgtcatttttattgtttatgcatatttgcgaa
gggttccgttgcgtggataaatacagaccttgtgaaaatggagggacatgcttagattca
tcctctcgatgcatatgtcgtccgggattcattggtcctctctgtcagcacctggatccc
tgtcatcgatcgccatgtctgaacggagcagcttgcaagagccaagtggtcaatggtatc
ccacaatacacctgcgtgtgccagagagggttcagaggccaagactgctctctcattgat
gcctgtgccacaagtccctgtgccaatggagcccgttgtgccaattggaataaccactac
aactgttcctgcccacctggctttcagggaaagaactgccgcaatgacattgacgagtgc
cgcaagcctggcacgtgcctcaatggtggcctctgcattaacacccatgggtccttccac
tgcaagtgccaacctggatacagtgggcggacatgtgaggtgtccacccttccctgtgcc
ccatctcagtgtcttaatgggggcacctgtcgacagaccagcgaccattcctatgagtgt
gcttgtctaccagggtttgagggacacaactgtgagaataatgtggatgactgtccaggt
cacaagtgtatgaatggaggaatatgtgtggacggagtcaacacctacaattgccagtgc
ccaccagaatggacagggcaatactgtgctgaggatgtcaacgagtgtctcatgcaacca
aacgcctgccacaatgggggtacttgcttcaacactatcggtggtcacacctgtgtctgc
gttaatggttggactggagatgactgcagtgagaacatcgatgactgtgtcatagctgtt
tgcttcaatggtgccacctgccatgaccgtgtagcatctttcttttgcgagtgcccagtt
ggaaagacaggtttgctgtgccaccttgatgatgcatgtgtgagtaacccctgcaatgag
ggggcagtgtgcgacactaacccccttaacggccgtgccatttgcacctgtcctgctggc
tttgtaggaggtgcctgcaaccaggatatggatgagtgttcaattggtgccaacccatgt
gagcattttggaaaatgtgtgaacacagagggctcttttcagtgtcagtgtggccgtgga
tatgccggaccaagatgtgaaattgacataaacgaatgcctgtccatgccctgccagaat
gatgccacttgcctggaccgcattggagagttcacctgcatctgcatgccaggctacatg
gggacttactgtgaggttgacgtagatgactgtgagagcaacccatgtgtgaatgacggc
atctgtcgggacatggtcaatggctttacatgcacctgccaaccagggtttactggcacc
atgtgtcagatcgacatagatgagtgcgccagcacgccctgccaaaatggagcgaaatgc
tacgaccggccaaatgggttcgagtgccgctgtgctgaaggttatgaagggacactctgc
gagagtaatatcaacaactgtcagcccgacccatgccaccatggtacttgcgtagatggc
attgccagttacacctgtaactgtgatgctggctacacaggctatcgctgtgagaatcag
ctcaatgagtgtcacagcaacccttgtcagaatgggggcaagtgtgtggacctggtcaac
aagtacatctgccagtgccaacatggaacctcaggcacaaactgtgaaataaactttgat
gattgtgccagtaacccatgtgactatggcatctgcaaagatggcattaaccgctatgac
tgtgtttgcaaacctggcttcactggttccaagtgtaatgtggagatagacgagtgtgca
tctagcccctgtagaaatggggggacatgtgtggatgaagagaatggatttcactgccag
tgtcctgagggctttaaacccccttactgttactcccaggtggatgagtgtggcagcagc
ccatgtgtccatggctcatgccgggatgacatcaacggttaccgttgtgactgtgagcct
ggatgggtggggaagaactgtgaccttgacagaaacgactgtttgccgagtccctgccag
aatgctggcacgtgcattgaccagctcaatggcttcacctgcaagtgtcgccaaggcttc
agaggtaacctctgccaggtgaacatcaacgaatgtgcatccagtccctgtctgaacaag
ggcacctgtgtggacggtgtggcaagtttcacctgtctttgtgagcttccttacagtgga
cccacttgtgctgatgtcctcaccccttgttcccctaacccctgtgcaaatcatgccatc
tgcacacacaccccagactacttgggttatcaatgtaactgccagtcagggtggcaaggt
caattgtgtaacatagatgtgaatgaatgcatctcaaacccctgcaagaacagtgggacc
tgcaccaacacacttggaggctttgtgtgctcctgtagagctggatttactgggctgacg
tgtgaaacagacgtgaatgactgttctcctaatccatgcctaagtggaggttcctgcaca
gatggtgtgaactccttccactgtaactgcctggcaggctttactgggccccgctgtgct
ttagagatcaatgaatgccaaagttctccctgtaaaaatggagccacatgcacagactat
gttaactcctacacctgcacctgtaggcctggttttactggcatccactgcgaaaccaac
atccctgattgcactgaaagctcttgctttaatggaggaacgtgtacagataaaatcaac
ggctattcctgtacctgccgctcaggcttcactggctcccactgtcaatacgaggtcaat
gagtgtgattcccagccgtgccttaatggaggcatctgtcaagatgccctcgagtccttc
cgttgctcctgccccaggggctacactggcacccgctgccagacacctgttgactggtgc
agacgctcatctccctgccaaaatggaggacgctgtcgccaaaaggatgcttcctttatc
tgtgactgtactaatggctggtctggacgttactgtgacatctccagggtttcttgtgag
acagctgctcgccatagagggctccagacagatgagctatgccatcacggtggtcactgt
gtcaacactgggaatgcccactattgtaaatgccctgttgactacactggaagctattgc
gaaagccaagtggaccactgtgaagacaaaccctgccgcaatggcgccacctgcagggga
tatgtgggagggtaccagtgtgattgtatgccaggctttactggacagaactgcgagata
gagatcaatgagtgccagtctcatccttgccagaatggaggcacttgcattgatctggtg
ggacattacatttgctcctgtccccctggcacactgggtgttctctgtgagatcaatgaa
gatgactgtgctctacccctgaggctgcgcagtgctcctcctaagtgcctgaacaatggc
acctgtgtggacagagtgggtggataccgctgcaattgtccccctggattcagaggagag
agatgtgagggagacataaatgagtgtctctctaacccctgcagtccatccaacagtctt
gactgcatccagttgcccaatgactaccaatgtgtctgtaagcctggctttactggccgg
aggtgtcagagcaggttcagtgtgtgcgaatctcagccttgtcagagtggaggagtctgt
tctgtattcagcgggtctgcactgggatacacctgcacgtgtcagcttggttatgctggg
cccaattgtgaaagaagcatgtcctgtcgggaactgtcctgctacaatgaaggtagctgt
acacttacatcgaggggggcgcgttgcacctgccagccaggttatggcgggctccagtgt
cagcatcgcagtaacgaaggctgctcctccctgccctgccggaatggaggattgtgcacc
gaagagaccagcttcccgttcttctactgccagtgtcccagtggctggacaggcaaacgg
tgcgagcagagcagcagatccctagaagccccaacaccctcatgccctctagcagactgt
catgacaaagccaatgatggtgtttgcaacaaggaatgtaacacattcctatgtcgctgg
gacggtggcgactgttctctagcagtgaacccctgggctcgatgtgcagactgctggcgt
gtcttcaacaacagccagtgtgatgagtcctgcaataaagttgaatgtctctatgacaac
tttgactgcaaaagcaaggagaaagtttgcaatccaatatatgaagcctactgtatagac
cactatgctgatggaaagtgtgaccagggatgcaacacagaggagtgcggctgggatggc
ttggactgtgcagacaaggttccagaagcccttgctgatggtgtcttggttttggtagtc
ctgctgcctcctgaggagcttctccgcactagcacagcttttcttcagaaactaagtgct
atcttgcacactgccctgcgcttccggctggaccccaatggaaaagccatgatccgcccc
tacacccgccgagaggcacgcctcaagcgggagctgcagcctcaacaggaggtcatcggc
tccatagtgtacctggaaatagacaaccgtctgtgctctcagggctctgaggactgtttc
cctacagctgacagtgctgcagactacctgggagccctgtcagctgtagaaatgctccgc
tttccatacccgctcaaggaagtccgtggtgaaaggttgcctcctattattgaccccata
cctcaatggggcaagctgatgctcgtggggatagcttctcttttccttttggtcatcctt
gttataggaatgttgattgctcgtagaaagagagagcacagtaccctttggttccctgag
ggcttcttccttaagaaggaacccagcagcaacaagaaccgcagggaacccgtgggccag
gatgctctgggaatgaaacacatgccaaaaactgtggaggaatctctccttggagatcac
agtgaccagtggatggacgcggactgcccagaggccaaaaggctcaaggttgaggagccg
agtatgctctcagactgtgaagatgcagtggacagcaggcagtggacacaacatcacctt
gcagccgcagacattcgcgtgcctcccactatggccctcacaccacctcaaggagagttt
gaaagtgactgcatggatgttaatgtccgaggcccagatggttttacacctttgatgctg
gcatccttctgtggaggtggcttagagcctgaggtagcagaggaggaggagaatgaggag
tgttcggccaacattatctctgacctaatctaccagggagcatcccttgctgcccaaaca
gaccgcactggtgagacagcactccacctggctgctcgctacgcccgtgctgatgcggct
aagaggctgctggatgccggggcagatgccaacgctcaggataacacagaacgtacacca
ctacatgctgcagtggctgcagatgcacagggtgtcttccagattctgatccgaaatcgg
gctacagatcttgactcccgtatgtatgatggctccaccgcgctgatcctggcagcacgg
ctggcagtagagggcatggtagaggaacttatcacatgtcatgctgatgtcaatgcagtt
gatgaaatgggtaaatcttccttgcactgggctgctgctgttaataatgtggatgccact
attgccctgctgaagaatggtgcaaacaaagatatgcaagatctcaaggaggagacccct
ctgttccttgcagctcgtgagggcagctgtgaggctgtgaaagtgctgctggctcatttt
gcaaaccgagagatcacagaccatatggacaggttgccaagggacattgctcaggagcga
atgcaccacgacattgtgcaacttcttgatgagtacaacacagtaaggagtccccagggt
catggagggcctggacaccacctgactggggggcacactctgtctcctctcatgtgcccg
cccagtgccttcctgcctagtctgaagaacaccccacagggcaagaagaaccgtcggcct
ggggccaagggttctagcctgggaagccaacatgccaacagtctgaaggagtcagtcaag
gcccgtaataagaagctgaccttggacatgcagagtgccttactggagagctcagttacc
ctgtccccagtcgactcactggactcaccccatgggggagctagcaatgctggctacatc
accaaccccacttcccctgtggccatgcagtcaccagggctctttcactcctccatgtct
gtcccaaacaccccaatggtacatagtagcatgttggagggaggtggcccgtttgctgtg
tctcttgcccaactaaatgacatgggagctggaggaatgtccttgcagggacgtgtttcc
atggcgtcagatgttaaccatggatatgtgctgagttcaggccagatggggctcaacatg
ggcttggtcagtcctgtcagcgtgccctttgactggcacagccggatggcctcctcccat
tgtggccagcaggtggtgaatcttttgcagagtagccaggcaggcatgcacccccagagc
ccagccatgcaacagcaaaacatgctgatgcaccagcagcagctctaccgtaatgccatg
ctgcagccaacacctgttacctccacaccctctatcagcccagtcaagctgccctccatt
gctgagcagcagcaacaacagcagcagcagcagcagctcatcaaccacaccatcaccaac
cagcagagcatggcccgcatgggtacctccaccccaccgacaccccagacctcccagccc
ccaccatccttcttccagcagcagcagatgcctcagcaaccttctcagccccagcctcct
gctcatcccccacaggcagttacgccagcagcccagcccactcaggcactgccctcccag
cctagtggcagcactgcaggaacagaggattacccaactcctccctctcagcacagctac
tcatccgcactagatgctacgcccaagcattacctccatttgcccagtgagcacccctac
ctgaccccctccccagagtctccggagccctggtccagcccctctcctcattgtgtctct
gattggtcagattccacacccagcccagcagttgctggccctgcccagacccaaattact
caaatcccagaagtcaatggcaagatgcaggtgtttgcgtga
DBGET
integrated database retrieval system
