Empedobacter stercoris: HNV03_03085
Help
Entry
HNV03_03085 CDS
T06804
Name
(GenBank) PspC domain-containing protein
Organism
este
Empedobacter stercoris
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Toast-rack_PspC-Cterm
PspC
LiaI-LiaF-TM_PspC
Tetraspanin
L6_membrane
Ycf70
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNT13731
LinkDB
All DBs
Position
633334..635124
Genome browser
AA seq
596 aa
AA seq
DB search
MDKTVSISIGGFSFVLDEIAYNKLKTYLQDVKTLLRGTEGIEDIIEDVEIRIAELFRERL
KFREVVNEDDINFVIATMGHPDQYKVEDEEGETTSSTNSSYTSSSNNQSYGGQQTGAKRL
YRDPDDTIVTGLSAGLAHYMGVDPWFVRAIWLVLGILGIFTAGVSFLLVLFCYFILLIFV
PKAKTTSEKLQMYGQPANIDTLKKNVEQASETVVSGGKELSNKLGGVFGVFGRLLLWFIG
FIILSSGIGLIVAGFFFFFTTWTEMPTELFGYIVEEEWMSMAAKIFGGILMVIPGVLLTI
LGVKCFWNRVTVSKAVIFGSIALWFVALFAIIGISISTASKFRNSVEMTEDKVLNIPSDT
LQIEFTNREEGNYRYSGFNDLEQLIDEEGNLVIPIYKTFDIEESSDNNVHLEIRYSSKGG
SKEEAKRNLESIKYNYQLEGNKLNLDKFVKIPKNGKFREQTVDIKIYVPKNKVLFVRKSN
SVNIRSGQYDTDYFNDVNNNYFAFNGKKIVCLNCQKDTDSEDDNFEGDVNIHVNDGNDSA
KVRIDKNGIRVESNEGSVGLNLPRTENKKEKSNQEINYKDDTDSININYRNHSNNR
NT seq
1791 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataagacagtatcaataagtataggaggattttctttcgtgttagacgaaatcgcc
tataataaattaaaaacctatttacaggatgtaaaaactttgttgagaggaacagaaggt
attgaagatattattgaagatgtagaaatccgtattgctgaattgtttcgcgaacgatta
aaatttagagaagtcgtgaacgaggatgatattaattttgtgattgcaacgatggggcat
ccagatcaatataaagtagaggatgaagagggtgaaacgacgtcatcaacaaattcttct
tatacttcatcatcaaataaccaatcgtatggaggacaacaaacaggagcaaaacgtttg
taccgtgacccagatgacacaattgtaacaggattatctgctggtttggcacattatatg
ggcgtagatccttggtttgtgcgagctatttggttagtacttggtattttagggattttt
acagcaggcgtatcgttcttattagtattgttttgttattttatcttattaatttttgtg
ccgaaagcaaaaacgacatcagaaaagttgcagatgtacggtcaaccagcaaacatcgat
accttaaaaaaaaacgtagaacaagccagtgaaacggttgttagcggaggtaaagaatta
agtaataaattaggtggagtctttggtgtttttggtcgactattactttggtttattgga
tttattatactgagctcgggaattggacttattgttgctggattcttcttctttttcacg
acgtggacagaaatgcctacagaattatttggctacatagttgaggaagaatggatgagc
atggctgcaaagatttttggtggaatcttaatggtaattccaggtgttttattgacaatt
ttaggcgtaaaatgtttttggaatcgtgtaacagtgagcaaagccgttatttttggatca
atcgctctttggttcgttgccttatttgctatcatcggaatttcgataagtaccgcaagt
aaattcagaaattctgttgaaatgactgaagataaagtactaaatattccttcagacaca
cttcaaatagaatttacgaatagagaagaagggaattatagatacagtggtttcaatgat
ttagagcaattaattgatgaagaaggtaatttagttattccaatttacaaaacttttgac
atcgaagagagcagtgacaataatgtacatttagaaattcgctattcatcgaaaggagga
agtaaagaggaagcaaaacgtaatttagaatcaattaaatacaattatcaattagaagga
aacaaattgaatttagataaatttgttaaaattccaaaaaacggtaaattcagagaacaa
acagttgatattaaaatttatgtaccgaaaaataaagtattatttgtcagaaaatcaaat
tcggtaaatatcagatctggacaatacgataccgattattttaacgatgtaaataataat
tattttgcatttaatggaaaaaaaatcgtatgtttgaattgtcaaaaggatacagattct
gaagatgataacttcgaaggagatgtaaacatacatgtaaatgacggaaacgattcggca
aaagttagaatcgataaaaatggtattcgtgttgaaagtaatgaaggatctgtaggatta
aatttaccaagaaccgaaaacaaaaaagaaaaatcaaaccaagaaataaactacaaagat
gatacagattctattaacattaactacagaaatcattcaaataatcgttga
DBGET
integrated database retrieval system