Empedobacter stercoris: HNV03_04020
Help
Entry
HNV03_04020 CDS
T06804
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
este
Empedobacter stercoris
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
este00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
este02000
]
HNV03_04020
Transporters [BR:
este02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
HNV03_04020
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
PEGA
SpaA
EMC7_beta-sandw
SdrD_B
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNT13886
LinkDB
All DBs
Position
complement(826334..828718)
Genome browser
AA seq
794 aa
AA seq
DB search
MSINIQCSIVATFLCGSVFAQNIFEGQIIDKNQQPIPFATLYINNDEYHANAEGKFKIEN
LNQGQYQVQIDEQGYEPFSQNITFDKNQKFVFTLTFHKAYNLDEVTVLGHHHDFSTANIQ
RVDQSYIQENYAGSLAKSLENMAGINASGIGSSASKPIIRGLGFNRLIVAENGVKQEGQQ
WGADHGLEIDALNIEDIEVIKGPAALEYGNEAIAGVIKINNNNLPAKHSLSGETKALYQS
INDNIGIGFNLKSRGNHFFYKIKGSYSDYADYKTTTDRIYYLNRYLPIYNKRVKNTAGQD
FNSEIQTGYIGEKFRSILTVSNVNQKIGFFPGSHGIPSIDRLKDDGNNRNIEFPYQKVNH
FKVISENEFRLNSKDILKFLGSYQNNRRQEVSAFHTHYANQPAPLLNPNLELDFNLSTYD
SQLKFEHNHSKNFKTIIGAQAQIQVNNISGYNYLLPKYDRNIFSGFLIEEFKKGNTWKVT
AGLRYDYSTFKSEGYFDEFLYNYLIEKGNSTGIADYYANRSKSIDRNFSNLNGMIGATFQ
PNQQWDFNLNIGTNFRLPTAIELGSNGIHHGSFRHERGDDNLDVEKGIAFDFKSVFHKND
WDISVSPYLYYFSNYIFLKPSGQFSILPHGGQIYQYTQSKALLTGFEFEVRKKINENFDA
NVVYEYLYNRQITENNKLGNYLPFTPANNVFGQVNYKVNQNIGFLDELSFFVNGKYTFEQ
DKIAQNEDLTPSYFLVGIGGKTKLKFNNFHANLSVQVSNLFNKNYYNHTSFYRALQLPEQ
ARNIQVILGIPFGK
NT seq
2385 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaatcaacatacaatgtagtattgtagctacatttttgtgcggatctgtgtttgcg
caaaatattttcgaaggtcaaattattgataaaaaccaacaaccaattcctttcgcaacc
ttatatattaacaacgatgaatatcatgcaaatgctgaaggaaaattcaaaatagaaaat
ttaaatcaagggcaataccaagtgcaaattgatgaacaaggttacgaacctttttcgcaa
aacatcacatttgataaaaatcaaaaatttgtctttacccttacatttcacaaagcatac
aatttagatgaagtaactgttttgggacatcatcacgatttttcgactgcaaatattcaa
cgtgtcgatcaatcctatattcaagaaaactatgcaggatctttagccaaatcattagaa
aatatggctggaattaacgcttctggaattgggtcttcagcgtcaaaaccaatcatacga
ggacttggtttcaaccgattaattgttgctgaaaatggagttaaacaagaaggtcaacaa
tggggagccgatcatggtttagagattgatgcgctaaatattgaagatattgaagtcata
aaaggacctgctgcattggagtacggaaatgaagctattgcaggagttatcaaaataaat
aacaataatttacccgcaaaacattcgctttctggagaaacaaaagcattgtatcaatcg
attaatgataatattggaattggatttaatttaaaatctcgtggaaatcattttttctac
aaaataaaaggttcttattcagattatgccgattacaaaacaacaacagatcgcatttat
tacctcaatcggtatttaccaatttacaacaaacgagtaaaaaatacggctggacaagat
tttaattcagaaatacaaactggttatattggcgaaaaatttcgctcgattttaactgtt
tctaatgttaaccaaaagattgggtttttccctggttcgcacggaattccatctattgat
cgcttaaaagatgatggaaataaccgaaatatcgaatttccttatcaaaaagtaaatcat
ttcaaagtaatttctgaaaatgaattccgcttaaactcgaaagatattctgaaatttctg
ggtagctaccaaaataatcgtcgacaagaagtaagtgcttttcatacacattacgcaaat
caaccagctcctttattaaatccgaatttagaattagattttaatctttctacttacgat
tctcaattaaaatttgaacataatcacagtaaaaatttcaagacgataattggtgctcaa
gcgcaaattcaggtaaataatattagtggatacaattatttattaccaaaatatgatcga
aacatttttagtggatttctgattgaagaattcaaaaaaggaaatacatggaaagtaact
gctggtttacgttatgattattctacttttaaatctgaaggctattttgatgaattttta
tacaattatttaatcgaaaaaggaaactcaacaggcatagcagattattatgccaatcgt
agtaagtccatcgatcgtaattttagcaatttgaatggaatgattggtgcaacttttcaa
cctaatcaacaatgggatttcaatttaaatattggaacaaatttccgtttaccaacggct
atcgaattaggttctaatggaattcatcacggaagttttagacacgagcgcggtgacgac
aatttagatgttgaaaaaggaattgcattcgactttaaatccgtttttcataaaaatgac
tgggatatatcggtaagtccttatttatattatttcagtaattacattttcttgaaacct
tcgggacaattttctatacttcctcatggcggacaaatttatcaatatacgcaaagcaaa
gcgttattaactggttttgaatttgaagttcgtaaaaaaatcaatgaaaactttgatgca
aatgttgtctacgaatatttgtataaccgacaaattactgaaaataacaagttaggaaat
tatcttccttttacgcctgcgaataatgtgtttggacaagttaattataaagtcaatcaa
aatatcggatttttagatgagttgagcttttttgtaaatggaaaatatacctttgagcaa
gataaaattgcacaaaacgaagatcttactccaagttattttttagttggtattggagga
aaaacgaaacttaaattcaataattttcatgcaaatttaagtgttcaagtttctaattta
ttcaataaaaattattacaatcacactagtttttatcgtgcattacaattaccagaacaa
gctcgaaacatacaagttatcttaggaattccgttcggaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
