Williamsoniiplasma somnilux: ESOMN_v1c00350
Help
Entry
ESOMN_v1c00350 CDS
T05210
Symbol
trmE
Name
(GenBank) tRNA modification GTPase TrmE
KO
K03650
tRNA modification GTPase [EC:3.6.-.-]
Organism
esx
Williamsoniiplasma somnilux
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
esx00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
esx03016
]
ESOMN_v1c00350 (trmE)
Transfer RNA biogenesis [BR:
esx03016
]
Eukaryotic type
tRNA modification factors
Other tRNA modification factors
ESOMN_v1c00350 (trmE)
Prokaryotic type
Methyltransferases
ESOMN_v1c00350 (trmE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MnmE_helical
TrmE_N
MMR_HSR1
FeoB_N
Dynamin_N
Roc
Ras
HMD
Nuc_deoxyri_tr2
GTP_EFTU
RsgA_GTPase
Guanylate_kin
AAA_29
Pdc1_Ge1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATZ18421
UniProt:
A0A2K8P094
LinkDB
All DBs
Position
42286..43641
Genome browser
AA seq
451 aa
AA seq
DB search
MKNINDTIVAPVTNISTQAIAVIRISGDDAFNIINKIVDKEIPLHRNIFLRKLFQNKQVV
DEVVITSFVNPSSFTGENVIEIACHGGILNTNKIINLILNSGARMAQKGEFSQRAFLNGK
IDLIQAEGINDLIHATNELALKIGVDNMSGSHNKTILDLKSDLMDVISRIQVSIDYPDYD
DVEGSSPKDLQNLLKKIDEKLNQILLRSKLASKSASGIKTAIIGEPNVGKSSILNALLSE
DKAIVTNVPGTTRDIVEGQISFQNFTLNLIDTAGIRETEDIVEALGIKKSLEYIKKADLV
LFVITPEEISTKSLEIINLAKDKTKIIVVNKSENLNDSEKQRLISQFNDVVFTNALNNDI
NELISKIDQKYNNEEILKDENLILININQISLIEQVKNKINTAYINLQNHFPIDVVNVDL
YEGWGLLNELIGEQYDEEIIDNIFRKYCLGK
NT seq
1356 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaatattaacgacacgattgtagctccagttactaatatttcaacacaagcaatt
gcggtaattagaattagtggtgatgatgcatttaatattattaataaaatagtagataaa
gaaattcccttgcacagaaacatctttcttagaaaattgtttcaaaataagcaagtggtt
gatgaagttgttataacttcttttgttaatccaagttcttttactggtgaaaatgttatt
gaaattgcttgtcatggaggaattttgaatactaataaaattattaatttaattttaaat
tctggagccagaatggcacaaaaaggcgaattttcacaaagagcttttctaaatggaaaa
atagatttaatccaagcggaaggaattaatgatttaattcacgctactaacgaattagct
ttaaaaattggtgttgacaacatgagtggctcgcacaataaaacgattttagatttaaaa
agcgatttaatggatgttatatctagaattcaagtttcaattgattatcctgattatgat
gatgttgaaggttcttctccaaaagatcttcaaaacttacttaaaaaaattgatgaaaaa
ttaaaccaaattttattaagatctaaattagcttctaaatcagcatctggaataaaaaca
gcaattatcggagaacctaatgtaggtaaatcttcgattttaaatgccctacttagcgaa
gataaagcaattgttaccaatgttccaggaacaacaagagatattgtggaagggcaaata
tctttccaaaattttactttgaatttaattgatactgcaggaattcgcgaaactgaagat
attgtggaagctttaggtattaaaaaatcgcttgaatatataaaaaaagcagatttggtt
ttgtttgtcataactccagaagaaattagtaccaaaagtcttgaaataattaatttggca
aaggacaaaactaaaataattgttgtcaataaaagcgaaaatttaaacgatagtgaaaaa
caaagacttatatcacaatttaatgatgtagtttttactaatgctttaaataacgatatt
aatgaattgatatctaaaattgatcaaaaatataataacgaagagatattaaaagatgaa
aatttaattttaattaacatcaatcaaatttctttaattgaacaagttaaaaataaaatt
aataccgcttacataaatttgcaaaatcattttcccatcgatgttgttaatgttgatctt
tatgaaggatgaggtttattgaatgaacttattggtgaacaatatgatgaagagataatt
gataatattttcagaaaatattgtttaggtaaatag
DBGET
integrated database retrieval system