Williamsoniiplasma somnilux: ESOMN_v1c01920
Help
Entry
ESOMN_v1c01920 CDS
T05210
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
esx
Williamsoniiplasma somnilux
Pathway
esx03030
DNA replication
esx03430
Mismatch repair
esx03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
esx00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
ESOMN_v1c01920 (dnaE)
03430 Mismatch repair
ESOMN_v1c01920 (dnaE)
03440 Homologous recombination
ESOMN_v1c01920 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
esx03032
]
ESOMN_v1c01920 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
esx03400
]
ESOMN_v1c01920 (dnaE)
Enzymes [BR:
esx01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
ESOMN_v1c01920 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
esx03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
ESOMN_v1c01920 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
esx03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
ESOMN_v1c01920 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
DASH_Ask1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATZ18577
UniProt:
A0A2K8NXR2
LinkDB
All DBs
Position
212578..215538
Genome browser
AA seq
986 aa
AA seq
DB search
MKFSPQINLRSCYNFQESLIKVPDYIDFAVRNNFKFAFYSELNSMYGVAEFVNLAKKNNI
KPIIGLTLEFEHQIAILIAKNEQGYQNLTILSSWLMNENNHFNFDFQWTKFISDNLIMVT
NSLTFKNSVKELIKTNDIYFNVVDLRKISYLEDKNYETFVILNAIKNNLTIAEVQNIGHE
HYLSDEELLKLNVNLDINNKSLLEIANKCSFELFSNRQWNFAKFKTPQNMPSGNFLRKLC
EESLNSYLLFAKNKKNPNVDYFERLNYELDVIYKTGFIDYFLVVWDYVKYARENQIMVGP
GRGSAAGSLVSFLLKITTIDPLQYDLLFERFLNPKRVSLPDIDLDFQDDKRDLIIEYLFE
KYGADKVATIVTFQSIGLKSAIRDVARVYEIDLKIVNEIAKLFPSFVVNQSFAEIINKSS
KLRKYQEEYPEIFDHASALIGLPRQTGTHAAGVILSDVDIKNIVPIRIGYNGINQTQFDM
KYLEPLGLIKMDVLGLRNLTTLQEILSSVYKSEKKLINLDEINLQDNETFVNLQAGKTSG
IFQLESPGMTNVIMKIKTNSIEDISIASALFRPGPQEMIPEYVKRKFSNVPVEKYLIDKD
LKSILEPTYGIIVYQEQVIQILRKVANFSLAQADLVRRAIGKKDFQKLHAAKNEFIEKAT
ENNYQIQKAKMIWEWIEKFAAYGFNKSHSIAYSYISYWLAYLKTHYPAEFYCSLLNGVTG
NVEKTSQYLKEINNYGIKIIKPSIKNINFNYIGFKTALIMPLTLIKGVGIEFIRKLREQY
KSNPQIMDSVFSLVTLMFNHGLNKNVFEALVWSGALDCFGYSRSTLVENYEEILKFANFN
KDIEIINNNLIPELTNYEDKEEILLNKEKEFIGFFISSHPIEKIRTEYSFLKAHKIINLL
NKKGNFIIIGYVSAIKEKNDKHGDPMAFIEMSDETENIEITVFSRTFKNFKNDILLGSVL
CVEINIDSFNDKPSFVLNKIIKIIKN
NT seq
2961 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattttctccacaaataaatttacgtagttgttacaattttcaagagtcattaatt
aaagttcctgactatattgattttgctgttagaaataattttaaatttgctttttattct
gaattgaactctatgtatggagtagctgaatttgtgaatttggctaaaaaaaataatatt
aaaccaattataggattaaccttggaatttgagcatcaaatcgctattttaatcgctaaa
aatgaacaaggttatcaaaatttaacaattttgtcttcttgattaatgaatgaaaataat
cactttaattttgattttcaatgaactaaatttattagtgataatttaattatggttact
aatagtttaacttttaaaaactcagttaaagaattaatcaaaactaatgatatttatttt
aacgttgttgatttacgaaaaatttcatatttggaagataaaaattacgagacttttgta
attttaaacgcaattaaaaataatttaactattgctgaagttcaaaacattggccatgaa
cattatttatctgatgaagaattattaaaattaaatgttaatttagatattaataacaaa
agtcttttagaaatagctaataaatgctcatttgaattattttctaataggcaatgaaat
tttgctaaatttaaaactccacaaaacatgccttcaggtaattttttaagaaaattatgc
gaagaatctttaaattcatatttactttttgcaaaaaacaaaaaaaatccaaatgttgat
tattttgaaagattaaactatgagttagatgttatttataaaacaggtttcattgattat
tttttagtagtttgagactatgttaaatatgctagagaaaatcaaattatggtcggccct
ggacgaggatcagcagctggttcattagtttcttttttgcttaaaataacaacaattgat
cctcttcaatatgatttgctattcgaaagatttttgaatccaaaaagagtatcactacct
gatattgatttagattttcaagatgataaaagagatttaatcatcgaatatttatttgaa
aagtatggtgctgataaagttgcaactattgtaacttttcaatcaattggtctgaagtca
gcaattagagatgttgctagagtttatgaaatagatttaaaaattgttaatgaaattgct
aaattatttcctagctttgttgtaaaccaatcatttgctgagattattaacaaatcaagt
aaattaagaaaatatcaagaagaatatcccgaaatttttgatcatgcttctgctttaatt
ggtttaccaaggcaaacaggaactcatgcagcgggagttattctttctgacgttgatatt
aaaaatattgtccctataagaattggctataacggaattaaccaaactcaatttgatatg
aagtatctagaaccattaggtttgattaaaatggatgttttaggtttaagaaatttaaca
actttacaagaaattttatcaagtgtttacaaatcggaaaaaaaattaattaatcttgac
gaaattaatttgcaagataatgaaacttttgtaaatttacaagcaggtaaaacttcagga
atttttcaattagaatcacctggtatgaccaatgtgataatgaaaattaaaactaattct
attgaagatatttccattgcttcagctttatttagaccaggtcctcaagaaatgattcct
gaatatgtaaagagaaaattttcgaatgttcctgttgaaaaatatttaatcgataaagat
ttaaaatctattttagagccaacatatgggattattgtttatcaagagcaagttatacaa
atattacgtaaagtagcaaatttttctctagctcaagcagatcttgttagaagagcaatt
ggtaaaaaggatttccaaaaattacatgcagctaaaaatgaatttattgaaaaagctact
gaaaataattatcaaattcaaaaagctaaaatgatctgagaatgaattgaaaaatttgca
gcatacggatttaataaatcacactcaattgcttattcatatatttcttattggttagct
tatttaaaaactcattatcctgcggaattttactgttcacttttaaatggagttactgga
aacgttgaaaaaacttcacaatatttaaaagaaataaataattacggaattaaaataatt
aaaccttcaataaaaaacattaattttaattatattggttttaaaactgctttaataatg
ccgttaactttgattaaaggcgtaggtattgaatttattagaaagttacgtgaacagtac
aaaagtaatccgcaaataatggattcggttttttctttggttactttaatgtttaatcat
ggtttaaacaaaaatgtttttgaagcactagtttgatcgggggcattagattgttttggt
tatagcagatcaacattagttgaaaattatgaagagattttgaaatttgcaaattttaat
aaagacattgaaataattaataacaatttaattcctgaattaactaactatgaagataaa
gaagaaattttgttaaacaaagaaaaagaatttattggtttttttatttcttctcatcct
attgaaaaaattagaacagaatactcatttttaaaagcacataaaattattaatctttta
aataaaaaaggaaattttattatcattggttatgtatctgctatcaaagaaaaaaacgat
aagcatggagaccccatggcttttattgaaatgtctgatgaaacagaaaatattgaaata
actgtgttttcaagaacatttaaaaattttaaaaatgacattcttttaggttcggtatta
tgtgtcgaaattaatatcgattcatttaatgacaagccttcatttgttttgaacaaaatt
atcaaaatcataaaaaactag
DBGET
integrated database retrieval system
