Williamsoniiplasma somnilux: ESOMN_v1c06790
Help
Entry
ESOMN_v1c06790 CDS
T05210
Symbol
rpoB
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta
KO
K03043
DNA-directed RNA polymerase subunit beta [EC:
2.7.7.6
]
Organism
esx
Williamsoniiplasma somnilux
Pathway
esx03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
esx00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
ESOMN_v1c06790 (rpoB)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
esx03021
]
ESOMN_v1c06790 (rpoB)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
esx03400
]
ESOMN_v1c06790 (rpoB)
Enzymes [BR:
esx01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
ESOMN_v1c06790 (rpoB)
Transcription machinery [BR:
esx03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
ESOMN_v1c06790 (rpoB)
DNA repair and recombination proteins [BR:
esx03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
ESOMN_v1c06790 (rpoB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_45
RNA_pol_Rpb2_2
RNA_pol_Rpb2_1
Peptidase_M23
RnfC_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATZ19061
UniProt:
A0A2K8P221
LinkDB
All DBs
Position
complement(797260..801081)
Genome browser
AA seq
1273 aa
AA seq
DB search
MSYKVKKINRGVERRDYTKVSGNLPLPNLVEMQTRTFDWFCQKGIQEVFDEVFPIVSNDG
TAVLTMENWGFKEPRIDVARAREESKIFEAPIYADLKLSVANREEISKELFNIVSKDEKK
LVTEWLKEKTENKAVTFKSSQDQSYFFEVKTKGSEIPDTIQVDIVEKTEDAVIVNAAIYK
QGQSFLGEFPVMTPSGTFIINGSQKVIVSQLVRSPGAYFKKDFNRKNGENIFSADIIPSR
GTWLEFETEAKKIVDTKLINALYVKIDKSRKTTATSLLTGLGLEKNSILDLFDNPKLLKN
TYEQDSLSGDLTTDWENAITDIYKKIRQGETATADGASKFIYGTLFDKRKYDLTKAGRFK
LQQKLSIKNRLIGRTLAEDIVNKKGVILVPANTLVTKTNINEIAEALSGNVMTVKLNFNE
QIEGSKEVQKLKVYKELNGKGEIITLIGISPNSKEEFVTVPDIVSTISYTISLIDNIGEV
DDIDHLGNRRVRTVGELLQNQFRIGMMRIEKNVKERLATSNLYKLKPSTIINNKPLTAII
GEFFNLSQLSQFMDQINPLSELTNKRRLTALGPGGLSRDRAGLEVRDVHPSHYGRICPIE
TPEGPNIGLINNLSTYAKINEYGFITTPYRKVVNGIIQNEEVHYLTADEEKNFMISQASV
NQDATGKITDKTVIARYRGDDIVTDILDIDYIDVSPKQIVSVATSAIPFLENDDANRALM
GANMQRQAVPLINPESPIVGTGIEFEAARDSGAAVVATESGIVKYVDSRLITIEAKSGIK
TYSLSTFERSNNGTALIHFPIVKAGDKVDKGQIIADGPSMEKGELAIGQNVVVAFTTYNG
YNFEDAVIMSERVVMEDRFTSVHIDEYVIERRSTKQGNEDVTRELPNVSEAAKKYLDSDG
IVAIGTEVKVGDILVGKVTPKGQAQLSPEDKLLHAIFGEKSRNVKDNSLRVPNGGDGIVQ
AIKRFSAADGFDLPADVLEIIKVYIVQKRKIQEGDKMSGRHGNKGVISRILPIEDMPHLE
DGTPVDIMLNPQGIPSRMNIGQILELHLGMAAKKLGIKVATPVFEGVNAKELDEIMKEAG
MTNFGKVKLIDGQTGEAMDKPIAVGVMYMLKLSHMVDDKLHARNVGPYSLITQQPLGGKA
QSGGQRFGEMEVWALEAYGAAHTLREILTIKSDDIKGRAKTYEAIVRSKAIPEPGIPESF
NVLTKEIMGLGFDMFMEDNRGRKFAINAYDDDQIDEEYANYDSMDSLAGGNELSTTGFSE
VSEREIAIDFNEE
NT seq
3822 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttataaagtaaaaaaaattaaccgcggtgttgaacgtcgagattacactaaagtt
tctggtaatttaccattacctaacttagtggaaatgcaaacaagaacatttgattgattt
tgtcaaaaagggattcaagaagtttttgatgaagttttcccaatcgtttctaatgatggc
acagctgttttaacaatggaaaattgagggtttaaagaaccaaggattgatgttgcaaga
gcaagagaagaatcaaaaatttttgaagcaccaatctatgctgatttaaaattatcggtt
gcaaacagagaagaaatttcaaaagaattatttaacattgtttcaaaagatgaaaaaaaa
ttagtaacagaatgattaaaagaaaaaaccgaaaataaagcagtaacttttaaatcatca
caagatcaatcatacttttttgaagtaaaaactaaaggttcagagattcctgacactatc
caagttgatattgttgaaaaaactgaagatgcagttattgttaatgccgcaatctataaa
caaggtcaatcatttttgggagaattcccagttatgacaccatctggaacttttataatt
aacggttcacaaaaagttattgtttcacaattggttcgttcacctggtgcttattttaaa
aaagattttaaccgtaaaaacggagaaaatattttttcagctgacataattccatctcgt
ggaacttgattagaatttgaaacagaagcaaaaaaaattgttgatacaaaattaatcaat
gctttatatgtaaaaattgataaatcaagaaaaacaacagcaacatctttgttaactggt
ttaggattggaaaaaaattcaattttagacttatttgataatcctaaattattaaaaaac
acatacgaacaagacagtttgtcgggtgatttaacaacagattgagaaaatgctattaca
gacatttacaaaaaaattcgtcaaggtgaaacagcaacagctgatggagcttcaaaattt
atttacggaacattatttgataaacgtaaatatgatttaactaaagctggtcgttttaaa
ttacaacaaaaactttcaattaaaaatcgtttaatcggaagaacattagcagaagatatt
gttaataaaaaaggagtaattttagttccggcaaatacattagtaacaaaaacaaatatt
aacgaaatagctgaagcattaagcggaaatgttatgactgtaaaattgaatttcaatgag
caaatcgaaggttcaaaagaagttcaaaaactaaaagtttacaaggaattaaacggtaaa
ggtgaaattattactttaattggtatttcgccaaattcaaaagaagaatttgtaacagta
cctgatattgtttcaacgatttcttacacaatttcattaattgataatattggtgaagtt
gatgatattgatcatttaggtaatcgtagagttcgtacagttggtgaattactacaaaat
caatttagaatcggaatgatgcgtattgaaaaaaatgttaaagaaagattggcaacttca
aacttgtacaaacttaaaccttcaacaatcatcaataacaaaccactaacagctattatt
ggtgaattctttaacttgtcacaattatcacaattcatggatcaaattaacccactttct
gaattaactaataaacgtcgtttaacagctcttggccctggtggtttatcacgtgataga
gccggattagaagttcgtgacgttcacccatcacattatggaagaatttgtccaattgaa
actcctgaaggtccaaatattgggttgattaacaacttatcaacttatgcaaaaattaat
gaatatggatttattacaactccatacagaaaagttgttaacggaattattcaaaacgaa
gaagttcattatttaacagccgatgaagagaaaaactttatgatttctcaagcatcagtt
aaccaagatgcaacaggtaaaattactgataaaactgttattgcacgttatcgtggagat
gacattgtaactgatattttagatatcgattacattgacgtttcgccaaaacaaattgtt
tcagttgcaacatctgcaattccattcttggaaaacgatgatgccaaccgtgctttgatg
ggggcaaacatgcaacgtcaagccgtgcctttaattaatcctgaatccccaattgttgga
acaggaattgaatttgaagccgcacgtgattcgggagctgcagttgttgcaaccgaatcg
ggaatcgttaaatatgtagattcaagacttattactattgaagcaaaatcaggaataaaa
acttactctttatcaacttttgaaagatcaaacaatggaactgctttaattcatttccca
attgttaaagctggagataaagttgataaaggacaaattattgctgatggtccatcaatg
gaaaaaggagaattagcaatcggtcaaaacgttgtggttgcctttacaacttataacgga
tacaactttgaagatgctgttattatgtcagaacgtgtagtaatggaagacagattcact
tctgttcacattgatgaatatgtaattgaacgtcgttcaactaaacaaggtaatgaagat
gtaactcgtgaattaccaaatgttagtgaagctgctaagaaatatttagatagtgacgga
attgttgctattggaactgaagttaaagttggcgacattttggttggaaaagtaacgcca
aaaggtcaagctcaattatcgccagaagataaattgttacacgcaatttttggtgaaaaa
tcaagaaatgttaaagacaactcattaagagtaccaaacggtggtgacggaattgttcaa
gcaattaaacgtttctcagctgctgatggttttgatttacctgctgatgttttagaaatt
attaaagtttatattgtccaaaaacgtaaaatccaagaaggggataaaatgtctggacgt
catggtaataaaggggttatttctcgtattttgccaattgaagacatgccacatttagaa
gatggaactcctgttgatattatgttgaatccacaagggattccttcacgtatgaacatt
ggtcaaattctagaattacatttaggaatggctgctaaaaaattaggaatcaaagttgcg
actccagtttttgaaggagttaatgctaaagaattagatgaaatcatgaaagaagcagga
atgactaacttcggtaaagttaaattaatcgatggtcaaactggtgaagctatggacaaa
ccaatcgctgttggggttatgtatatgctaaaactttctcacatggttgatgataaatta
catgctcgtaacgttggtccatactcattgattacacaacaaccacttggaggaaaagct
caaagtgggggtcaaagatttggagaaatggaagtttgagcacttgaagcttatggagct
gctcatacacttcgtgagatcttgactatcaagtcagatgatattaaaggtcgtgctaaa
acttatgaagcaattgttagatcaaaagcaattcctgaaccaggaattccagaatcattt
aacgttttaacaaaagaaattatgggtcttggttttgatatgttcatggaagataatcgt
ggtcgtaagtttgctattaatgcttatgatgatgatcaaattgatgaagaatatgcaaat
tatgattcaatggattctctagctggaggtaatgaattatcaacaacaggatttagtgaa
gtatcagaaagagaaatcgcaatcgatttcaacgaagaatag
DBGET
integrated database retrieval system
