Escherichia coli O157 H7 TW14359 (EHEC): ECSP_4764
Help
Entry
ECSP_4764 CDS
T00949
Symbol
espY4
Name
(GenBank) non-LEE-encoded type III secreted effector
Organism
etw
Escherichia coli O157:H7 TW14359 (EHEC)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Pentapeptide_4
Tricorn_C1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACT74482
LinkDB
All DBs
Position
complement(4745424..4747832)
Genome browser
AA seq
802 aa
AA seq
DB search
MVAKLKPDVFVNTNPFLEAMYKERLSHKGYSDKIALSINDKKYNVNSKDIENILDGKGDL
FKKRTLWEFVRDLFPGSHIKEVKGLIYEFVTKVDNKAEVFDKIKSLAKKEQQWRFSTKTD
FTTNENNEVIVSRSFNLYTGATSNDNEKKQVSSERLTLDNYLDDLHFDNSPLVRLTFDNY
SVKLATLIKNKIPIINTTINLSSLSKDVLNSLKYCSFKNVIFSGVINSPNLEGPVFENCY
FDDCKFNNIQLYETNDDTVESGNKKPIKGMFKGCFISKCKIENYRCETSKIYTVTQPDSI
QEKLGSYLFMQSFVQDCIIQGGCCPGSSILLSHFYNCNIIGLDAHGMDFLANSFNKSNYD
EIRGPDTGTVFYNCNLKHTKINDGLREDGSDRTMFNSKEYFSDYIERRSRNLKLDDNFSK
CVESIKKGTDSSFSKKNTENNNVFFKNSNLIGANLGYYYSGDRCKDCAIDPNTNYSKDGL
TAQKYMYMDLDGAISKEQIPDFLKKVSAINIDVINFYNSESKTKEKYKNAFLELESFLST
LYVENKSYEEKYHFDNSRVEFFIFKDMQENAQNIINNMIESDRIKFVESIINKMIPPPDG
TILTENPKEYVQKQIKESHKESATNVTFDYKELAPIFEGVEEKQIKALSNQLEHIKSFKT
DYDSRLNKYARDFYYFSSAFAINWEDLLKNYQEIRASIKDYDDLLREIKELIISRNKSLE
DKRTLFDNKRDNWNSIEVQDEVNALNAKIVDCDDKIRSKLTIVRNNRLENQYKDDKNISD
AMRNILDWFERYPDIVQNITQA
NT seq
2409 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtcgctaaattaaaaccagatgtttttgttaatactaatccttttttagaagcaatg
tataaggagaggcttagtcataaaggctattctgataaaattgctttaagtattaatgat
aagaaatataatgtaaactctaaggatattgaaaatattcttgatggcaaaggggattta
tttaaaaaacgtacactgtgggagtttgttcgcgatctttttcctggctctcatattaaa
gaagtcaaaggcttaatttacgaatttgtcacgaaagttgataataaagccgaggtgttc
gataagattaaatctctggcaaaaaaagaacaacaatggcgatttagtactaagacagac
tttaccacaaatgaaaataatgaagttattgtgagtagatcctttaatctctacacgggg
gctacttcgaatgataacgaaaaaaaacaggtttcttcagagagattaacgcttgataat
tatctcgatgatttacattttgataattctcccttggtgagattaacgtttgataattat
tctgtaaaacttgcgacgctgattaaaaataaaattcctattattaatacaacaatcaat
ttatcatcgttgtctaaggatgttttaaattcattaaaatattgtagttttaagaatgta
attttttcaggagtgataaacagccctaaccttgaaggtccggtttttgaaaattgctat
ttcgatgattgtaaattcaacaacatacagctttatgagactaatgatgatactgtggaa
tcaggaaataaaaaaccaataaaaggtatgtttaaaggttgttttatttctaaatgcaaa
attgaaaattatagatgtgagacgtctaaaatctacaccgttacacaacctgatagtatt
caagaaaaattaggttcttatctctttatgcagtctttcgttcaggattgtataatccag
ggaggatgttgtcctggctcgagtatacttctgagtcatttttataactgtaatataata
gggcttgatgctcatggaatggattttttggcaaattcgttcaacaagtctaattatgat
gaaatcagggggccggatacggggactgtgttttataattgtaatttgaagcatactaaa
ataaacgatggtcttcgtgaagatggttcagatagaactatgtttaactccaaagagtat
ttttctgattacattgaaagaagatcgagaaatcttaagttagatgataatttttcgaaa
tgcgtagagagtataaagaaagggaccgattcttcatttagcaagaaaaatacagagaac
aataatgtcttctttaaaaatagtaatttgattggggcaaatttaggctattattacagt
ggagataggtgcaaagactgtgctattgatccaaatacaaattattcaaaagatggtctt
acagcgcaaaaatacatgtatatggatctggacggagctataagtaaagaacaaatacct
gatttcttaaaaaaggtaagtgctatcaatatcgatgtaataaatttttataattccgag
tcaaagactaaggaaaaatataaaaacgcatttttagagttagagtcgtttttatcaaca
ctttatgttgaaaataaatcgtacgaggaaaaatatcattttgataatagtagggttgag
ttttttatttttaaagatatgcaggaaaatgcacaaaatatcattaacaatatgatagaa
agtgaccggattaagtttgttgaatctataataaataaaatgattccgccgccagatgga
acaatacttactgaaaatccaaaagaatatgtccaaaagcaaataaaggagtctcataaa
gaatctgctacaaatgtaacatttgattataaggaacttgcacccatttttgaaggtgtt
gaagaaaaacaaattaaagcactatcaaaccaactggaacatataaaatcgtttaagaca
gattacgactcaaggctcaataagtatgctcgcgatttttactatttttccagtgcattt
gcaattaactgggaggatttactaaaaaactatcaggaaataagagcttccattaaagat
tacgatgacttattgcgagaaattaaagagttaatcataagtcgtaataaatcattagag
gataaaaggactttatttgataacaaaagggacaattggaatagtatagaagtgcaggat
gaagtaaatgcattgaatgcgaaaattgtcgattgtgatgataaaatacgttctaagctt
actattgttcgaaataatagacttgagaatcaatataaagacgataaaaacatcagtgac
gcgatgcgtaatattctggattggttcgaacggtatcccgatattgtacaaaatataacc
caggcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
