Ficedula albicollis (collared flycatcher): 101816311
Help
Entry
101816311 CDS
T02815
Name
(RefSeq) hornerin-like
Organism
fab
Ficedula albicollis (collared flycatcher)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reeler
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
101816311
NCBI-ProteinID:
XP_005050466
LinkDB
All DBs
Position
8:21900693..21953814
Genome browser
AA seq
1010 aa
AA seq
DB search
MPTHQHSVDKMRRHSCFVFLFCGIFLPGILGFPQTNTSIDCDSLLPNYEAEPQTSAPPYI
IAVSFDNFEPGNEVQVTLEALGDAGFRGFNLQAREIDGDVPVGTFKITDPNTKGLECHNM
TNSAVSHANSDVKQKVTTTWIAPHDVEELQFIATVVQNLENFWVGIQSKTLTPTHSESVN
ATGKSKRKLMIELECNKRGGTYSTGRCIMVGPSSSSQNSYSSNQGGVVYTISKSGCGPGG
AAGAYGSHACRDSASLSSSGLTYGQSVPSSSSDSSKKVVVVANSNPFPPVRHTFPQSLGS
SATRIIVQSGQKQQTSSSTYIQGSQGSQSYGQVYRPQGGSSYGQGYQPQGGSSYGQGGPS
YSGSSSSSYGQGSQGSQSYGQGSQPQGGSSYGQGYQPQGGSSYGQGGPSYSGSSSSSYGQ
GSQGSQSYGQQGGSAAYFGSSGCGQGTSYDSNPCHQGGSQGGQQSGSSSSQNYGDNQDGS
YSQNYGGGQGGSSSDTYYDNQESQDSSYDNNPNACDDNDSTYSSNSQRSGCAKKKVVARD
TSHVLSRRAYDVQNASSPSNSSHSDVQGGSFIATSGSSNQGGCICPDGSSGHRQGAPGSS
YSTYSGNQGGPFFYPGGSYGQGGPSSSHSSYSGNQGGPSYYPGGSYGQGGSSSYDGSSES
YGQGGSSVYSGSDTFGQDSASMGVSETEDSDSSSPSGSRQSERDFYSPGGSQSGGHGSSS
QSGSYSSGQDSYSSGSSQYGGQGSPSSGGSQSGGQGGCDCSGANSGGSSTLVRSDSSAND
SSSSGGSQYNSQDSYSSGASQYGGHESSSYGGSQYGGQGSPSSGGSQYGGQGSPSSAGSQ
YGGQGPYFPGGSHYGGQGIASSGSSQYSGQGFSSGVRQSGGQGGCVCPGGGSGSFAGTNY
HGGQGSYPGSNQYGGQGSYPSGSNQYGGQGSYPSGGRQPGKPGSSSSGGSHQGKPGGSGS
GSTYSGKPQSPYSGGSQVSSAGKHSTPQLLMLFSVLSAFALSAAVSKWSI
NT seq
3033 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcccacgcatcagcactcggtcgataagatgaggagacactcctgctttgtttttttg
ttctgtgggatatttttgcctggaatccttggttttccacagacaaatacctcaattgat
tgtgattctctgttaccgaactatgaagctgaaccacagacatctgcaccaccatatatt
attgctgtatcttttgataactttgaaccaggaaatgaagtacaagtcactctagaagca
cttggagatgctgggtttagaggatttaatctacaagctcgagaaatagatggagatgtt
cctgttggtacttttaaaattacagatccaaacactaaaggcttggaatgtcataacatg
acgaattcagcagtaagtcatgccaattcagatgtgaaacagaaggttacaacaacatgg
attgctccacatgatgttgaagagcttcagtttattgcaactgttgttcaaaatctggag
aacttttgggtcggaattcaaagcaaaactctcacacctacgcattctgagtcagttaat
gcaacaggaaaaagtaaaaggaagcttatgatcgaattagaatgtaacaagcgtggaggg
acttactcaacaggccgatgcatcatggttggaccttccagttcctctcagaacagttac
tcaagcaatcagggcggagtagtctacacaataagcaagagtggatgtggccctggaggt
gctgctggtgcatatggctcccatgcctgcagagatagtgcatccttatccagcagtggt
cttacttatggccagtctgtcccttcaagcagttcagattccagtaagaaggtagtggtc
gttgccaacagcaacccttttccacctgtgcgtcacaccttccctcagagtttgggaagc
tctgctacaaggatcatagtacagagtggacaaaaacagcaaaccagcagcagtacttat
atccagggttcccaaggcagccagtcctatggtcaggtgtacagacctcaaggtggcagt
tcctatggccaggggtaccagcctcaaggtggcagttcctatggccagggtggaccaagt
tactcaggcagcagcagcagctcctatggccagggttcccaaggcagccagtcctatggc
cagggctcccagcctcaaggtggcagctcctatggacaggggtaccagcctcaaggtggc
agttcctatggccagggtggaccaagttactcaggcagcagcagcagctcctatggccag
ggttcccaaggcagccagtcctatggccagcagggtggatctgctgcttattttggcagc
agtggctgtggacaaggtacctcctatgatagcaatccctgccatcagggtggatcacag
ggtggtcagcagagtggatcatcatcctcccaaaattatggtgacaaccaggatggatcc
tactcacaaaactatggtggtggccaaggtggatcatcctcagacacctattatgataac
caggagtcacaagattcctcatatgataataatcctaatgcttgtgatgataatgacagt
acctacagttccaatagccagcgttctggttgtgcaaagaagaaagttgttgcccgagac
acatcacatgttttaagcagaagagcctatgatgtacagaatgcatcttctccttcaaat
agcagccattctgacgtgcagggtggatcatttattgcaaccagtggatcaagtaatcag
ggtggttgcatttgtcctgatggaagcagtggtcacagacagggagccccaggttcttca
tacagcacatattctggtaaccagggagggcctttcttctatcctggaggatcctatgga
cagggcggcccaagttcttcccacagctcttactctggtaaccagggagggccttcctac
tatcctggtggatcttatggacagggagggtcttcttcttatgatggcagcagtgaatcc
tatggtcagggtggatcttctgtgtatagtggttctgacacttttggccaggattcagct
tccatgggagtcagtgaaactgaagatagtgattcctcctcaccgtctgggagccgccag
agtgaacgggatttttattccccaggaggcagccagtcaggtggacatggatcatcttct
caaagtggtagttactccagtggacaggactcatactcatctggaagcagccagtatggt
gggcagggttcaccttcctcaggaggcagccagtctggtggacagggtggatgtgattgt
tctggggcaaattctggcggatcctctactttagtcaggagtgattcctctgcaaatgac
tcatcttcttctggaggcagccagtacaacagccaggattcatattcctctggagctagc
cagtatggaggacatgagtcatcttcttatggaggcagccagtatggtggacaaggttca
ccttcctcaggaggcagtcaatatggtggacagggttcaccttcttcagcaggcagccag
tatggaggacagggtccatatttcccaggtggcagccattatggaggacagggtatagct
tcttcaggaagcagccagtatagtggacagggcttttcttcaggagtcagacagtctggt
ggacagggtgggtgtgtgtgccccggtggaggttcaggctctttcgcaggaaccaactac
catggtggacagggttcatatcctggaagcaatcagtatggtggacagggatcttatccc
tcaggaagcaaccaatatggtgggcagggctcatatccttctggaggcagacaacctggt
aaaccaggttcctcttcctcaggaggcagtcatcaaggaaagccaggtggctctggctca
ggaagcacttactctgggaaaccgcaatcaccttattcaggcggcagtcaagtgagctct
gctgggaaacactccactccccaactcctgatgttattcagtgttttgagtgcctttgct
ctctctgctgcggtatcaaaatggtctatatga
DBGET
integrated database retrieval system