Flavobacterium agricola: K5I29_10140
Help
Entry
K5I29_10140 CDS
T09474
Name
(GenBank) OmpA family protein
Organism
fag
Flavobacterium agricola
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OmpA
TSP_3
OMP_b-brl
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UYW00858
UniProt:
A0ABY6LWY1
LinkDB
All DBs
Position
complement(2041431..2042840)
Genome browser
AA seq
469 aa
AA seq
DB search
MKNLNRLFVASLMLAGTTAAQAQDSNNPWSITFGANAVDGARVSAAGPFGDQFSNYFNAK
DNWSIIPSVSYINVNRYLGDNFSFGLTGSVNKIDKFVNPRLTRPGDYPVENPGDLMYYGI
DGIIKYSFLEVIGTKWFDPYLHIGGGYTFLGDASAGTVNGGIGLSFWFTENVGLTLQSTY
KYSFDDNRTPNVDVATHLQHFAGISFKFGGKDTDGDGIYDKDDACPDVPGLKEFNGCPDT
DGDGIPDKDDKCPYDFGPKELQGCPDRDGDGIIDIEDACPDVPGLAIYNGCPDTDGDGVP
DNLDKCPDVPGPKENDGCPWPDRDGDGVPDKDDKCPDVPGTVANNGCPEVKEEHIKKLNQ
YGKTILFNTGKYTFQSQSLPILDSMVEIFKEYPNSHFRIEGYTDSTGGDALNLRLSKERA
AAVVNYLVEHGIDADRLTSEGFGKADPVASNKTARGRAENRRVEVKLVK
NT seq
1410 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaatctaaacagattatttgtagcttccttaatgttagctggtacaacagcagca
caggctcaggattcaaacaatccttggtctataacatttggggctaacgcagtagacgga
gctcgagttagcgctgctggtccatttggagaccaattctctaactattttaatgctaaa
gacaactggagcattattccttcagtttcttacattaatgttaatagatacttaggagat
aatttctctttcggacttacaggatctgttaacaaaatcgacaaatttgttaatccaaga
ttaactagacctggagattacccagtagaaaatcctggtgatttaatgtactacggtatc
gacggtatcattaaatatagcttcttagaagttattggtacaaaatggttcgatccatat
ttacacattggtggggggtacacattcttaggtgatgcttctgcaggaactgtgaatggt
ggtattggtttatctttctggtttactgaaaatgttggtttaacattacaatcaacgtac
aagtattcatttgatgataacagaacaccaaatgttgacgtagctacgcacttacaacac
tttgctggtatctctttcaaatttggaggtaaagatactgacggagatggtatttatgat
aaagatgatgcttgtccagatgtaccaggtttaaaagaattcaacggatgtcctgataca
gacggtgatggaattcctgataaagatgacaaatgtccatacgactttggtccaaaagaa
ttacaaggttgtccagatagagatggtgacggaatcattgatatcgaagatgcttgtcca
gacgttccaggtttagcaatctacaacggttgtcctgatacagacggtgacggtgtgcct
gataatttagacaaatgtccagatgtacctggtccaaaagaaaatgacggatgtccttgg
ccagatagagatggtgacggtgtgccagataaagatgacaaatgtccagacgttcctgga
actgtagctaacaacggttgtcctgaggttaaagaagagcatattaaaaagttaaatcag
tacggtaaaactatcttatttaacactggtaaatatactttccaatctcaaagtttacca
atcttagattctatggttgaaatctttaaagagtaccctaattctcatttcagaatcgaa
ggttatacagattcaactggtggtgatgcattaaacttaagactttctaaagaaagagct
gcagctgtagttaactacttagtagagcacggtattgatgctgatcgtttaacttcagaa
ggatttggtaaagcagatccagttgcttctaacaaaactgctagaggtagagctgaaaac
agacgtgttgaagttaagttagtaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system