Flagellimonas alginilytica: ABTP35_02205
Help
Entry
ABTP35_02205 CDS
T11189
Name
(GenBank) alpha-amylase family glycosyl hydrolase
Organism
faj Flagellimonas alginilytica
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
Por_Secre_tail
CBM_48
DUF8578
AMPK1_CBM
TSP_3
SprB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XHB42076
LinkDB
All DBs
Position
complement(499031..502393)
Genome browser
AA seq
1120 aa
AA seq
DB search
MKKLILLGFLLSITTFWAQVTIEPFPFAVDEQITITVDLNSNATDCNGLADPNKVYLHSG
IGTNIDPWATVVGNWGQDDGVGEMSDNGNGTWSITFVPEDYYGLTPEQADNATRMGMVFR
NALGSQELKANGCNDFFFDVGSFQMELTNPTTSLTVLNPGENLVISATSSVEAEFTLTIN
GNITDSFNGVEYNFDHTNITENSQYVLEAESEGETRTENFMVVVNIEEQAVPNGMQDGIN
FDPNDDTSATLVLYAPGKEVVHVVGDFNNWTPNDAYLLKKDSYQDRFWIELTGLTPQFDH
MYQYLVDGEITIADPYSTLILDENNDSYIDNITYPDLPAYPSGQTEHAVTVLKTGQPTFN
WQNDGVELPSKTDLVVYELLIRDFDQLHSFDAVRNRLDYLQGLGVNAIELMPVSEFDGNE
SWGYNPSFHMALDKYYGTANAFKQLVDECHGRGMAVIVDVVFNHASGQNPFYRLWNTDNG
GYGGSAAGDNPFFNEEATHAYSVFNDFDHGQQATKDYVKRVSQYWISEYNLDGFRWDLTK
GFTQNCSASDEACTGAYQADRVAVLKEYADYQWEIKEDFLVIFEHLGTNEEETEWAEYRL
EEGKGIMLWSNLNVSYSEASMGWNNNSDFSWVSYLNRNWSAPSNISYMESHDEERMMYRN
LNFGNASGDYNIQQISTGLDRLELAGAFFFTVPGPKMIWQFGELGYDYSIDYNGRTGNKP
ILWEYFNDPDRKNVYDTWSKLNLLAVEEPIFETMDFALDADNESGLKTIHLTNASAGEGE
IGYVVIVGNFDVQEQAIDPKFQETGVWYEFLENNLKHVVVNVNEPMVLAPGEYRIFGNNP
SGLFPNDNPPDADSDGVLDANDLCPNTTLGAVVNVDGCEVFSLPEDNFTVLTQSETCRGS
DNGSISVSALQTLAYTATLSGNSEATVNFENEVVFENLSAGNYQLCITVAGQSDYQQCYT
LTVTEPQSLEVYSSLNKNDNILSLELKGADFYNIQINDEVHLTTQESFKLKLSQSVNKLK
VLTNKDCQGLFEVTFILTDKAMAYPNPMVDASSVSVDLGFDTNEKLNVQVFDLNGKLHLS
RTMETNFGKLDIDLSGYANGMYLIKVAGKETTHEFKIIKQ
NT seq
3363 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaacttatacttttagggtttttgctatccatcacaacgttctgggcccaagtt
accattgagccttttccttttgcggtggatgagcaaataaccataaccgtagatcttaac
agcaatgcgaccgactgcaatggacttgccgatccgaacaaagtatatcttcattccggt
atagggacgaacatcgacccatgggcaacagttgttggaaattgggggcaagatgacggt
gttggagaaatgtccgataacggtaatggaacatggagcatcacatttgttccagaagat
tactatggattaacccctgagcaagctgacaatgcaacccgaatgggaatggttttccgg
aatgcattgggcagtcaagagcttaaggccaatggctgcaacgatttcttttttgatgtt
ggcagctttcaaatggaactgaccaatcctaccacaagtctaaccgtgttaaatccgggt
gagaatttggtaatttccgccacaagttccgtagaggcagaattcacattgaccatcaac
ggaaacataaccgattcctttaatggcgtggaatacaattttgatcataccaatatcacc
gaaaattcacagtatgttttagaagccgaaagcgaaggcgaaacgcgtacggaaaatttt
atggtcgtggttaatattgaagaacaagcagtgcccaacggtatgcaggacggcatcaac
tttgatcccaatgacgatacttcggcaacactcgttttatatgctccggggaaagaggtg
gtgcatgtggtcggagatttcaataattggacacccaatgatgcatatttactgaaaaag
gatagttatcaagatcgattctggatcgagttgaccggattgactcctcaatttgatcat
atgtatcaatacttggtagatggggagattacaattgcagacccttactccacccttatt
ttggatgagaacaacgattcctatatcgataatattacctatccggatttaccagcctac
ccttccggtcaaacagaacacgctgtaactgtactaaaaacaggtcagcctacatttaat
tggcaaaatgatggagtggaactacccagtaaaacggatttggtggtttatgagctgctg
ataagggattttgatcaactgcacagctttgatgccgtacggaataggttggattatctt
caaggactgggtgtaaacgccattgagctgatgcctgtttccgaattcgatggcaacgag
agttgggggtacaatccatcattccatatggcgttggacaaatattatggaacggccaat
gcttttaaacaattggtcgatgaatgccatggaaggggtatggcggtaatcgtggatgtg
gtttttaaccatgcatccgggcaaaacccgttttaccgactttggaacaccgataacgga
ggctatgggggttccgccgcaggggacaatccgttctttaatgaggaggcaacacatgct
tacagtgtttttaacgattttgaccacggtcaacaagcaaccaaggactacgtaaaacgt
gtatcccaatactggatatcggagtataatttggacggttttcggtgggacctgaccaag
ggttttacccagaattgctcagcatccgacgaagcttgtacaggagcttatcaagcggat
agggttgccgtactcaaggaatatgcagattatcaatgggaaatcaaagaggattttttg
gtcatttttgaacatttgggaacaaatgaagaagagaccgagtgggcagaatatcgcttg
gaagaaggtaaaggtattatgctgtggagcaatctaaatgtttcctacagcgaagcttcg
atgggctggaacaataattccgacttctcttgggtgtcctatttaaatcgcaactggagc
gcgccatccaatatttcgtacatggaaagtcatgatgaagaacgcatgatgtaccgcaac
ctgaattttggaaacgcatccggagactacaatatacagcaaatatccacgggcttggac
cgtttggagctggcgggagcttttttctttactgtccccggaccaaaaatgatttggcaa
ttcggtgagttgggatacgattattccatcgattataacggaagaactgggaacaagccc
attttgtgggagtattttaatgacccggatagaaagaatgtttacgatacatggtccaaa
ttaaacttgttggcagtagaggagcccatatttgaaactatggattttgccttggatgcg
gacaatgaatccggattaaaaacgattcatttaaccaatgcctcagccggtgagggcgag
atcgggtatgtggtcattgtagggaattttgatgtgcaggaacaagcaatagatcccaaa
tttcaagaaactggagtttggtacgagtttttggagaataacctaaagcatgttgtggta
aatgtaaacgaaccaatggttctggcaccaggggagtaccgtatttttggaaataaccca
agtgggctttttccgaacgacaaccctcccgatgcagattccgatggggtattggatgcg
aacgacctttgcccgaatacaacattgggagctgttgtgaatgtggacggctgtgaggtt
ttttctctcccagaggacaatttcacggttctgacgcaaagcgaaacctgtcgtggcagt
gataatggaagcatatccgtatctgctttgcaaacacttgcctatacagctacattgtcc
gggaacagtgaggccaccgtcaattttgaaaacgaagtcgtttttgagaatttatccgca
ggtaactatcaactgtgcattactgttgcaggccaatctgattaccagcaatgctacacc
ttgacagtcacagaaccacaatccttggaagtatattcaagtttgaacaagaacgataat
atactttccttggaattaaaaggcgccgatttttacaacatacaaatcaatgatgaagtc
catcttaccacacaggaatcatttaaacttaaattgagtcaatcggtaaacaaattaaag
gtccttacaaataaagattgtcagggattgtttgaggttacctttatcctaacagataag
gccatggcctatcccaacccaatggtagatgcaagctcggtatctgtagatttgggcttt
gatacgaatgaaaaattgaatgttcaggtattcgatctcaatgggaaattacatctatcc
agaacaatggaaaccaattttggtaaactggatatcgatctctccggatatgccaatggg
atgtaccttattaaagtggctggcaaggaaactacacacgaatttaaaattataaaacaa
tga
DBGET
integrated database retrieval system